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基于ndhf序列的植物遺傳關(guān)系分析_畢業(yè)設(shè)計(jì)論文(存儲(chǔ)版)

2024-10-08 10:17上一頁面

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【正文】 子系統(tǒng)學(xué) 近些年來隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展分子系統(tǒng)學(xué) ( Mo lecu lar Systemat ics)發(fā)展起來 , 它利用大量分子實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù) , 采用生物統(tǒng)計(jì)學(xué)方法來研究生基因間和物體間的進(jìn)化關(guān)系 , 事用來闡明植物系統(tǒng)進(jìn)化的一門新興的學(xué)科。 面上生癬,取草效莖揉軟,不時(shí)搓之。 紫草還有美容功效,紫草具有顯著的祛痘和消炎的效果,有很大的美容價(jià)值,被荀草園的永樂坊、美體小鋪、瑞士 magic care魔法護(hù)理等眾多化妝品品牌列為化妝品功能性成分之一紫草 的美容機(jī)理:紫草主要功能為涼血,活血化瘀,解毒透疹,因此能加速痘印和疤痕的新陳代謝,加上其良好的殺菌消炎作用。尚含花色素 3丙二酰葡萄糖甙[cyanidin3O( 6C malonylβDglucopyranoside]?!渡褶r(nóng)本草經(jīng)》認(rèn)為,白菊花茶能 “主諸風(fēng)頭眩、腫痛、目欲脫、皮膚死肌、惡風(fēng)濕痹,久服利氣,輕身耐勞延年。 菊花為菊科多年生草本植物,是我國傳統(tǒng)的常用中藥材之一,主要以頭狀花序供藥用。待到稍長大一些,便拔節(jié)生出一根細(xì)長的穗來,結(jié)滿了千百顆籽粒,毛茸茸的搖曳在風(fēng)里,仿佛調(diào)皮的小狗在抖動(dòng)著尾巴。圓錐花序緊密呈圓柱形,長 2~ 15厘米,微彎垂或直立,綠色 、黃色或變紫色;小穗橢圓形,先端鈍,長 2~ ;第一穎卵形,具 3脈,第二穎具 5脈;第一外稃與小穗等長,具 5~ 7脈,有一窄狹的內(nèi)稃。生于農(nóng)田、路邊、荒地。 種子發(fā)芽適宜溫度為 15~30℃ 。在微酸性至微堿性土壤中皆能生長。栽培種的頭狀花序較野生種大得多。 NCBI通過下面的計(jì)劃來實(shí)現(xiàn)它的四項(xiàng)目的: NCBI有一個(gè)多學(xué)科的研究小組包括計(jì)算機(jī)科學(xué)家,分子生物學(xué)家,數(shù)學(xué)家,生物化學(xué)家,實(shí)驗(yàn)物理學(xué)家,和結(jié)構(gòu)生物學(xué)家,集中于計(jì)算分子生物學(xué)的基本的和應(yīng)用的研究。 GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列信息量大 , 來源物種豐富、涵蓋廣泛 , 盡管尚有一定不足 , 但仍可用于篩選植物候選 DNA條形碼。紫草科有著名藥用植物紫草、早春野花斑種草、附地菜等,并且有與紫草具有同樣藥效的軟紫草、滇紫草等;有飼料植物聚合草;有觀賞植物基及樹(福建茶)、牛舌草;有油料植物破布木。生物信息學(xué)分析及與其它物種比對結(jié)果表明 , ndhF C290 位編輯可能會(huì)影響該蛋白的正確折疊。 ndhF 是葉綠體功能基因, 該基因共含有 21 個(gè)編輯位點(diǎn) , 且這 21 個(gè)位點(diǎn)均為部分編輯。是人類糧食和牲畜飼料的主 要來源,也是加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑方面的重要原料。 GenBank屬于一個(gè)序列數(shù)據(jù)庫的國際合作組織,包括 EMBL和 DDBJ。 它的使命包括四項(xiàng)任務(wù): ,生物化學(xué),和遺傳學(xué)知識(shí)的存儲(chǔ)和分析的自動(dòng)系統(tǒng) 2. 實(shí)行關(guān)于用于分析生物學(xué)重要分子和復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和功能的基于計(jì)算機(jī)的信息處理的,先進(jìn)方法的研究 醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用。約 100種,多可供觀賞,主要原產(chǎn)舊大陸亞熱帶及溫帶地區(qū)。喜涼爽、較耐寒,生長適溫 18- 21℃ ,地下根莖耐旱,最忌積澇,喜地勢高、土層深厚、富含腐殖質(zhì)、疏松肥沃、排水良好的壤土。一年生或多年生草本;圓錐花序頂生,圓柱狀或疏展呈塔狀,小穗無芒,有 1-第一章 引 言 4 2小花,全部或部分小穗托以 1至數(shù)枚剛毛,脫落于極短而呈杯狀的小穗柄上,剛毛宿存,第一穎卵形或圓形,比小穗短 1/4至 1/2,第二穎約與小穗等長,第一小花雄性或中性,外稃與第二穎同質(zhì),第二小花兩性,外稃革質(zhì),平滑或有皺紋。