生物信息學(xué)原理與方法第九講蛋白質(zhì)序列分析與預(yù)測(cè)(編輯修改稿)
2025-02-12 11:21 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 庫(kù)進(jìn)行搜索 。 46 FingerPRINTScan 對(duì) PRINTS 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白質(zhì)指紋搜索 。 47 FPAT 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的表達(dá)搜索 。 48 PRATT EBI 及 ExPASy的識(shí)別蛋白質(zhì)保守模式 49 PPSEARCH EBI的對(duì) PROSITE進(jìn)行序列搜索 。 410 PROSITE scan – PBIL的對(duì) PROSITE進(jìn)行序列搜索 。 411 PATTINPROT 在 PBIL搜索一段蛋白質(zhì)序列或蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的模式 。 412 SMART – EMBL的簡(jiǎn)單分子結(jié)構(gòu)研究工具 。 413 TEIRESIAS IBM的從不匹配的 （ unaligned） 蛋白質(zhì)或 DNA序列生成蛋白質(zhì)模式 。 414 Hits – 蛋白質(zhì)序列與 motifs的關(guān)系 。 modification prediction 翻譯后修飾預(yù)測(cè) 51 ChloroP 葉綠體轉(zhuǎn)換肽的預(yù)測(cè) 。 52 LipoP Gram陰性細(xì)菌脂蛋白質(zhì)和信號(hào)肽的預(yù)測(cè) 53 MITOPROT – 預(yù)測(cè)線粒體的目標(biāo)序列 。 54 PATS –預(yù)測(cè) apicoplast的目標(biāo)序列 55 PlasMit 預(yù)測(cè) Plasmodium falciparum的線粒體轉(zhuǎn)換肽 56 Predotar –預(yù)測(cè)線粒體和質(zhì)體的目標(biāo)序列 57 PTS1 –預(yù)測(cè) peroxisomal targeting signal 1 containing proteins 58 SignalP – 預(yù)測(cè)信號(hào)肽剪工切位點(diǎn) 。 59 NetOGlyc – 預(yù)測(cè)哺乳動(dòng)物粘蛋白的糖化位點(diǎn) 。 510NetNGlyc – 預(yù)測(cè)人類 N型蛋白質(zhì)糖化位點(diǎn) 。 511DictyOGlyc – 預(yù)測(cè)粘菌 O型蛋白質(zhì)糖化位點(diǎn) 。 512YinOYang 真核生物蛋白質(zhì)序列的 ObetaGlcNAc的粘附位點(diǎn) 。 513bigPI Predictor 預(yù)測(cè) GPI的修飾位點(diǎn) 514DGPI 預(yù)測(cè) GPI的錨合點(diǎn)和剪刀切位點(diǎn) (鏡像站 )。 515NetPhos 預(yù)測(cè)真核生物蛋白質(zhì)上 Ser, Thr 及 Tyr phosphorylation位點(diǎn) 。 516NetPicoRNA 預(yù)測(cè) picornaviral proteins上蛋白質(zhì)剪切位點(diǎn) 。 517NMT –預(yù)測(cè) Nterminal Nmyristoylation 518Sulfinator – 預(yù)測(cè)酪胺酸硫化位置 。 519 SUMOplot – 預(yù)測(cè) SUMO蛋白質(zhì)附著位置 。 prediction 空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 61PSORT – 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì) 次細(xì)胞的位置 。 62TargetP 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì) 次細(xì)胞的位置 。 63DAS 利用 Dense Alignment Surface法預(yù)測(cè)原核生物的跨膜區(qū) 。 64HMMTOP 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的跨膜螺旋及空間結(jié)構(gòu) 。 65PredictP
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