chapter1蛋白質(zhì)(1)-全文預(yù)覽
【正文】 A和 B來自胰臟； C來自柑桔葉； Y來自面包酵母。根 據(jù) 不同的反應(yīng)時(shí)間測出酶水解所釋放出的氨基酸種類和數(shù)量，按反應(yīng)時(shí)間和氨基酸殘基釋放量作動(dòng)力學(xué)曲線，從而知道蛋白質(zhì)的 N末端殘基順序。 N ( C H 3 ) 2S O 2 C lH 2 N C H CR OH N C H CR OS O 2N ( C H 3 ) 2+水解N ( C H 3 ) 2S O 2 H N C H CR OO H+ 氨基酸丹磺酰氯多肽 N 端丹磺酰 N 端氨基酸丹磺酰氨基酸C、苯異硫氰酸酯 (PITC)法： N末端 游離氨基的反應(yīng)，生成PTHAA衍生物可用有機(jī)溶劑抽提、干燥后做鑒定 D、肼解法： 此法是多肽鏈 C端氨基酸分析法。 ★ 巰基的保護(hù) O O C C H C H2 S HN H 3 +I C H 2 C N H 2OC H 2 O C C lOC H 2 C l O O C C H C H2 SN H 3 +O C C H 2OC H 2 O O C C H C H 2 SN H 3 +C H 2 C N H 2O O O C C H C H2 SN H 3 +④ 測定每條多肽鏈的氨基酸組成，并計(jì)算出氨基酸成分的分子比； ⑤ 分析多肽鏈的 N末端和 C末端 ★ 末端氨基酸的測定： 多肽鏈端基氨基酸分為兩類， N端氨基酸和 C端氨基酸。 ② 多肽鏈的拆分： 由多條多肽鏈組成的蛋白質(zhì)分子，必須先進(jìn)行拆分。 ★其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序，它是蛋白質(zhì)生物功能的基礎(chǔ)。這類多肽通常都具有特殊的生理功能，常稱為 活性肽 。 雙縮脲反應(yīng) 是肽和蛋白質(zhì)所特有的 ， 而為氨基酸所沒有的一個(gè)顏色反應(yīng) 。 多肽鏈可以看成由 Cα 串聯(lián)起來的無數(shù)個(gè)酰胺平面組成 3. 肽的物理和化學(xué)性質(zhì)： ①游離 α NH2： PH活性低， 化學(xué)性質(zhì)相似 (與 AA中比較 ) ② 游離 α COOH： PH活性低， 化學(xué)性質(zhì)相似 (與 AA中比較 ) ③ 側(cè)鏈 R基： PH活性和 化學(xué)性質(zhì) 與 AA中相似 短肽的晶體是離子品格 ， 在水溶液中以偶極離子存在 。 如上述五肽可表示為： SerValTyrAspGln C C N C C N C C N C C N CC H 2 C H C H 2 C H 2 C H 2C O OO H C O 2 H C H 2C O N H 2O HC H 3H 3 N+O O O OH H H H HH H H HS e r V a l T y r A sp G l nC H 3N 端 C 端肽鍵 肽鏈寫法 ：游離 α 氨基在左，游離 α 羧基在右，氨基酸之間用“ ”表示肽鍵。 （公認(rèn)的 pro組織方式，證據(jù)？） ?由兩個(gè)氨基酸組成的肽稱為二肽，由多個(gè)氨基酸組成的肽則稱為多肽（寡肽？）。 蛋白質(zhì)的構(gòu)象和結(jié)構(gòu)組織層次： 蛋白質(zhì)的構(gòu)象 ： 指蛋白質(zhì)在天然狀態(tài)下所特有的空間結(jié)構(gòu)； 結(jié)構(gòu)組織層次 ： 一級(jí)（共價(jià)鍵）、二級(jí)（氫鍵）、三級(jí)（多種非共價(jià)鍵）和四級(jí)（亞基締合） 四、蛋白質(zhì)功能的多樣性 蛋白質(zhì)的序列異構(gòu)現(xiàn)象是蛋白質(zhì)生物功能多樣性和物種特異性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ) 。 蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次 一級(jí)結(jié)構(gòu) (primary structure)： 多肽鏈的氨基酸序列 。 單體蛋白質(zhì) (monomeric protein)：僅由一條多肽鏈組成 。 ?蛋白質(zhì)分子量變化范圍很大 , 從大約 6000到 1000000道爾頓甚至更大 (N AA=M/110, 12818) 單純蛋白質(zhì) （ simple protein)：僅由氨基酸組成 ， 不含其它化學(xué)成分 。 ?蛋白質(zhì)與多肽并無嚴(yán)格的界線，通常是將分子量在6000道爾頓以上的多肽稱為蛋白質(zhì)。 單純蛋白質(zhì) （按溶解度分類） 清蛋白 球蛋白 谷蛋白 谷醇溶蛋白 組蛋白 魚精蛋白 硬蛋白 綴合蛋白質(zhì) （按非氨基酸 成分分類） 糖蛋白 脂蛋白 核蛋白 磷蛋白 金屬蛋白 血紅素蛋白 黃素蛋白 單純蛋白質(zhì)分類 結(jié)合蛋白質(zhì)分類 蛋白質(zhì) （按生物學(xué)功能分類） 酶 調(diào)節(jié)蛋白 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 貯存蛋白 收縮和游動(dòng)蛋白 結(jié)構(gòu)蛋白 支架蛋白 保護(hù)和開發(fā)蛋白 異常蛋白 蛋白質(zhì)的形狀和大小 形狀 纖維狀 球狀 膜蛋白 蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量從大約 6000～ 1 106或更大一些。 每條多肽鏈稱為亞基 (subunit)。 四級(jí)結(jié)構(gòu) (quarternary structure)： 具有二條或二條以上獨(dú)立三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈組成的蛋白質(zhì) ， 其多肽鏈間通過次級(jí)鍵相互組合而形成的空間結(jié)構(gòu) 。 生物體最主要的特征是生命活動(dòng) ， 而蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的體現(xiàn)者 ， 具有以下主要功能： 一 .基本問題 肽 ?一個(gè)氨基酸的氨基與另一個(gè)氨基酸的羧基之間失水形成的 酰胺鍵 稱為肽鍵，所形成的化合物稱為肽。 ? 氨基酸的順序是從 N端的氨基酸殘基開始，以 C端氨基酸殘基為終點(diǎn)的排列順序。 肽基的 C、 O和 N原子間的共振相互作用 共振產(chǎn)生的重要結(jié)果： ?限制繞肽鍵的自由旋轉(zhuǎn) ?形成酰胺平面 ?產(chǎn)生鍵的平均化 ?大多數(shù)情況下 (除 Pro)，肽鍵呈反式 構(gòu)型 sp2 sp2 sp2 sp3 共振雜化體 由于羰基碳 氧雙鍵的靠攏 ， 允許存在共振結(jié)構(gòu) （ resonance structure） ，碳與氮之間的肽鍵有部分雙鍵性質(zhì) ， 由 CONH構(gòu)成的肽單元呈現(xiàn)相對(duì)的剛性和平面化 ， 肽鍵中的 4個(gè)原子和它相鄰的兩個(gè) α 碳原子多處于同一個(gè)平面上 。 肽的化學(xué)反應(yīng)也和氨基酸一樣 ， 游離的 α －氨基 、 α －羧基和 R基可以發(fā)生與氨基酸中相應(yīng)的基團(tuán)類似的反反應(yīng) 。 ?但是，也有許多分子量比較小的多肽以游離狀態(tài)存在。 +H3NTyrGlyGlyPheMetCOO +H3NTyrGlyG
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