【文章內(nèi)容簡介】 ? 分節(jié)段 RNA病毒基因組 的重組 – 是不同親代病毒產(chǎn)生的后代核酸各個分子間交換 ，即 子代核酸節(jié)段隨機分配構(gòu)成重組的子代病毒，從而使子 代基因組發(fā)生改變，亦稱 重配（ reassortment）， 發(fā)生 頻率高；如流感病毒。 A、 重組 與 重配 （基因間相互作用） ? 重組 rebination ? 重配 reassortment B、 基因整合 ： 病毒進(jìn)入細(xì)胞后，核酸整合，不產(chǎn) 生子代病毒。 C、 裝配異常 A、 未裝 進(jìn)核酸的空殼 B、 裝進(jìn) 宿主細(xì)胞的核酸 基因復(fù)活 ? 交叉復(fù)活 ? 多重復(fù)活 ? 交叉復(fù)活 （ Crossing reactivation） – 活病毒與滅活病毒間，也稱 Marker rescue – 流感 A2株與滅活 A1株共同培養(yǎng)，可得到有 A1抗原性的A2毒株 ? 多重復(fù)活 （ Multiplicity reactivation） – 滅活病毒間， 兩種或兩種以上同種病毒感染同一細(xì)胞時，經(jīng)過基因重組出現(xiàn)有活的、感染性子代病毒。 基因產(chǎn)物的相互作用 ? 互補作用（ Complementation） ? 病毒基因組與細(xì)胞染色體 DNA整合（ integration） ? 表型混合 （ Phenotypic mixing） 表型混合 ? 兩株病毒 共同 or混合 感染 時， 裝配 過程發(fā)生錯誤而交換蛋白衣殼，不換核酸，從而導(dǎo)致發(fā)生一些生物學(xué)特征改變。 ? 主要表現(xiàn)為耐藥性、抗原性等改變，基因并未改變，改變的生物學(xué)性狀 不能遺傳 virus A virus B phenotype mixing virus A virus B 分子遺傳學(xué) ? 病毒基因組分析 – 病毒核苷酸測序 ： ? 基因結(jié)構(gòu) ： ORF ? 基因功能 ：表位：變異、耐藥、 – 研究手段 ：點突變、缺失、置換、敲出、比對 ? 病毒保護(hù)性抗原表位的確定 ? 病毒抗原高變區(qū)分析 ? 毒力相關(guān)基因編碼區(qū)分析 ? 耐藥性變異分析 ? 作用于病毒蛋白質(zhì)的某些細(xì)胞蛋白的研究 病毒基因組學(xué) 微生物基因組學(xué) (Genomics)是利用全基因組 DNA序列研究微生物基因及其功能的學(xué)科。 近年來，由于 DNA測序自動化與信息技術(shù)的飛躍發(fā)展，用 1～ 2月時間就可完成一種微生物的全基因組序列測定。 自 1995年美國首次將第一個原核細(xì)菌 — 流感嗜血桿菌的全基因組序列公布以來，目前（截止到 2022年4月 4日）至少已有 75種病原菌的全基因組測序已告完 成，另有超過 20多種病原菌的全基因組測序正在進(jìn)行，數(shù)以萬計的病原菌基因?qū)⒈昏b定出來。 病毒的核酸 是決定病毒的感染性 、 復(fù)制特性 、遺傳性的基礎(chǔ) 。 隨著病毒基因克隆 、 序列分析及基因表達(dá)等技術(shù)的應(yīng)用 ， 目前幾乎對所有病毒科的代表病毒進(jìn)行了基因克隆 與 核苷酸測序 。 病毒 基因的序列 對于了解可能編碼的病毒蛋白的數(shù)量和性質(zhì) 、 病毒基因復(fù)制和表達(dá)的調(diào)控機制具有重要意義 。 從 DNA序列數(shù)據(jù)庫查詢 HBV DNA序列 ： NCBI National Center for Biotechnology Information EMBL European Molecular Biology Laboratory） DDBJ DNA Data Bank of Japan 微生物基因組序列測定的意義 獲得微生物全基因組序列是認(rèn)識微生物完整生物學(xué)功能的基礎(chǔ) 。 完整的基因組序列資料有助于更精確地研究微生物的形態(tài)發(fā)生 、 生長代謝 、 遺傳變異 ， 鑒定有關(guān)的毒力及致病基因 、 抗微生物藥物作用的靶位 ，為研制和發(fā)展特異的診斷試劑和疫苗提供參考 。 五 、病毒的分類 （ Classification of Viruses） ? 根據(jù)生物學(xué)和理化學(xué)特性分類，按 科（ family）（ 亞科 subfamily）、 屬（ genus）、 種（ species） 分類 ? 