【正文】 C H COR 3N H C H COR 2N H C H COR 1肽鏈 水解位點(diǎn) 胃蛋白酶 (pepsin) 它要求被斷裂鍵兩側(cè)的殘基都是疏水性氨基酸 ， 如 PhePhe。 這樣胰蛋白酶便能斷裂 Cys羧基端的肽鍵 。目前常用的羧肽酶有四種： A,B,C和 Y； A和 B來自胰臟； C來自柑桔葉； Y來自面包酵母。 N ( C H 3 ) 2S O 2 C lH 2 N C H CR OH N C H CR OS O 2N ( C H 3 ) 2+水解N ( C H 3 ) 2S O 2 H N C H CR OO H+ 氨基酸丹磺酰氯多肽 N 端丹磺酰 N 端氨基酸丹磺酰氨基酸C、苯異硫氰酸酯 (PITC)法： N末端 游離氨基的反應(yīng)，生成PTHAA衍生物可用有機(jī)溶劑抽提、干燥后做鑒定 D、肼解法： 此法是多肽鏈 C端氨基酸分析法。 ② 多肽鏈的拆分： 由多條多肽鏈組成的蛋白質(zhì)分子，必須先進(jìn)行拆分。這類多肽通常都具有特殊的生理功能，常稱為 活性肽 。 多肽鏈可以看成由 Cα 串聯(lián)起來的無數(shù)個酰胺平面組成 3. 肽的物理和化學(xué)性質(zhì)： ①游離 α NH2： PH活性低， 化學(xué)性質(zhì)相似 (與 AA中比較 ) ② 游離 α COOH： PH活性低， 化學(xué)性質(zhì)相似 (與 AA中比較 ) ③ 側(cè)鏈 R基： PH活性和 化學(xué)性質(zhì) 與 AA中相似 短肽的晶體是離子品格 ， 在水溶液中以偶極離子存在 。 （公認(rèn)的 pro組織方式，證據(jù)？） ?由兩個氨基酸組成的肽稱為二肽，由多個氨基酸組成的肽則稱為多肽（寡肽？）。 蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次 一級結(jié)構(gòu) (primary structure)： 多肽鏈的氨基酸序列 。 ?蛋白質(zhì)分子量變化范圍很大 , 從大約 6000到 1000000道爾頓甚至更大 (N AA=M/110, 12818) 單純蛋白質(zhì) （ simple protein)：僅由氨基酸組成 ， 不含其它化學(xué)成分 。 單純蛋白質(zhì) （按溶解度分類） 清蛋白 球蛋白 谷蛋白 谷醇溶蛋白 組蛋白 魚精蛋白 硬蛋白 綴合蛋白質(zhì) （按非氨基酸 成分分類） 糖蛋白 脂蛋白 核蛋白 磷蛋白 金屬蛋白 血紅素蛋白 黃素蛋白 單純蛋白質(zhì)分類 結(jié)合蛋白質(zhì)分類 蛋白質(zhì) （按生物學(xué)功能分類） 酶 調(diào)節(jié)蛋白 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 貯存蛋白 收縮和游動蛋白 結(jié)構(gòu)蛋白 支架蛋白 保護(hù)和開發(fā)蛋白 異常蛋白 蛋白質(zhì)的形狀和大小 形狀 纖維狀 球狀 膜蛋白 蛋白質(zhì)的相對分子量從大約 6000～ 1 106或更大一些。 四級結(jié)構(gòu) (quarternary structure)： 具有二條或二條以上獨(dú)立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈組成的蛋白質(zhì) ， 其多肽鏈間通過次級鍵相互組合而形成的空間結(jié)構(gòu) 。 ? 氨基酸的順序是從 N端的氨基酸殘基開始，以 C端氨基酸殘基為終點(diǎn)的排列順序。 肽的化學(xué)反應(yīng)也和氨基酸一樣 ， 游離的 α －氨基 、 α －羧基和 R基可以發(fā)生與氨基酸中相應(yīng)的基團(tuán)類似的反反應(yīng) 。 +H3NTyrGlyGlyPheMetCOO +H3NTyrGlyGlyPheLeuCOO Met腦啡肽 Leu腦啡肽 C y sT y rI L eG l nA s nC y sP r oL e uG l y N H2SS牛 催 產(chǎn) 素C y sT y rG l nA s nC y sP r oSSP h eA r gG l y N H2牛 加 壓 素 二 . 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu) 1. 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu) (Primary structure)包括： (1)組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目 . (2)多肽鏈的氨基酸順序， (3)多肽鏈內(nèi)或鏈間二硫鍵的數(shù)目和位置。 可以通過加入鹽酸胍方法解離多肽鏈之間的非共價力；應(yīng)用過甲酸氧化法或巰基還原法拆分多肽鏈間的二硫鍵。 H 2 N C H CR OH N C H CR O OR nCC HH N O Hn 1N 端氨基酸 C 端氨基酸OR nCC HH 2 N O HH 2 N C H CR ON H N H 2 +H+N H 2 N H 2氨基酸酰肼 C 端氨基酸(n1) D、氨肽酶法： 氨肽酶是一種肽鏈 外切酶 ，它能從多肽鏈的 N端逐個的向里水解。 多肽的選擇性降解的方法 有： 胰蛋白酶 (trypsin) 這是最常用的蛋白水解酶 ， 專一性強(qiáng) ，只斷裂賴氨酸或精氨酸的羧基參與形成的肽鍵 。 糜蛋白酶 (chymotrypin)或胰凝乳蛋白酶 (Chymotrypsin)：它斷裂 Phe、 Trp和 Tyr及其它疏水氨基酸的羧基參與形成的肽鍵 。 Leu以及其它疏水性氨基酸水解速度較快。 如果改用碳酸氫銨緩沖液 ()或醋酸銨緩沖液 ()時 ， 則只能斷裂 Glu殘基的羧基側(cè)肽鍵 。 將所得的肽段利用 Brown及 Hartlay的對角線電泳技術(shù)進(jìn)行分離（ 過甲酸 處理 ） 。肽鏈的主鏈呈鋸齒狀折疊構(gòu)象。 ? 在纖維狀蛋白質(zhì)中 β折疊主要是反平行式，而在球狀蛋白質(zhì)中反平行和平行兩種方式都存在。 ③第一個 aa殘基的 C=O與第四個 aa殘基的 NH生成氫鍵。 四、纖維狀蛋白質(zhì) ?纖維狀蛋白質(zhì)的氨基酸序列很有規(guī)律 ， 它們形成比較單一的 、 有規(guī)律的二級結(jié)構(gòu) ， 結(jié)果整個分子形成有規(guī)律的線形結(jié)構(gòu) ， 呈現(xiàn)纖維狀或細(xì)棒狀 ， 分子軸比 （ 軸比：長軸 /短軸 ）大于 10， 軸比小于 10的是球狀蛋白質(zhì) 。 鏈間主要以氫鍵連接 ， 層間主要靠范德華力維系 。 ?Elastin is a polymeric, crosslinked protein that confers elasticity to lungtissue 五、超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域 超二級結(jié)構(gòu) 在蛋白質(zhì)分子中，由若干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合在一起，彼此相互作用，形成有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體。包括主鏈和側(cè)鏈的 所有原子的空間排布 。 亞基一般是一條多肽鏈 ， 有時也稱