【正文】 的形成并不規(guī)定肽鏈的折疊，而是折疊好以后，靠近的半胱氨酸之間形成二硫鍵?？稍试S的φ和ψ值（拉氏構象圖）四、二級結構：多肽鏈折疊的規(guī)則方式α 螺旋 （ αhelix） α 螺旋是右手螺旋， 螺旋中每個 α碳的 φ角和 ψ角分別在－ 57176。由氫鍵封閉的環(huán)是 13元環(huán)，因此 α螺旋也稱為 －螺旋。其中最常見的是 310－螺旋，還有 （π 螺旋）。左右，反平行式的分別為－ 139176。脯氨酸具有固定的 φ角，在一定程度上迫使 β轉角形成。 很多大原纖維存在于沒有生命的細胞當中，這些細胞組成毛發(fā)的核心，毛發(fā)的外層是皮層細胞 和鱗狀細胞。絲心蛋白是反平行的 β 折疊片堆積成的多層結構，鏈間主要以氫鍵連接，層間主要以范德華力結合。 就單股螺旋肽鏈來說，它是 左手螺旋 ，三股再組成右手螺旋的原膠原分子。 肌球蛋白模式圖肌球蛋白 S1的結構 肌球蛋白可用胰蛋白酶水解成兩個片段，一個叫輕酶解肌球蛋白（ LMM）， 另一個叫重酶解肌球蛋白（ HMM）。 βαβ 單元中的右手交叉發(fā)夾連接右手交叉連接左手交叉連接結構域 結構域（ domain） 是多肽鏈在二級結構或超二級結構的基礎上形成三級結構的局部折疊區(qū)，它是相對獨立的緊密球狀實體。 球狀蛋白質的分類 Ⅲ平行 β 折疊片結構域（馬鞍形扭曲片）乳酸脫氫酶結構域 1（側面） 磷酸甘油激酶結構域 2乳酸脫氫酶結構域 1（頂面）馬鞍形扭曲片 βαβ 結構，呈右手交叉，肽鏈從折疊片中開始向一個方向卷繞 成 Rossman折疊， α 螺旋覆蓋在折疊片的一側，然后改變方向回到折疊片的中部向相反的方向卷繞再形成 Rossman折疊，此時 α 螺旋覆蓋在折疊片的另一側。2．球狀蛋白質具有明顯的折疊層次。一類是埋入膜當中的膜內在蛋白（ integral protein）， 它們的兩端從膜中伸出，伸出的部分多少不一；另一類是結合在膜表面的膜周邊蛋白（ peripheral protein）， 它們通過靜電相互作用及氫鍵與膜內在蛋白結合；第三類稱為脂錨定蛋白（ lipidanchored protein）， 它們與脂共價結合，脂插入到膜中。還能增加疏水基團在水中的溶解度，破壞蛋白質的三級結構。有些多聚蛋白質只由一種亞基組成，稱為同多聚蛋白質；有些由兩種以上的亞基組成，稱為雜多聚蛋白質。 亞基相互作用的方式 Ⅰ假設的單體 C2對稱 C3對稱亞基相互作用的方式 ⅡC4對稱 D2對稱 D3對稱對稱的類型 當一個物體有這樣一個軸，繞軸旋轉一定角度（小于 360176。增強穩(wěn)定性：比表面積減小，減少了與水的相互作用。O ribose mtf. 1v2x 191 31 1j85 156 31 1ipa 258 31 1gz0 242 31A. aeolicus 1zjr 197 31S. viridochromog. 1x7p 267 31List of known knots ⅡProtein Species PDB code Length KnottRNA(m1G37)methyltransferase TrmD 1uaj 241 31 1p9p 235 31YggJ Cterminal domainlike 1nxz 246 31 1vhk 235 31 1v6z 227 31Hypothetical protein MTH1 (MT0001) . thermoautotr. 1k3r 262 31Carbonic Anhydrases: 31Carbonic Anhydrase II 1lug 259 31Bos Taurus 1v9e 259 31Dunaliella salina 1y7w 274 31List of known knots ⅢProtein Species PDB code Length KnotCarbonic Anhydrase N. gonorrhoeae 1kop 223 31Carbonic Anhydrase I 1hcb 258 31Carbonic Anhydrase III Rattus norv. 1flj 259 31H. sapiens 1z93 263 31Carbonic Anhydrase IV 1znc 262 31Carbonic Anhydrase V Mus musculus 1keq 238 31Carbonic Anhydrase VII 1jd0 260 31Carbonic Anhydrase XIV Mus Musculus 1rj6 259 31Miscellaneous: 31Ubiquitin Hydrolase UCHL3 1xd3 229 52 (synth.) 1cmx 214 31List of known knots ⅣProtein Species PDB code Length KnotUbiquitin Hydrolase UCHL1 2etl 219 52Sadenosylmethionine synthetase 1fug 383 31rattus norv. 1qm4 368 31H. sapiens 2hj2 380 31Class II ketolacid reductoisomerase Spinacia oleracea 1yve 513 41 1yrl 487 41Transcarbamylase 1js1 324 31 1yh0 328 31Methyltransferase 2ha8 159 31P. gingivalis 2i6d 231 31。提高遺傳經濟性和效率：用較少的遺傳物質產生較多的蛋白質。這個最小的、可以恢復原樣的角度 α稱為基轉角，2π/α=n， n是物體繞軸一圈時與原物體重合的次數(shù)，這個物體就是 Cn對稱（ n重環(huán)狀對稱）。對于同多聚蛋白質來說，一個單體也就是一個原體。 有些蛋白質變性是可逆的，當變性因素消除后，肽鏈可自動折疊到天然構象，恢復功能。麥芽糖膜孔蛋白反平行 β 桶桶內親水，桶外疏水 ,中間是親水的孔道脂錨定蛋白與脂連接的 4種方式 硫醚異戊二烯化膜內在蛋白加脂錨鉤N豆蔻?；? S棕櫚?；拧⒌鞍踪|折疊蛋白質的變性 Ⅰ 蛋白質變性的實質是分子中的次級鍵被破壞，引起天然構象發(fā)生重大變化，但一級結構保持不變。如果是寡聚蛋白質，則再締合成四級結構。有時有發(fā)夾連接的反平行 β 折疊股混雜在平行β 折疊股之間，形成混合型 β 折疊片蛋白質。 有些單體蛋白質或寡聚蛋白質的亞基只有一個結構