1995年國際病毒分類委員會將動植物病毒4000余種分為 71科、 11亞科、 164屬 ? 根據(jù)組織親嗜性分類 – 對臨床有實際意義 微生物的命名法 ? 細(xì)菌：拉丁雙名法 – 屬在前，第一個字母大寫，種在后，小寫。均斜體 ? Staphylococcus aureus ? Escherichia coli ? 病毒 – 科（ family）、 亞科（ subfamily）、 屬（ genus） ? 斜體，第一個字母大寫 ? Herpesviridae， Enterovirus – 種（ species） ? 不大寫，不任何，如 poliovirus 生物學(xué)分類原則 （ Basis of Classification） ? 核酸 類型 和 結(jié)構(gòu) – （ RNA/DNA, ds/ss, linear/circular, fragment /nofragment) ? 病毒體 形狀 和 大小 ? 病毒體 形態(tài) 結(jié)構(gòu) ? 對 脂溶劑 敏感性 DNA viruses dsDNA, Presence of an envelope – Poxviridae （ 痘病毒科 ） – Herpesviridae （ 皰疹病毒科 ） dsDNA, absence of an envelope – Adenoviridae （ 腺病毒科 ） – Paproavairidae （ 乳多空病毒科 ） ssDNA, absence of an envelope – Paraoviridae （ 細(xì)小病毒科 ） ? dsRNA， fragments， absence envelope Reoviridae（ 呼腸病毒科 ） Birnaviridae（ 雙 RNA病毒科 ） ? ssRNA, no fragment , Presence envelope Paramyxoviridae （ 副粘病毒科 ） Rhabdoviridae （ 彈狀病毒科 ） ? ssRNA， fragments， Presence envelope Orthomyxoviridae （ 正粘病毒科 ） Bunyaviridae （ 布尼亞病毒科 ） Arenaviridae （ 沙粒病毒科 ） ? +ssRNA, no fragments, absence envelope Picornaviridae（ 小 RNA病毒科 ） Caliciviridae （ 杯狀病毒科 ） Astroviridae （ 星狀病毒科 ） ? +ssRNA,no fragments , presence envelope Coronaviridae（ 冠狀病毒科 ） Flaviviridae （ 黃病毒科 ） Togaviridae （ 披膜病毒科） RNA Viruses DNA and RNA Viruses ? 嗜肝 DNA病毒科 （ Hepadnasviridae） ? 逆轉(zhuǎn)錄病毒科 //RNA（ Retroviridae ） ?亞病毒（ subvirus） ?是近年來發(fā)現(xiàn)的比一般病毒 更小 的傳染因子 。 ?包括 ?類病毒 （ viroid） ?擬病毒 （ virusoid） ?朊病毒 （ virino） 類病毒 （ Viroids） 1971年 ,美國 Diener等在研究馬鈴薯紡錘形塊疾病時報道并命名 。 類病毒的 大小 僅為最小病毒的 1／ 20左右 。 由 單股環(huán)狀 RNA組成 ， 桿 狀結(jié)構(gòu) ， 無 蛋白衣殼 。 對核酸酶敏感 ， 對熱 、 有機溶劑抵抗 。 致病機制可能是由于 RNA分子直接干擾宿主細(xì)胞的核酸代謝 。 類病毒主要使植物致病 ， 尤其引起馬鈴薯 、 柑橘、 椰子 、 啤酒花等多種重要經(jīng)濟植物的嚴(yán)重病害 。 類病毒的特征 ? 很 小 (200400nt)，桿狀 RNA 分子， 有 二級結(jié)構(gòu) ? 無 衣殼或包膜 ? 在核內(nèi)增殖，嚴(yán)格 細(xì)胞內(nèi)寄生 ? 多 與植物疾病相關(guān) 擬病毒 是在研究類病毒過程中發(fā)現(xiàn)的一種引起苜宿等植物病毒的亞病毒 。 擬病毒是 300～ 400個核苷酸 ， 有高度二級結(jié)構(gòu)的單股環(huán)狀 RNA分子 。 擬病毒在二級結(jié)構(gòu)上與類病毒相似 ，且與許多類病毒有序列同源性 。 朊病毒 1982年美國 Prusiner首先報道 羊瘙癢病 是由一種分子量為 3． 0X104的