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第二十三章重組和轉(zhuǎn)座-預(yù)覽頁(yè)

 

【正文】 I N S L 1( 1 )有長(zhǎng)末端重復(fù)序列( 2 )編碼反轉(zhuǎn)錄酶或整合酶( 3 )可含內(nèi)含子S I N S B 1 / A l u( 1 )無(wú)重復(fù)序列( 2 )不編碼轉(zhuǎn)座子產(chǎn)物( 3 )無(wú)內(nèi)含子轉(zhuǎn)座因子 真核反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子非病毒超家族假基因λ 整合 區(qū)域同源 I n t , IH F at t p 核心酶( 15 bp )交錯(cuò)切割連接 H o l l i d a y連接整合 無(wú)復(fù)制沙門氏菌相轉(zhuǎn)變區(qū)域同源 H i n 倒位 無(wú)復(fù)制Mu 的 G 片段倒位區(qū)域同源 G i n 倒位 無(wú)復(fù)制P1 的 C 片段倒位區(qū)域同源 C i n和t n p R同源I R (3 4 b p ) 和 T n 3 解離相似倒位 無(wú)復(fù)制轉(zhuǎn)座子之間或兩端DR 、 IR 重組區(qū)域同源 D R , I R DR → 切離和缺失IR → 倒位無(wú)復(fù)制位點(diǎn)特異重組反轉(zhuǎn)錄病毒整合區(qū)域同源 整合酶 靶 整 合 酶 在L T R 的 3 ′端產(chǎn)生 2 b缺口在靶上交錯(cuò)切割連接填補(bǔ)缺口整合 修復(fù)性復(fù)制同源特異重組酵母交配型轉(zhuǎn)變完全同源Ri d 5 2 , H O 特異 Y / Z交界交 錯(cuò) 切 割 、 配對(duì)、降解修復(fù)產(chǎn)生 Ch i 結(jié)構(gòu)單向取代 修 復(fù) 性復(fù)制復(fù)制型 無(wú) 轉(zhuǎn)座酶 單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制非復(fù)制型 無(wú) 解離酶 單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制保守型 無(wú) D N A Po l轉(zhuǎn)座子兩端 IR及 靶 的 交 錯(cuò) 切割、連接、修復(fù)性復(fù)制和解離單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制轉(zhuǎn)座重組I 類內(nèi)含子歸巢無(wú) 內(nèi) 切 酶 、 外 切酶、 D N A Po l 、連接酶、解離酶靶僅靶位點(diǎn)的交錯(cuò)切割與重組修復(fù)相似單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子反轉(zhuǎn)錄酶、內(nèi)切酶靶 單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制模板轉(zhuǎn)換Ⅱ類內(nèi)含子歸巢反轉(zhuǎn)錄酶、內(nèi)切酶靶RN A 介導(dǎo)模板轉(zhuǎn)換、交錯(cuò)切割單向插入 修 復(fù) 性復(fù)制特殊重組免疫球蛋白的 V J C連接區(qū)域同源RA G 1 , 2 特異位點(diǎn)( 編 碼端)平切→切單鏈→形成 3 ′凸端→補(bǔ)平→加入堿基剪切體細(xì)胞重組修 復(fù) 性復(fù)制第一節(jié) 重組機(jī)制 ?一 .交叉理論 ( chiasmatatype hypothesis) ? 1909年 Janssens并提出了交叉型理論 ?二 .斷裂和重接模型 1937年 Darlington提出 ?三 .模板選擇學(xué)說(shuō)( copy choice ) ? Belling , 1933年他又撤回了 這一假設(shè)。 ? 50年代中期 Mitchell,M. B. 異常分離不是由于整個(gè)染色體的異常行為 , 而是由于特定位點(diǎn)的 “ 基因轉(zhuǎn)變 ”所致 , 即屬于基因內(nèi)重組 。1964年美國(guó)學(xué)者 Robin Holliday提出了著名的Holiday模型 (圖 238) ?極化子 是由于交換產(chǎn)生的錯(cuò)配只發(fā)生在異源雙鏈部分 , 而此部分只發(fā)生在 Hollidy 結(jié)構(gòu)的斷裂和分枝點(diǎn)之間 , 離斷裂點(diǎn)越遠(yuǎn)的基因座位離分枝點(diǎn)可能越遠(yuǎn) , 而不在異源雙鏈的部分 。 ?RecBCD復(fù)合體具有核酸酶 , 解旋酶和 ATPase活性 。 R e c B C D 結(jié)合在雙鏈斷裂處 c h i B C D 5 ’ 3 ’ R e c B C D 解鏈并作為外切酶降解 D N A c h i R e c B C D 停留在 c h i 處,內(nèi)切酶切開(kāi)單鏈 R e c D 在 c h i 順序解離 R e c B C 繼續(xù)作為解鏈酶 圖 2 3 1 5 R e c B C D 核酸酶從一側(cè)接近 c h i 順序,當(dāng)它前進(jìn) 時(shí)降解 DNA 。 GCTGGTGG 339。 游離單鏈起始交換 被釋放的單鏈與互補(bǔ)鏈配對(duì) 單鏈交換完成 圖 2 3 1 8 R e c A 介導(dǎo)部分雙鏈和完整雙鏈之間的鏈的交換單鏈取代 (singlestrand uptake) ?可發(fā)生在各種形狀的 DNA分子之間,但要具備 3個(gè)條件: ?(1)其中一個(gè) DNA 分子要有單鏈區(qū); ?(2)其中一個(gè) DNA 分子要有游離的 339。 RecBCD 提供帶有游離末端的單鏈區(qū) ?RceA有兩個(gè)完全不同類型的活性: ?( 1) 在 SOS反應(yīng)中它能具有蛋白酶活性 ?( 2) 能啟動(dòng) DNA單鏈和與之互補(bǔ)的雙鏈分 子進(jìn)行堿基配對(duì) 。 他在半乳糖操縱子 (gal K,T,E ) 中發(fā)現(xiàn)了一種極性突變 。出現(xiàn)了棒糖狀結(jié)構(gòu) 二.原核轉(zhuǎn)座因子的類型 (一 ) 插入序列 (IS) (二 ) 類插入序列 ( ISlike elements) (三 ) 復(fù)合轉(zhuǎn)座子
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