chapter1蛋白質(zhì)(1)-免費閱讀
【正文】 （ 3）在結(jié)構(gòu)與功能上的優(yōu)勢： ① 增強結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性：表面積 /體積 變??； ② 提高遺傳經(jīng)濟性和效率； ③ 使催化基團匯集在一起； ④ 具有協(xié)同效應(yīng)和別構(gòu)效應(yīng)。 二硫橋?qū)﹄逆湹恼_折疊并不是必要的 ， 但對穩(wěn)定折疊結(jié)構(gòu)作出貢獻 。 ② 結(jié)構(gòu)域一般由 100~200 個氨基酸殘基組成，但大小范圍可達 40~400 個殘基。 ?（三）膠原蛋白 ? 原膠原蛋白分子中的 單鏈（左手螺旋） ? 一股原膠原蛋白分子 ?膠原纖維 ?原膠原蛋白的頭 ?1000AA ?（ 四 ） 彈性蛋白 (elastin) ?彈性蛋白是彈性纖維的主要成分；主要存在于脈管壁及肺 。 ? 這是因為 ?— 角蛋白的側(cè)鏈 R基一般都比較大 ，不適于處在 ?— 構(gòu)象狀態(tài) ， 此外 ?— 角蛋白中的螺旋多肽鏈間有著很多的二硫鍵交聯(lián) ， 這些交聯(lián)鍵也是當外力解除后使肽鏈恢復(fù)原狀 (?— 螺旋構(gòu)象 )的重要力量 。彎曲處的 第一個氨基酸殘基的 C=O 和第四個殘基的 –NH 之間形成氫鍵， 形成一個不很穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。 目前發(fā)現(xiàn)的 β 轉(zhuǎn)角多數(shù)在球狀蛋白質(zhì)分子表面 ， β 轉(zhuǎn)角在球狀蛋白質(zhì)中含量十分豐富 ， 占全部殘基的 1/4。 ③ ?折疊有兩種類型。 ?螺旋是鏈內(nèi)形成氫鍵，其肽平面的鍵長和鍵角一定，肽鍵的原子排列呈反式構(gòu)型，相鄰的肽平面構(gòu)成二面角。 C H 3 S ：C H 2C H 2C HN H C N H C H CO OR+ B r C+NB rC H 3 S+C H 2C H 2C HN H C N H C H CO ORC NC H 3 S C N C H2C HN H C N H C H CO ORC H 2+H 2 O+C H 2C HN H COC H 2O H 3 N+C H COR高絲氨酸內(nèi)酯溴化氰基锍 甲基硫氰酸 溴化亞氨內(nèi)酯 H2O 肽酰 ⑦ 測定每個肽段的氨基酸順序 ： Edman降解法 (PITC)、酶解法、 依核苷酸序列的推定法 A、目標蛋白 (抗原 ) 抗體 多核糖體 mRNA cDNA aa序列 B、 Edman降解法 ? 由 Edman于 1950年首先提出，用于 N末端分析 ? 為 α NH2的 與 苯異硫氰酸酯 （ PITC）的反應(yīng) ? Edman （ 苯異硫氰酸酯法） 氨基酸順序分析法實際上也是一種 N端分析法。 Leu， Ile, Val,Met以及其它疏水性強的氨基酸水解速度較快。 R2=Pro 水解受抑 。 如果想 增加 多肽鏈中胰蛋白酶的 斷裂點 ， 可以用 丫丙啶 處理多肽鏈樣品 ， 這時 Cys殘基側(cè)鏈被修飾成類似 Lys的側(cè)鏈 ， 也具有 ε － NH2。根 據(jù) 不同的反應(yīng)時間測出酶水解所釋放出的氨基酸種類和數(shù)量，從而知道蛋白質(zhì)的 C末端殘基順序。此法的優(yōu)點是丹磺酰 氨基酸有很強的熒光性質(zhì)，檢測靈敏度可以達到1?109M。 (1) 測定蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)的要求 （ 97%以上）； ； (2)測定步驟 ① 測定蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的數(shù)目： 通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數(shù)與蛋白質(zhì)分子量之間的關(guān)系，即可確定多肽鏈的數(shù)目。 ?但是，也有許多分子量比較小的多肽以游離狀態(tài)存在。 肽基的 C、 O和 N原子間的共振相互作用 共振產(chǎn)生的重要結(jié)果： ?限制繞肽鍵的自由旋轉(zhuǎn) ?形成酰胺平面 ?產(chǎn)生鍵的平均化 ?大多數(shù)情況下 (除 Pro)，肽鍵呈反式 構(gòu)型 sp2 sp2 sp2 sp3 共振雜化體 由于羰基碳 氧雙鍵的靠攏 ， 允許存在共振結(jié)構(gòu) （ resonance structure） ，碳與氮之間的肽鍵有部分雙鍵性質(zhì) ， 由 CONH構(gòu)成的肽單元呈現(xiàn)相對的剛性和平面化 ， 肽鍵中的 4個原子和它相鄰的兩個 α 碳原子多處于同一個平面上 。 生物體最主要的特征是生命活動 ， 而蛋白質(zhì)是生命活動的體現(xiàn)者 ， 具有以下主要功能： 一 .基本問題 肽 ?一個氨基酸的氨基與另一個氨基酸的羧基之間失水形成的 酰胺鍵 稱為肽鍵，所形成的化合物稱為肽。 每條多肽鏈稱為亞基 (subunit)。 ?蛋白質(zhì)與多肽并無嚴格的界線，通常是將分子量在6000道爾頓以上的多肽稱為蛋白質(zhì)。 單體蛋白質(zhì) (monomeric protein)：僅由一條多肽鏈組成 。 蛋白質(zhì)的構(gòu)象和結(jié)構(gòu)組織層次： 蛋白質(zhì)的構(gòu)象 ： 指蛋白質(zhì)在天然狀態(tài)下所特有的空間結(jié)構(gòu)； 結(jié)構(gòu)組織層次 ： 一級（共價鍵）、二級（氫鍵）、三級（多種非共價鍵）和四級（亞基締合） 四、蛋白質(zhì)功能的多樣性 蛋白質(zhì)的序列異構(gòu)現(xiàn)象是蛋白質(zhì)生物功能多樣性和物種特異性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ) 。 如上述五肽可表示為： SerValTyrAspGln C C N C C N C C N C C N CC H 2 C H C H 2 C H 2 C H 2C O OO H C O 2 H C H 2C O N H 2O HC H 3H 3 N+O O O OH H H H HH H H HS e r V a l T y r A sp G l nC H 3N 端 C 端肽鍵 肽鏈寫法 ：游離 α 氨基在左，游離 α 羧基在右，氨基酸之間用“ ”表示肽鍵。 雙縮脲反應(yīng) 是肽和蛋白質(zhì)所特有的 ， 而為氨基酸所沒有的一個顏色反應(yīng) 。 ★其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序，它是蛋白質(zhì)生物功能的基礎(chǔ)。 ★ 巰基的保護 O O C C H C H2 S HN H 3 +I C H 2 C N H 2OC H 2 O C C lOC H 2 C l O O C C H C H2 SN H 3 +O C C H 2OC H 2 O O C C H C H 2 SN H 3 +C H 2 C N H 2O O O C C H C H2 SN H 3 +④ 測定每條多肽鏈的氨基
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