【正文】 用接近元素吸收邊的波長(zhǎng) （ Denzo程序） 我們知道每幅畫(huà)面上的衍射點(diǎn)的位置及其指標(biāo)是有許多因素決定的。 曝光時(shí)間：取決于晶體衍射能力和晶體在 X－射線下的壽命 （ 或穩(wěn)定性 ） 。 多對(duì)同晶置換法跟蹤肽鏈走向時(shí)有 3A電子密度圖也足夠了 。影響殘基的解離常數(shù) 離子強(qiáng)度 影響靜電相互作用 鹽析鹽溶也是影響有效濃度 溫度 一般不敏感 生復(fù)合物晶體 抑制劑、輔因子、底物、 Fab片段 截去柔性過(guò)大的 C端或 N端，以甘油作輔助溶劑 長(zhǎng)突變體蛋白 如何選擇突變位點(diǎn)是關(guān)鍵 最常用的氣相擴(kuò)散法 (懸滴、坐滴 )，平衡透析法 晶體到探測(cè)器的距離：晶胞越大該距離應(yīng)加大 ，以免衍射點(diǎn)重疊 。 (2)組成蛋白質(zhì)大分子的單個(gè)氨基酸有不對(duì)稱(chēng)碳原子 ， 而蛋白分子中又只有 L型氨基酸 ， 因此蛋白質(zhì)晶體的對(duì)稱(chēng)元素只有對(duì)稱(chēng)軸 ， 而沒(méi)有 m、 i。 等效點(diǎn)之間的向量峰 ，稱(chēng) Harker峰 ， Harker峰所在的平面 ， 稱(chēng) Harker截面 。 P( u v w) =12vC o s hu kv lw2h k l∞∞| F |??? ? ?? ( )來(lái)自 P( u v w) = ? ?( ) ( , , )x y z x u y v z w d x d y d z? ? ????(2)Patterson峰的特性 N(N1)+1。 在衍射實(shí)驗(yàn)中每一衍射點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)強(qiáng)度信息可以記錄 ， 由此可以推出 |Fhkl|，但每一衍射點(diǎn)的相角信息 α (hkl)卻丟失了 。 遺憾的是 ， 不是所有的空間群都能通過(guò)系統(tǒng)消光規(guī)律的辨識(shí)來(lái)唯一確定 ， 通過(guò)衍射試驗(yàn)只能把 230個(gè)空間群分成 120個(gè)不同的衍射群 ，也就是說(shuō)同一個(gè)衍射群有可能對(duì)應(yīng)于幾個(gè)空間群 。 在倒易點(diǎn)陣的對(duì)稱(chēng)性中，幾何晶體學(xué)中的七個(gè)晶系和基本對(duì)稱(chēng)元素都不變，在不考慮反常散射效應(yīng)的情況下，晶體衍射對(duì)稱(chēng)性均較原晶體的幾何晶體學(xué)對(duì)稱(chēng)性多一個(gè)對(duì)稱(chēng)中心，這樣使幾何晶體學(xué)中的 32個(gè)點(diǎn)群變成 X射線晶體學(xué)中的 11個(gè) Laue群。 在同一晶面中所有原子的反射線的相位是相同的 ， 與該晶面平行的一組平面上的原子 ， 要滿足 Bragg方程時(shí)才有相同相位的反射 。 31 11種螺旋軸 21 31， 32 41， 42， 43 61， 62， 63， 64， 65 反映滑移操作 ――― 滑移面 g ?反映＋平移 5種滑移面 a,b,c,n,d 空間群的記號(hào)及其意義 P1 C2 P212121 I4122 R3 P6122 P23 第一個(gè)字母表示 Bravias格子類(lèi)型 ， 接著是對(duì)稱(chēng)元素的記號(hào) ， 對(duì)稱(chēng)元素所在的位置表示該對(duì)稱(chēng)元素在相應(yīng)晶系中的方向 。 如：立方晶系中，底心點(diǎn)陣與該晶系的對(duì)稱(chēng)性不符（在 4個(gè)按立方體對(duì)角線排列的方向上有三重軸）， 所以不能存在。 ，其交點(diǎn)是一對(duì)稱(chēng)中心。 ， 45176。 ， 90176。新軸的基轉(zhuǎn)角 ω是兩個(gè)相交二重軸夾角 θ 的兩倍，即 ω＝ 2θ 。 ? 正交 二個(gè)互相垂直的對(duì)稱(chēng) a≠b≠c a b c ? 面或三個(gè)互相垂直的 α ＝ β ＝ γ ＝ 90176。 ? γ ＝ 120176。 旋轉(zhuǎn)軸 —— 1 6 2 3 4 鏡面 m和倒反操作 i 鏡面：鏡像關(guān)系 倒反：類(lèi)似于相機(jī)（凸透鏡）等大成像 旋轉(zhuǎn)反演操作 ――― 反軸 Lin ?旋轉(zhuǎn)＋倒反 i m 3＋ i 3＋ m 基本對(duì)稱(chēng)元素名稱(chēng)，矩陣表達(dá)式及其等效點(diǎn)表 ? 名稱(chēng) 符號(hào) 矩陣表達(dá)式 等效點(diǎn) ? (1) 對(duì)稱(chēng)中心 i 1 0 0 X X ? 0 1 0 Y Y ? 0 0 1 Z Z ? (2) 鏡面 m 1 0 0 X X ? 0 1 0 Y Y ? 0 0 1 Z Z ? (3) 二重軸 2 1 0 0 X X ? 0 1 0 Y Y ? 0 0 1 Z Z ? (4) 三重軸 3 0 1 0 X Y YX ? 1 1 0 Y XY X ? 0 0 1 Z Z Z ? (5) 四重軸 4 0 1 0 X Y X Y ? 1 0 0 Y X Y X ? 0 0 1 Z Z Z Z ? (6) 四重反軸 4 0 1 0 X Y X Y ? 1 0 0 Y X Y X ? 0 0 1 Z Z Z Z ? (7) 六重軸 6 0 1 0 X Y YX X Y XY 1 1 0 Y YX X Y XY X ? 0 0 1 Z Z Z Z Z Z 根據(jù)晶胞形狀，也就是六個(gè)晶胞參數(shù)，以及晶胞中所容納的特征對(duì)稱(chēng)元素，可以把不同的晶胞分成七個(gè)類(lèi)型，即七個(gè)晶系。 晶面交角不變定理 點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)是很有規(guī)律的結(jié)構(gòu) ， 除了上述的平移群能使它復(fù)原外 ， 還存在另外一些能使其復(fù)原的對(duì)稱(chēng)元素 ， 如對(duì)稱(chēng)中心 （ 倒反 ） ， 鏡面 ， 旋轉(zhuