生物信息學原理與方法第九講蛋白質(zhì)序列分析與預測(編輯修改稿)
2025-02-12 11:21 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 庫進行搜索 。 46 FingerPRINTScan 對 PRINTS 數(shù)據(jù)庫進行蛋白質(zhì)指紋搜索 。 47 FPAT 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的表達搜索 。 48 PRATT EBI 及 ExPASy的識別蛋白質(zhì)保守模式 49 PPSEARCH EBI的對 PROSITE進行序列搜索 。 410 PROSITE scan – PBIL的對 PROSITE進行序列搜索 。 411 PATTINPROT 在 PBIL搜索一段蛋白質(zhì)序列或蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的模式 。 412 SMART – EMBL的簡單分子結(jié)構(gòu)研究工具 。 413 TEIRESIAS IBM的從不匹配的 （ unaligned） 蛋白質(zhì)或 DNA序列生成蛋白質(zhì)模式 。 414 Hits – 蛋白質(zhì)序列與 motifs的關(guān)系 。 modification prediction 翻譯后修飾預測 51 ChloroP 葉綠體轉(zhuǎn)換肽的預測 。 52 LipoP Gram陰性細菌脂蛋白質(zhì)和信號肽的預測 53 MITOPROT – 預測線粒體的目標序列 。 54 PATS –預測 apicoplast的目標序列 55 PlasMit 預測 Plasmodium falciparum的線粒體轉(zhuǎn)換肽 56 Predotar –預測線粒體和質(zhì)體的目標序列 57 PTS1 –預測 peroxisomal targeting signal 1 containing proteins 58 SignalP – 預測信號肽剪工切位點 。 59 NetOGlyc – 預測哺乳動物粘蛋白的糖化位點 。 510NetNGlyc – 預測人類 N型蛋白質(zhì)糖化位點 。 511DictyOGlyc – 預測粘菌 O型蛋白質(zhì)糖化位點 。 512YinOYang 真核生物蛋白質(zhì)序列的 ObetaGlcNAc的粘附位點 。 513bigPI Predictor 預測 GPI的修飾位點 514DGPI 預測 GPI的錨合點和剪刀切位點 (鏡像站 )。 515NetPhos 預測真核生物蛋白質(zhì)上 Ser, Thr 及 Tyr phosphorylation位點 。 516NetPicoRNA 預測 picornaviral proteins上蛋白質(zhì)剪切位點 。 517NMT –預測 Nterminal Nmyristoylation 518Sulfinator – 預測酪胺酸硫化位置 。 519 SUMOplot – 預測 SUMO蛋白質(zhì)附著位置 。 prediction 空間結(jié)構(gòu)預測 61PSORT – 預測蛋白質(zhì) 次細胞的位置 。 62TargetP 預測蛋白質(zhì) 次細胞的位置 。 63DAS 利用 Dense Alignment Surface法預測原核生物的跨膜區(qū) 。 64HMMTOP 預測蛋白質(zhì)的跨膜螺旋及空間結(jié)構(gòu) 。 65PredictP
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