【正文】
與 16S rRNA的堿基互補(bǔ)性,其中以 GGAG四個(gè)堿基序列尤為重要。 cI857阻遏蛋 在 42℃ 時(shí)失活脫落, PL便可介導(dǎo) 目的基因的表達(dá)。因此, 基因工程中使用的乳糖啟動(dòng) 子均為抗葡萄糖代謝阻遏的 突變型,即 Plac UV5 CAP cAMP cAMP濃度降低 Plac UV5 O 高效轉(zhuǎn)錄 啟動(dòng)子 啟動(dòng)子的可控性 Ptrp 色氨酸啟動(dòng)子 Ptrp的可控性: Otrp 除去 色氨酸 色氨酸啟動(dòng)子 Ptrp受色氨酸 阻遏 蛋白復(fù)合物的阻遏,轉(zhuǎn)錄呈基底 狀態(tài)。葡萄糖 代謝使 cAMP減少,也能阻 遏 Plac介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄。在基因 工程中常使用溫度敏感型的 cI突 變基因 cI857控制 PL。大腸桿菌細(xì)胞中結(jié)構(gòu)不同的 mRNA分子具有不同的翻譯效率,它們之間的差別有時(shí)可高達(dá)數(shù)百倍。在很多情況下, SD序列位于 AUG之前大約 七個(gè)堿基 處,在此間隔中少一個(gè)堿基或多一個(gè)堿基,均會(huì)導(dǎo)致翻譯起始效率不同程度的降低 核糖體結(jié)合位點(diǎn) 核糖體結(jié)合位點(diǎn)對(duì)外源基因表達(dá)的影響 起始密碼子及其后續(xù)若干密碼子的影響 : 大腸桿菌中的起始 tRNA分子可以同時(shí)識(shí)別 AUG、 GUG和 UUG三種起始密碼子,但其識(shí)別頻率并不相同,通常 GUG為 AUG的 50%而 UUG只及 AUG的 25%。為了提高人尿激酶原 cDNA在大腸桿菌中的高效表達(dá),將大腸桿菌的這兩個(gè) tRNA編碼基因克隆在另一個(gè)高表達(dá)的質(zhì)粒上。由高效表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建的大腸桿菌工程菌大量合成非天然性的同源或異源蛋白質(zhì),后者在一般情況下也以包涵體的形式存在于細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)。事實(shí)上,這種高表達(dá)率也是包涵體法的長(zhǎng)處所在 包涵體型異源蛋白的表達(dá) 包涵體的變性與復(fù)性操作 C 共價(jià)修飾的蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)變性復(fù)性的動(dòng)力學(xué)原理: C1 C2 Cn C U I 1 I n N X1 X2 Xn X Ag Ag Ag Ag I 有效變復(fù)性過程中的中間狀態(tài) X 脫離有效變復(fù)性過程而進(jìn)入集聚的中間狀態(tài) N 天然狀態(tài)的蛋白質(zhì) U 變性狀態(tài)的蛋白質(zhì) A 集聚狀態(tài)的蛋白質(zhì) 在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi), 集聚狀態(tài) 和 共價(jià)修飾 的蛋白質(zhì)不能進(jìn)入復(fù)性過程,因此永遠(yuǎn)成為 無活性的蛋白質(zhì)。形成二硫鍵的方式主要有: 隨機(jī)的,僅適用于那些不含游離半胱氨酸殘基的蛋白質(zhì)的重折疊 形成相對(duì)特異,因此適用性較廣,重折疊效果好 HS HS S S + 2e + 2H+ A HS HS SSR HS + B RSSR S S 2RSH 分泌型異源蛋白的表達(dá) 在大腸桿菌中表達(dá)的異源蛋白按其在細(xì)胞中的定位可分為兩種形式:即以可溶性或不溶性(包涵體)狀態(tài)存在于細(xì)胞質(zhì)中;或者通過運(yùn)輸或分泌方式定位于細(xì)胞周質(zhì),甚至穿過外膜進(jìn)入培養(yǎng)基中。