【文章內(nèi)容簡介】
: Number輸入樣本的重復(fù)數(shù)。Horz or Vert 選擇重復(fù)樣本的排列方式,橫排還是豎排。Auto Select: Next ID 樣本編號自動遞增Next Dil 稀釋濃度自動遞增。Filling:Horz or Vert 選擇不同樣本間的排列方式,橫排還是豎排。在Standard中,除了要進行排布以外,還需要進一步輸入標準品的濃度和稀釋關(guān)系。Incr:表示每點之間+多少濃度Fact:表示每點之間多少倍濃度布好的平板圖如下:實驗不同酶標板的排布也不盡相同,實驗人員應(yīng)按照實驗的需求對酶標板進行排布。當樣品排布好之后點擊OK,向?qū)Ь`提示這一步結(jié)束,點擊Next進入下一步。第三步:數(shù)據(jù)分析設(shè)置雙擊Data Reduction下方的彩色圖標進入數(shù)據(jù)分析設(shè)置界面,該界面為您提供Transformation、Well Analysis、Curve Analysis、Cutoff、Validation、Polarization 幾個功能模塊可供選擇。1 Transformation:雙擊 按鈕,出現(xiàn)Transformation設(shè)置界面Data In :選擇下拉列表中選擇要進行賦值的數(shù)據(jù),如果有多個數(shù)據(jù)需要,點擊下方 按鈕,進行多重的賦值New Data Name:輸入公式計算后數(shù)據(jù)輸出所用的名稱Formula:輸入需要計算的公式,如上圖:分別讀取390和540的吸光度值,別將這兩種數(shù)據(jù)賦值為DS1和DS2,公式計算DS1/DS2,將計算值命名為Ratio。如果公式適用于所有孔,則勾選 Use single formula for all wells, 則所有的孔都進行相應(yīng)的公式計算;如果只對單獨的孔進行計算,則不需勾選Use single formula for all wells,輸入公式后雙擊下方的96孔板示意圖中相應(yīng)的孔,公式自動對相應(yīng)孔進行計算。選擇Deference Between Rows或Deference Between Column 可以進行行間或列間的差值計算。 Gene5同時提供了多重公式計算的功能,如果你還需要對全部的樣品或部分樣品進行公式計算,則可以再次雙擊按鈕,進行再一次的賦值計算,直到完成全部計算任務(wù)。點擊OK保存設(shè)置。2 Curve Analysis:雙擊按鈕,進入曲線分析界面Curve Name:輸入曲線的名稱Data In:選擇曲線中X、Y軸相對應(yīng)的數(shù)值Curve Fit:Curve Fit Method 選擇曲線類型;X Axis Data 、Y Axis Data:選擇軸的線性關(guān)系lin 或者log;Extrapolation Factor:外推因子,對超出標準濃度的樣本進行推算Data Out:Concentrations 定義計算值的名稱;Interpolations在該對話框內(nèi)。您可以定義最多25個Y值(公式、數(shù)字),其對應(yīng)的X值(濃度)就會被計算出來,并顯示在標準曲線上。每次設(shè)置結(jié)束點擊OK保存設(shè)置3 Cutoff:雙擊圖標,進入臨界值設(shè)定界面Data In 選擇要進行分類的數(shù)據(jù)。Symbols 輸入分類顯示的標識。Cutoffs 輸入臨界值,臨界值可以是數(shù)字,也可以是公式或者孔符號。但是必須是升序排列。進行分類的數(shù)據(jù)首先和第一個分類的標準()進行比較,如果小于第一臨界值就表示為LOW,如果大于等于第一個臨界值則表示為“HIG”,其他依次類推,可以設(shè)定不同級別的分類標準。4 Validation:雙擊圖標,進入檢驗值設(shè)置界面Validation是一系列的判斷標準,用來評估獲得的數(shù)據(jù)是否適宜進行后面的計算,Gene5可定義多達50個檢驗標準。讀板完成后,查看每個檢驗標準的檢驗情況(根據(jù)實驗結(jié)果在以下三個對話框中填入信息):Valid Text 條件匹配 Invalid Text 條件不匹配,計算的結(jié)果可信度不高。Unable to Evaluate Text 如果選擇的數(shù)據(jù)不能確定時,可能會出現(xiàn)這種情況。設(shè)置成功后點擊OK,向?qū)Ь`提示這一步結(jié)束,點擊Next進入下一步。軟件提示你選擇對得到的結(jié)果進行何種方式的輸出,根據(jù)需要進行選擇第四步 構(gòu)建報告模板雙擊按鈕進入構(gòu)建數(shù)據(jù)報告模板界面1 在左側(cè)列表中選擇要輸出的原始數(shù)據(jù),點擊Add,添加到右側(cè)的列表欄中,點擊Remove可以移去右側(cè)列表中多選的或者不需要的數(shù)據(jù)2 選擇Header或Footer設(shè)置報告的頁眉或頁腳3 點擊按鈕,可以預(yù)覽模板4當全部設(shè)定好后,點擊OK 精靈向?qū)崾揪幊坛晒c擊Finish結(jié)束編程。第五步 保存程序點擊File Save As 選擇相應(yīng)的路徑,輸入程序名稱,保存程序以上五步由向?qū)е敢瓿闪艘粋€Protocol的全部設(shè)置,這五個步驟可以根據(jù)實驗的要求進行個性化的組合,使程序的設(shè)置滿足實驗的要求第六步 進行一次實驗1 點擊工具欄中圖標,打開一個新的實驗,彈出程序選擇對話框2 在相關(guān)目錄下選擇已經(jīng)保存好的Protocol,打開該Protocol3 彈出該程序所對應(yīng)的檢測項目,這時如果需要改變,可以點擊上方工具欄中對應(yīng)的彩色圖標,進行修改,直到滿意為止4 讀板,單擊按鈕,彈出讀板對話框,輸入相關(guān)的信息后點擊Read,開始讀板。Read 讀板ReRead 二次讀板,將覆蓋上次的讀數(shù)結(jié)果Enter Manually 手動輸入檢測值Read From File 可以導入其它文件讀數(shù)Simulate Read 在沒有連接酶標儀的情況下模擬讀板過程和數(shù)據(jù)讀數(shù)結(jié)束點擊 File Save As 選擇相應(yīng)的路徑,輸入實驗名稱,保存實驗數(shù)據(jù)通過以上的設(shè)置和運行,完成了一次基本的實驗過程總結(jié)過程如下使用向?qū)Ь`進行程序編輯和讀板的全流程1 點擊向?qū)Ь`圖標2 對程序每一個步驟進行設(shè)置3 全部設(shè)定好之后,點擊Next進入下一步,程序進行校驗4 選擇File Save 保存程序,并給程序命名5 選擇File New Experiment