生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)(已修改)
2025-04-16 23:37 本頁(yè)面
【正文】 生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn) Bioinformatics Experiment【課程編號(hào)】1411010【課程類別】專業(yè)方向課【學(xué) 分 數(shù)】1學(xué)分 【適用專業(yè)】生物技術(shù)、生物科學(xué)【學(xué) 時(shí) 數(shù)】32學(xué)時(shí) 【編寫(xiě)日期】2007年6月一、教學(xué)目標(biāo) 本課程旨在使學(xué)生了解生物信息學(xué)基本知識(shí)，掌握生物信息學(xué)的基本思路與方法。把最基本的生物信息學(xué)計(jì)算技術(shù)進(jìn)行聯(lián)機(jī)學(xué)習(xí)，突出基礎(chǔ)性和實(shí)用性，讓每個(gè)同學(xué)通過(guò)實(shí)際操作來(lái)體驗(yàn)復(fù)雜的生物學(xué)數(shù)據(jù)及其相關(guān)的分析手段。通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，可以深化學(xué)生理解和使用由高通量技術(shù)所產(chǎn)生的大量生物信息的生物學(xué)背景及其分析方法；同時(shí)本課程與專業(yè)的需求緊密結(jié)合，通過(guò)學(xué)習(xí)，使學(xué)生能夠快速檢索網(wǎng)上信息，從而了解本學(xué)科的前言知識(shí)；通過(guò)學(xué)習(xí)使學(xué)生能夠與生物信息大型數(shù)據(jù)庫(kù)建立連接，取得已有的數(shù)據(jù)，從而為自己的研究服務(wù)。二、教學(xué)內(nèi)容和學(xué)時(shí)分配實(shí)驗(yàn)一、Genomic Databases 4學(xué)時(shí) 基礎(chǔ)性主要內(nèi)容： UCSC Genome, BrowserNCBI Map, ViewerEnsembl教學(xué)要求：了解當(dāng)前全球三個(gè)主要的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)：UCSC、NCBI和Ensembl。了解三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)共有的特點(diǎn)，以及在可視化、提供的信息、所用到的序列比對(duì)工具等方面的不同之處。以人類胰島素基因Insulin為例，理解三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是如何注釋gene duplication、EST、SNP等基因組信息的。結(jié)合三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的各自特點(diǎn)，掌握如何從數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取與基因相關(guān)的序列、三維結(jié)構(gòu)、功能、遺傳變異等信息。重點(diǎn)、難點(diǎn)：三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)都涵蓋了幾乎所有的基因組信息，因此從眾多信息中如何獲得自己所感興趣的是本次試驗(yàn)課的重點(diǎn)，也是難點(diǎn)。其它教學(xué)環(huán)節(jié)：實(shí)驗(yàn)課剛開(kāi)始，授課老師結(jié)合ppt，以人類胰島素基因Insulin為例，講授本次實(shí)驗(yàn)課的主要內(nèi)容，并布置本次實(shí)驗(yàn)作業(yè)。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，授課老師提議同一個(gè)小組的學(xué)生一起討論，有問(wèn)題向授課老師或助教提問(wèn)。同時(shí)，學(xué)生可以在論壇中（專門(mén)為生物信息學(xué)試驗(yàn)課設(shè)計(jì)的）發(fā)表自己的見(jiàn)解、交流學(xué)習(xí)心得。實(shí)驗(yàn)二、NCBI PubMed 4學(xué)時(shí) 基礎(chǔ)性主要內(nèi)容： NCBI PubMed：綜合的文獻(xiàn)檢索數(shù)據(jù)庫(kù)，包含了1600萬(wàn)篇生物化學(xué)文章的引文，這些文章來(lái)源于MEDLINE和其他生命科學(xué)學(xué)領(lǐng)域的期刊。教學(xué)要求： 了解NCBI的Entrenz系統(tǒng)，一個(gè)集成了Pub
化學(xué)相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號(hào)-1