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正文內(nèi)容

分子對接技術(shù)與共有藥效基團比對法doc(編輯修改稿)

2025-08-11 05:06 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 準(zhǔn),候選化合物與靶蛋白的結(jié)合排列方式只有與共性結(jié)構(gòu)一致,才有可能具有多靶點作用,這樣一來,待研究的化合物便被限制在了一個很小的范圍內(nèi),這無疑將大大降低篩選所需的時間?;谶@樣的思路,本文的作者設(shè)計了這樣一套多靶點抑制劑的研究策略,其基本步驟如下:(1) 通過各個靶蛋白的結(jié)構(gòu)獲得各個靶蛋白的藥效基團模型(2) 若共有藥效集團存在,通過比對多個靶蛋白的藥效基團模型將其確定(3) 利用快速分子對接技術(shù)找出能與某一靶蛋白結(jié)合的分子,比較其與靶蛋白的結(jié)合排列是否和共有藥效基團一致,如是,則將這一化合物歸入候選庫(4) 利用更為嚴(yán)格的分子對接確認(rèn)化合物與其它靶蛋白的結(jié)合性,再次比較其與靶蛋白的結(jié)合排列是否和共有藥效基團一致,如是,化合物則繼續(xù)保留待選(5) 進行實際藥理篩選實驗驗證化合物是否真有多靶點作用 本文的作者正是通過這一方法于茫?;衔飵熘姓业搅四芡瑫r抑制LTA4Hh及hnpsPLA2兩種與炎癥反應(yīng)有關(guān)的酶,從而高效抑制炎癥反應(yīng)的活性化合物。下面,我將作者的研究整理為一份簡要的實驗報告,以便對整個設(shè)計方法有更清晰的認(rèn)識。分子對接技術(shù)與共有藥效基團比對法聯(lián)用尋找同時抑制LTA4Hh及hnpsPLA2的化合物【實驗背景】:人體的炎癥反應(yīng)是由一個復(fù)雜的生物效應(yīng)網(wǎng)絡(luò),其中的一些關(guān)鍵酶調(diào)控著致炎物質(zhì)的合成與釋放,是抗炎癥藥物研究的重要靶點。LTA4Hh、hnpsPLA2即是這樣兩個關(guān)鍵的酶,前者可以將白介素A4羥化為致炎物質(zhì)白介素B4,而后者則能破壞細胞膜磷脂層而釋放致炎物質(zhì)花生四烯酸。因此能同時抑制這兩種酶的化合物將很有希望成為高效的抗炎藥物。本實驗將采用一種全新的策略,將分子對接技術(shù)與共有藥效基團聯(lián)用,從而高效經(jīng)濟地找到這些活性化合物?!緦嶒炑b置】數(shù)據(jù)庫:PDB數(shù)據(jù)庫(生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫)、MDL數(shù)據(jù)庫計算機軟件:Pocke
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