圓二色光譜在研究蛋白結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用-免費(fèi)閱讀
【正文】 4. 歲月是無情的，假如你丟給它的是一片空白，它還給你的也是一片空白。雖然紫外圓二色光譜預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)還存在著參考蛋白體系及計算算法有待進(jìn)一步完善之處，但隨著人們對蛋白質(zhì)CD理解的深入及CD光譜技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展，其必將在蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域中發(fā)揮更加重要的作用。BSA溶液顯示出了BSA中225。不同于溶液環(huán)境中的蛋白質(zhì)，膜蛋白鑲嵌于疏水的脂質(zhì)環(huán)境之中，因此，膜蛋白紫外CD光譜可能跟溶液狀態(tài)下的CD信號有所區(qū)別。隨著光學(xué)技術(shù)發(fā)展及同步加速器輻射圓二色(SRCD)光譜技術(shù)的發(fā)展，遠(yuǎn)紫外測量光譜可以展寬到190nm以下的真空遠(yuǎn)紫外區(qū)。遠(yuǎn)紫外區(qū)的圓二色光譜反映了蛋白質(zhì)或多肽的規(guī)則二級結(jié)構(gòu)中肽鍵排列的方向和能級躍遷情況, 通過對譜帶位置和吸收強(qiáng)弱的分析對比, 就能研究不同蛋白質(zhì)或多肽的二級結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)一般有一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、四級結(jié)構(gòu)幾個主要結(jié)構(gòu)層次, 有的還有結(jié)構(gòu)域或超二級結(jié)構(gòu)。但是X射線衍射技術(shù)對于分析結(jié)構(gòu)復(fù)雜、柔性的生物大分子蛋白質(zhì)，適合的單晶培養(yǎng)限制了它的應(yīng)用。圓二色光譜是一種差光譜, 是樣品在左右旋偏振光照射下的吸收光譜差值。 關(guān)鍵詞：圓二色光譜；蛋白質(zhì)；構(gòu)象；由于光學(xué)活性分子對左、右圓偏振光的吸收不同, 使得左、右圓偏振光透過后變成橢圓偏振光, 這種現(xiàn)象就是圓二色性(circular Dichroism,簡稱 CD)。在專門存儲蛋白質(zhì)和核酸分子結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中，接近90%的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)是用X射線晶體學(xué)的方法測定的。利用圓二色性研究蛋白結(jié)構(gòu)的工作始于1962年，Holzawarth與Doty發(fā)表了利用圓二色技術(shù)測定多聚氨基酸和肌紅蛋白構(gòu)象。(2)250～300nm的近紫外光譜區(qū)[6]，主要由側(cè)鏈芳香基團(tuán)的ππ*電子躍遷引起,這一區(qū)域可給出“局域”側(cè)鏈間的相互作用。具有不同二級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)或多肽所產(chǎn)生CD譜帶的位置、吸收的強(qiáng)弱都不相同?，F(xiàn)代的蛋白質(zhì)CD擬合二級結(jié)構(gòu)的算法主要是，采用最小二乘法、單值分解及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法等算法，以待測蛋白質(zhì)代替參考蛋白體系中結(jié)構(gòu)相似的某一蛋白質(zhì)，反復(fù)計算取代后的收斂性，從而計算擬合出未知待測蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)組成[9,10]。Alexander等[13]用遠(yuǎn)紫外CD檢測溶解的apoB100和nLDL，結(jié)果apoB100中的α螺旋和β折疊均比nLDL高，而無規(guī)則卷曲和β轉(zhuǎn)角則下降，整體的二級結(jié)構(gòu)無顯著變化。 CD光譜分析表明HRPCN的熱變性過程與天然HRP變性過程不同，它存在二級和三級結(jié)構(gòu)同時部分破壞的伸展中間態(tài)（Ⅰ，）和完全伸展后蛋白質(zhì)的聚集態(tài)（A）。有時候覺得自己像個神經(jīng)病。只有你自己才能把歲月描畫成一幅難以忘懷的人生畫卷。
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