外源真核生物基因很難在大腸桿菌中進(jìn)行分泌型表達(dá),少數(shù)外源基因既便能分泌表達(dá),但其表達(dá)率通常要比包涵體方式低很多,因此目前用于產(chǎn)業(yè)化的異源蛋白分泌型重組大腸桿菌盡管有,但并不普遍 分泌型異源蛋白的表達(dá) 蛋白質(zhì)的分泌機(jī)制 原核細(xì)菌周質(zhì)中含有多種 分子伴侶 可阻止分泌蛋白的隨機(jī)折疊 , 分泌在細(xì)胞周質(zhì)或培養(yǎng)基中的重組蛋白很少形成分子間的二硫鍵交聯(lián),因此與包涵體相比,分泌型重組蛋白具有較高比例的正確構(gòu)象,生物活性的回收率增加,且對(duì)蛋白酶不敏感 分泌型異源蛋白的表達(dá) 分泌型目的蛋白表達(dá)系統(tǒng)的構(gòu)建 包括大腸桿菌在內(nèi)的絕大多數(shù)革蘭氏陰性菌不能將蛋白質(zhì)直接分 泌到胞外,但有些革蘭氏陰性菌能將細(xì)菌的抗菌蛋白(細(xì)菌素)分泌 到培養(yǎng)基中,這一過程嚴(yán)格依賴于細(xì)菌素釋放蛋白,它激活定位于內(nèi) 上的磷酸酯酶 ,導(dǎo)致細(xì)菌內(nèi)外膜的通透性增大。由這種雜合基因表達(dá)出的蛋白質(zhì)稱為 融合蛋白 。在某些情況下,并不需要完整的受體結(jié)構(gòu)基因,目 的是盡可能避免融合蛋白分子中兩種組份的分子量過于接近, 融合蛋白的裂解工藝 兩個(gè)蛋白編碼序列應(yīng)保持一致的翻譯閱讀框架 融合型異源蛋白的表達(dá) 融合型目的蛋白表達(dá)系統(tǒng)的構(gòu)建 用于融合蛋白構(gòu)建的受體蛋白: 谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶( GST) 維持良好空間構(gòu)象 硫氧化還原蛋白( TrxA) 維持良好空間構(gòu)象 pTrxFus 麥芽糖結(jié)合蛋白( MBP) 促進(jìn)分泌 金黃色葡萄球菌蛋白 A( SAPA) 免疫親和層析 pRIT2T 外膜蛋白( OmpF) 促進(jìn)分泌 b半乳糖苷酶( LacZ) 免疫親和層析 泛素蛋白( Ubi) 維持良好空間構(gòu)象 融合型異源蛋白的表達(dá) 目的蛋白的回收 融合蛋白中受體蛋白部分的存在可能會(huì)影響目的蛋白的空間構(gòu)象和生物活性,如果將之注入人體還會(huì)導(dǎo)致免疫反應(yīng),因此在制備和生產(chǎn)藥用目的蛋白時(shí),將融合蛋白中的受體蛋白部分完整除去是必不可少的工序。幾種斷裂位點(diǎn)專一性最強(qiáng)的商品化蛋白 酶分別在多肽鏈中的 精氨酸 、 谷氨酸、賴氨 酸 殘基處切開酰胺鍵,形成不含上述殘基的 下游斷裂肽段,與溴化氰化學(xué)斷裂法相似。然而重組質(zhì)粒除了含有外源基因外,還攜帶其它的可轉(zhuǎn)錄基因,如作為篩選標(biāo)記的抗生素抗性基因等。細(xì)胞內(nèi)的 遺傳重組 可分為兩大類: 轉(zhuǎn)位因子依賴型 同源序列依賴型 整合型異源蛋白的表達(dá) DNA體內(nèi)重組的基本原理 轉(zhuǎn)位因子 是指生物細(xì)胞內(nèi)天然存在的一類無復(fù)制能力的 DNA可移動(dòng)因子,不同生物種群擁有結(jié)構(gòu)不同的轉(zhuǎn)位因子,例如: 轉(zhuǎn)位因子依賴型的體內(nèi)重組: 轉(zhuǎn)位因子家族 噬菌體 G片段( GFragment) 原核細(xì)菌 插入順序( IS) 真核細(xì)菌 轉(zhuǎn)座子( Tn、 Ty) 高等植物 