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正文內(nèi)容

20xx云環(huán)境下基于聚簇的科學(xué)工作流執(zhí)行優(yōu)化策略(編輯修改稿)

2025-01-13 22:11 本頁(yè)面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 出現(xiàn)的一種新的應(yīng)用泛型,可支持科學(xué)研究人員集成、構(gòu)造和協(xié)同分布異構(gòu)的數(shù)據(jù)、服務(wù)和軟件工具,提高科學(xué)實(shí)驗(yàn)過(guò)程的自動(dòng)化程度。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,科學(xué)工作流逐漸變成數(shù)據(jù)密集型和計(jì)算密集型[1],例如:生物信息領(lǐng)域廣泛使用的下一代DNA測(cè)序技術(shù),每輪測(cè)序便可以產(chǎn)生600Gb的基因數(shù)據(jù),一次蛋白質(zhì)仿真實(shí)驗(yàn)的計(jì)算時(shí)間就達(dá)到幾CPU年[2](1CPU年是1GFLOP處理器不停歇地工作一年的計(jì)算量的總和。1GFLOP處理器一秒十億次浮點(diǎn)運(yùn)算)??梢?jiàn),常規(guī)的計(jì)算環(huán)境已經(jīng)很難滿(mǎn)足科學(xué)工作流的需要,云計(jì)算環(huán)境因其理論上可提供無(wú)窮的計(jì)算和存儲(chǔ)能力以及經(jīng)濟(jì)、可伸縮和Payasyougo的支付方式等特點(diǎn)[3],成為了科學(xué)工作流計(jì)算環(huán)境的理想選擇?! ‰m然理論上云環(huán)境可以提供無(wú)窮的計(jì)算能力,用戶(hù)可以按需使用其計(jì)算資源,但是計(jì)算資源的提供方案的變化可能涉及到實(shí)例的創(chuàng)建和分配以及數(shù)據(jù)移動(dòng),需要付出一定的代價(jià),并可能影響科學(xué)工作流的執(zhí)行效率和費(fèi)用[4]。因此,生成一個(gè)合理的初始執(zhí)行計(jì)劃是非常重要的[5]。實(shí)現(xiàn)工作流任務(wù)到計(jì)算資源的合理映射是工作流執(zhí)行的基礎(chǔ),也與工作流的執(zhí)行效率和執(zhí)行代價(jià)密切相關(guān),該過(guò)程被稱(chēng)為工作流的執(zhí)行計(jì)劃生成?! ∩晒ぷ髁鲌?zhí)行計(jì)劃的關(guān)鍵是把任務(wù)調(diào)度到合適的資源[6]上,包括資源的數(shù)量及類(lèi)型??茖W(xué)工作流任務(wù)調(diào)度算法已經(jīng)有很多,目前基于啟發(fā)式的調(diào)度算法得到了
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