代謝組學(xué)小常識(shí)(編輯修改稿)
2025-07-21 15:07 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 考察的方法QC樣本的制備： 混合相同體積的所有待檢測樣本，然后按照與待測樣本相同的前處理方法來處理QC樣本，之后進(jìn)樣進(jìn)行LCMS分析。 樣本檢測時(shí)，通常在檢測最開始運(yùn)行幾次QC樣本，之后根據(jù)樣本量的大小在每檢測幾個(gè)樣本之后檢測一次QC樣本。方法學(xué)考察：方法一：最早使用的一種方法，從QC樣本的總離子流圖中選擇具有代表性的離子峰（覆蓋不同的保留時(shí)間，不同的強(qiáng)度），在對(duì)QC樣本進(jìn)行重復(fù)檢測之后，計(jì)算這些離子的保留時(shí)間以及峰面積的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差（RSD），用以考察分析方法的穩(wěn)定性以及重復(fù)性。方法二：所有樣品檢測完之后，收集所有的QC樣本的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理，包括（峰提取，排列，歸一化等），經(jīng)過數(shù)據(jù)過濾（80%規(guī)則）之后，計(jì)算剩下的峰的峰面積的RSD值。通常如果在一個(gè)樣本中有超過70%的化合物的RSD值小于等于30%，則證明該方法有良好的穩(wěn)定性以及重復(fù)性，所得到的數(shù)據(jù)可靠（也有不同的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)，比如要求LCMS數(shù)據(jù)小于20%，GCMS數(shù)據(jù)小于30%等）。圖中柱形圖表示化合物在不同RSD范圍內(nèi)的百分比分布，折線圖表示在不同RSD范圍的累計(jì)百分比。方法三：原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)預(yù)處理之后，將所有樣本（包括QC樣本）進(jìn)行PCA分析，在得分圖中觀察QC樣本的聚集程度。由于QC樣本是 等量混合了所有的被檢測樣本，理論上QC樣本包含了所有樣本中的代謝物，因此QC樣本理論上會(huì)分布在原點(diǎn)周圍。圖中QC樣本緊密聚集，證明方法穩(wěn)定，重復(fù)性良好。方法四：采用混合標(biāo)準(zhǔn)品作為QC，該QC通常包含不同物理化學(xué)性質(zhì)的體內(nèi)和體外代謝物（使所選擇的化合物具有代表性）。檢測結(jié)束后，計(jì)算這些化合物的保留時(shí)間以及峰面積的RSD用以對(duì)分離分析方法進(jìn)行評(píng)價(jià)。代謝組學(xué)研究中需要了解的質(zhì)譜知識(shí)（一）主要介紹以液質(zhì)聯(lián)用為分析工具的代謝組學(xué)研究中的常見問題：1)在分析樣本時(shí)，要選用什么質(zhì)譜？2)質(zhì)譜儀中通常按照質(zhì)量分析器以及聯(lián)用方式
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