可移動(dòng)因子( Ac、 Ds) 高等動(dòng)物 跳躍基因( mobil gene) 整合型異源蛋白的表達(dá) DNA體內(nèi)重組的基本原理 轉(zhuǎn)位因子依賴型的體內(nèi)重組: 轉(zhuǎn)位因子的結(jié)構(gòu) IS( 1 kb) Ty( 5 kb) Tn( 2 20 kb) ACCATGGTT TTGGTACCA 抗藥性基因 轉(zhuǎn)位酶基因 識(shí)別位點(diǎn) 阻遏基因 IR IR IR IR IS IS 整合型異源蛋白的表達(dá) DNA體內(nèi)重組的基本原理 轉(zhuǎn)位因子依賴型的體內(nèi)重組: 整合形式 整合型異源蛋白的表達(dá) DNA體內(nèi)重組的基本原理 在很多原核細(xì)菌細(xì)胞中 , 染色體 DNA鏈上的兩個(gè)同源區(qū)之間可發(fā)生所謂的同源重組 , 其頻率與細(xì)菌種類 、 兩個(gè)同源區(qū)之間的距離同源區(qū)的長(zhǎng)度 、 同源程度密切相關(guān) 。然而越來越多的實(shí)驗(yàn)表明,重組目的蛋白在受體細(xì)胞內(nèi)的半衰期可以通過蛋白序列的人工設(shè)計(jì)以及受體細(xì)胞的改造加以調(diào)整和控制。 蛋白酶缺陷型受體細(xì)胞的改造 lon基因缺陷的大腸桿菌受體( lon ): 蛋白酶抗性或缺陷型表達(dá)系統(tǒng)的構(gòu)建 大腸桿菌中龐大的熱休克蛋白家族對(duì)異?;?異源蛋白的降解也有重要作用,其機(jī)理是脅迫 異?;?異源蛋白形成一種對(duì)蛋白 酶識(shí)別和降解較有利的空間構(gòu)象,從而提高 異常或 異源蛋白對(duì)蛋白酶的敏感性。 抗蛋白酶的重組異源蛋白序列的設(shè)計(jì) 多肽鏈 C末端氨基酸序列對(duì)穩(wěn)定性的影響: 蛋白酶抗性或缺陷型表達(dá)系統(tǒng)的構(gòu)建 大量的實(shí)驗(yàn)結(jié)果同時(shí)表明,如果多肽鏈的 N末端序列中含有較高比例的 Ala、 Asn、 Cys、 Gln、 His, 則蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性顯著改善。 人胰島素的生產(chǎn)方法 化學(xué)合成法制人胰島素 根據(jù)人胰島素 A鏈和 B鏈的序列,由單個(gè)氨基酸從頭合成。該過程的總轉(zhuǎn)化率為 60% 但工藝路線耗時(shí),分離純化操作復(fù)雜,產(chǎn)品的價(jià)格不菲。 重組人胰島素的大腸桿菌工程菌的構(gòu)建 A鏈和 B鏈分別表達(dá)法 基因工程菌的構(gòu)建戰(zhàn)略: tac tac bGal bGal A peptide B peptide ori ori Apr Apr Met Met Met Met M M N C M M N C 化學(xué)合成 A鏈 和 B鏈的編碼 序列 重組人胰島素的大腸桿菌工程菌的構(gòu)建 A鏈和 B鏈分別表達(dá)法 表達(dá)產(chǎn)物的后處理路線: M M N C M M N C bGal bGal A B CNBr 處理 N C S S S S C N S S N C N C N C N C Cys 體外氧化和重折疊 分離純化 重組人胰島素的大腸桿菌工程菌的構(gòu)建 A鏈和 B鏈分別表達(dá)法 生產(chǎn)技術(shù)的評(píng)價(jià): 由于 A鏈和 B鏈上共存在六個(gè)半胱氨酸殘基,體外二硫鍵的正 確配對(duì)率較低,通常只有 10% 20%,因此采用這條工藝路線生 產(chǎn)的重組人胰島素每克成本高達(dá) 100美元 以上。 目前美國 Ely LiLi公司采用此工藝年產(chǎn) 十幾噸 的重組人胰島素。