生物信息學實驗(存儲版)
【正文】 進行BLAST搜索、如何獲取BLAST幫助。掌握如何使用ClustalW/X軟件，包括輸入、主要參數的設定、輸出結果分析。(2)與BLAST相比，PSIBLAST有哪些特點。同時，學生可以在論壇中（專門為生物信息學試驗課設計的）發(fā)表自己的見解、交流學習心得。6 / 6。其它教學環(huán)節(jié)：實驗課剛開始，授課老師結合ppt，講授本次實驗課的主要內容，并布置本次實驗作業(yè)。實驗八、PSIBLAST And HMMER 4學時 基礎性主要內容：PSIBLAST（PositionSpecific Iterated BLAST）,HMMER（Biosequence analysisi using profile hidden markov models）,Pfam教學要求：了解什么是PSIBLAST,HMMER,都分別有哪些應用。實驗七、Multiple Sequence Alignment and ClustalW/X 4學時 基礎性主要內容： MSA（Multiple Sequence Alignment）, ClustalW/X教學要求：了解為什么要MSA（多序列比對），什么是ClustalW，從哪里可以在線使用ClustalW，或下載ClustalX程序以本地使用。實驗六、BLAST 4學時 基礎性主要內容： BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 教學要求：了解什么是BLAST，它有哪些應用，幾種常用的BLAST程序包。（2）SPIDer是我們小組開發(fā)的一個芽殖酵母蛋白質蛋白質相互作用及可視化檢索系統(tǒng)。理解各個數據庫的內容。難點：如何使用Haploview工具進行LD分析。其它教學環(huán)節(jié)：實驗課剛開始，授課老師結合ppt，講授本次實驗課的主要內容，并布置本次實驗作業(yè)。在實驗過程中，授課老師提議同一個小組的學生一起討論，有問題向授課老師或助教提問。把最基本的生物信息學計算技術進行聯(lián)機學習，突出基礎性和實用性，讓每個同學通過實際操作來體驗復雜的生物學數據及其相關的分析手段。【適用專業(yè)】生物技術、生物科學【學 時 數】32學時 【編寫日期】2007年6月一、教學目標 本課程旨在使學生了解生物信息學基本知識，掌握生物信息學的基本思路與方法。其它教學環(huán)節(jié)：實驗課剛開始，授課老師結合ppt，以人類胰島素基因I
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