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pcr引物設(shè)計黃金原則-預(yù)覽頁

2025-02-09 05:18 上一頁面

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【正文】 . 引物5′ 端和中間△G值應(yīng)該相對較高,而3′ 端△G值較低。(不同位置的△G值可以用Oligo 6軟件進(jìn)行分析)′端可以修飾,而3′端不可修飾。 引物的延伸是從3′ 端開始的,不能進(jìn)行任何修飾。用有關(guān)軟件(比如RNAstructure)可以預(yù)測估計mRNA的穩(wěn)定二級結(jié)構(gòu),有助于選擇模板。 11. 引物應(yīng)具有特異性。有的模板本身條件比較困難,例如GC含量偏高或偏低,導(dǎo)致找不到各種指標(biāo)都十分合適的引物;用作克隆目的的PCR,因為產(chǎn)物序列相對固定,引物設(shè)計的選擇自由度較低。 3)GC=3080%. 4)339。 而且引物設(shè)計時應(yīng)該考慮到引物要有不受基因組DNA污染影響的能力,即引物應(yīng)該跨外顯子,最好是引物能跨外顯子的接頭區(qū),這樣可以更有效的不受基因組DNA污染的影響。 關(guān)于BLAST的作用應(yīng)該是通過比對,發(fā)現(xiàn)你所設(shè)計的這個引物,在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并在GENEBANK中公開的不物種基因序列當(dāng)中,除了和你的目標(biāo)基因之外,還有沒有和其他物種或其他序列當(dāng)中存在相同的序列,如和你的目標(biāo)序列之外的序列相同的序列,則可能擴(kuò)出其他序列的產(chǎn)物,那么這個引物的特異性就很差,從
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