適生性強(qiáng) ,耐旱耐貧瘠 ,酸性或堿性 土壤均可生長。 葉鞘較松弛,無毛或具柔毛;葉舌具長 1~ 2毫米的纖毛;葉片扁平,長 5~30厘米,寬 2~ 15毫米,頂端漸尖,基部略呈圓形或漸窄,通常無毛。雖然根須淺淺地幾乎只是浮在土上,然而若是拔得不徹底或是拔完了仍然扔在地里,那么依舊是不能置它于死地的,只需要一夜的露水,便足以讓它生出新芽或者復(fù)活,其生命力之強(qiáng),常讓人驚嘆不已?,F(xiàn)已生產(chǎn)的菊花食品有菊花晶、菊花糕、菊花酒等?!侗静菥V目》中對菊花茶的藥效也有詳細(xì)的記載:性甘、微寒,具有散風(fēng)熱、平肝明目之功效。 藥用成分:有腺嘌呤、膽堿、水蘇堿( stachydrine )、密蒙花甙( acacetin7rhamnoglucoside)、木犀草素 7葡萄糖甙、大波斯菊甙( cosmosiin)、刺槐素 7 葡 萄 糖 甙 ( acacetin7glucoside )、 布 枯 葉 素 7 葡 萄 糖 甙( diosmetin7glucoside)以及花色素;還含有揮發(fā)油, 油中主含菊花酮( chrysanthenone)、龍腦、龍腦乙酸酯等。臨床作用有治療急慢性肝炎、治療肺結(jié)核合并血小板減少性紫癜、治療惡性葡萄胎并發(fā)子宮絨毛膜上皮癌、治療嬰兒皮炎、外陰濕疹、陰道炎及子宮頸炎、治療青年扁平疣及銀屑病、治療玫瑰糠疹。 ② 《綱目拾遺》:治疔癰癬。甾醇( sterol),甾醇糖甙( sterol glycoside ),和單酸甘油酯( monoglyceride)?;蛐蛄蟹治鍪瞧渲斜容^常用的手段之一 .報(bào)道中已經(jīng)用來作序列分析的基因主要有 ITS及 rbcL等。近年來 , 越來越多的研究選用多種 DNA片段來進(jìn)行植物分子系統(tǒng)重建。 (3) 基于不同核基因位點(diǎn)間的系統(tǒng)結(jié)果矛盾 。當(dāng)所應(yīng)用的 LCNG位點(diǎn)因譜系重排在植物后代中的保留不一致時(shí) , 必然會(huì)導(dǎo)致一些物種或個(gè)體在系統(tǒng)樹上的位置沖突或與以往其它分析結(jié)果相矛盾。 (2) 植物的快速分化 ( rap id diversification) 和網(wǎng)狀進(jìn)化等復(fù)雜進(jìn)化史的影響。 Erixon和 Oxelman (2020) 通過比較隨機(jī)分割序列及鄰接分區(qū)兩種模式所構(gòu)建系統(tǒng)樹的支持率來判斷引起短枝的原因。 (2) 對分類學(xué)專家的依賴 , 分類學(xué)專家往往需要經(jīng)過多年的培養(yǎng)才能擅長于某一門類 , 而當(dāng)前人類對生物資源利用的范圍和強(qiáng)度均日益加大 , 相比之下傳統(tǒng)分類學(xué)專家隊(duì)伍卻急劇縮減。對于高等植物來說 , 在提出將 rbcL和 matK作為組合條形碼之后 ,也仍然不能實(shí)現(xiàn)對物種的全面鑒定。 Erickson, 2020)、 trnL intron (Taberlet et al.,2020)、 trnHpsbA (Kress et al., 2020。進(jìn)一步使用單克隆酶切方法測定了不同脅迫處理對 ndhF C290位編輯效率的影響。 數(shù)據(jù)來源 GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列信息量大 , 來源物種豐富、涵蓋廣泛 , 盡管尚有一定不 (Newmaster etal., 2020), 但仍可用于篩選植物 DNA序列。用最大似然法 ( Max imum parsimony, MP) 、鄰位相接法 ( Neighbor Joining, NJ) 構(gòu)建分子系統(tǒng)樹 , 應(yīng)用自展法 ( Boot strap, 1 000 replicates) 對所構(gòu)建的系統(tǒng)樹進(jìn)行檢測。 遺傳距離分析 利用 MEGA 軟件對 ndhF 序列進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,所得菊屬群種間遺傳距離見表 31,所得紫草屬群種間遺傳距離見表 32,狗 尾草屬群種間遺傳距離見表33。核苷酸序列變異是物種進(jìn)化的直接表現(xiàn)形式, 通過 DNA 序列分析,可獲得有關(guān)生物遺傳變異的確切信息,從而揭示物種間不同層次的變異。所以選擇葉綠體的基因分析植物遺傳關(guān)系。 第三章 結(jié)果與討論 24 但是,通過 GenBank查找 DNA 條形碼時(shí),只能查出別人上傳在數(shù)據(jù)庫的基因序列,很多自己想研究的植物沒有相關(guān)的基因序列。用 DNA序列為檢測對象 , 其在個(gè)體發(fā)育的歷史過程中不會(huì)太大改變。 ndhF基因和其他基因的組合,在未來植物遺傳分析上將發(fā)揮越來越重要的作用 參 考 文 獻(xiàn) 24 參考文獻(xiàn) [1] Pan Y L. 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