dna甲基化(存儲(chǔ)版)
【正文】 ，若用該對(duì)引物能擴(kuò)增出片段，說明該檢測(cè)位點(diǎn)發(fā)生了甲基化； 另一引物針對(duì)經(jīng)亞硫酸氫鈉處理后的非甲基化DNA 鏈設(shè)計(jì)，若用該對(duì)引物能擴(kuò)增出片段，說明該檢測(cè)位點(diǎn)沒有甲基化。 DNA 甲基化的預(yù)測(cè)、分析 ?對(duì)單個(gè) CpG 雙核苷酸的甲基化狀態(tài)預(yù)測(cè)； ?對(duì) CpG 島片段以及 CpG 島的甲基化狀態(tài)預(yù)測(cè)。 美國(guó)加州貝克曼研究所的 Pfeifer 實(shí)驗(yàn)室在 PLoS Niehrs的結(jié)果，題目針鋒相對(duì)：GADD45A does not promote DNA demethylation。 DNA 去甲基化的機(jī)理 2022年，斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的院士 Helen M. Blau證明誘導(dǎo)哺乳動(dòng)物 iPS需要 AID蛋白參與啟動(dòng)細(xì)胞的 DNA去甲基化，并啟動(dòng)細(xì)胞核重新編程過程。 這樣通過觀察熒光信號(hào)的變化來判斷基因組甲基化的變化。 他們又將工作快速推向深入，把這種修飾與造血細(xì)胞的分化聯(lián)系到了一起 (2022年 Science)，然后還發(fā)現(xiàn)其異常（ Tet2突變、缺失）與血液系統(tǒng)腫瘤發(fā)生密切相關(guān)（ 2022年 Nature）。 這為相關(guān)疾病的有效治療策略指明了新方向。 他們還發(fā)現(xiàn)這類基因在后生動(dòng)物門中都普遍存在 ,提示這種功能機(jī)制的重要性和保守型。 把 MBPD與綠色熒光蛋白連起來（融合），相當(dāng)于給 MBPD加上了一個(gè)熒光標(biāo)簽，可以在顯微鏡下直接觀察和追蹤 MBD的位置。 甲基胞嘧啶通過脫氨作用形成的尿嘧啶，尿嘧啶只能在 RNA出現(xiàn)，如果在 DNA出現(xiàn)，細(xì)胞會(huì)觸發(fā)堿基切除反應(yīng)。 2022年，美國(guó)朱健康實(shí)驗(yàn)室在植物發(fā)現(xiàn)并鑒定了 DNA去甲基化酶。 DNA甲基化的生物信息學(xué)研究進(jìn)展 由于 DNA 甲基化在基因調(diào)控中的重要功能，以 Sanger 研究所為代表的人類表觀基因組聯(lián)盟，于 2022 年 10 月發(fā)起了人類表觀基因組計(jì)劃 (human epigenome project， HEP)，試圖獲得人類多個(gè)組織中的 DNA 甲基化模式。 酶切法： 對(duì)甲基化敏感程度不同的一對(duì)同裂酶 HpaII 和 MspI。 Memory at the cellular level 甲基化與發(fā)育 性成熟個(gè)體 配子母細(xì)胞 成熟配子 早期胚胎 成體模式的胚胎 體細(xì)胞 生殖細(xì)胞 原始生殖細(xì)胞 甲基化清洗 印記 保持印記 部分保持印記 保持印記 保持印記 甲基化清洗重塑 X染色體失活，基因的時(shí)空特異性表達(dá) 甲基化異常 導(dǎo)致的疾病， 衰老 DNA 甲基化同眾多疾病的發(fā)生與發(fā)展密切相關(guān)，比如 Ⅱ 型糖尿病、自身免疫疾病以及各種癌癥。 ?因此，成體基因組通常呈現(xiàn) 2 種 DNA 甲基化形式，奢侈基因呈現(xiàn)高密度甲基化，而含有豐富 CpG 島的管家基因則呈非甲基化。 組蛋白密碼 DNA甲基化與小 RNA的關(guān)系 近年研究表明， siRNA 和 miRNA 能在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中介導(dǎo) DNA 甲基化（ RdDM）、組蛋白修飾及異染色質(zhì)的形成， 從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄基因沉默(TGS)。該現(xiàn)象促使人們思考為什么 CpG 島不易被甲基化。 ?甲基化的 CpG 雙核苷酸通過募集轉(zhuǎn)錄抑制因子或者阻礙轉(zhuǎn)錄激活因子的結(jié)合 抑制基因的表達(dá) 。 簡(jiǎn)單地把 DNA甲基化理解為“一把鎖”，凡是被 DNA甲基化標(biāo)記的部分，大都是需要被“塵封”“監(jiān)禁”的基因，比如基因組的“搗蛋鬼” — 轉(zhuǎn)座子，就是被甲基化這把“鎖”管制著，失去管制或管制不嚴(yán)，這些“搗蛋鬼”會(huì)在基因組里跳來跳去，把基因組搞得一團(tuán)糟，會(huì)引起很多問題，如腫瘤、精神疾病等。在雜合子貓 XOXo，一些細(xì)胞團(tuán)產(chǎn)生黃毛 、一些細(xì)胞團(tuán)產(chǎn)生黑毛，在白色背景下構(gòu)成 3 色皮毛。這就是基因印記。通常其無效等位基因 b 導(dǎo)致花青素缺乏，對(duì) BI 完全隱性。 玉米中有一個(gè)編碼花青素合成途徑中一種關(guān)鍵酶的基因 BI，存在于各種組織中。這個(gè)現(xiàn)象表明，來源于不同性別親本的遺傳物質(zhì)在后代表達(dá)的功能可以有差別。那么，功能與性狀的變化因何而起 ? X染色體失活 X 連鎖的 O基因控制黃色毛性狀，其等位基因 o控制黑色毛性狀，另有常染色體基因 S 控制白色性狀。 IPA LTR LTR Phenotype diversity contributed by dynamics of epigenotype WT IPA LTR LTR Agouti 別小看一個(gè)小小
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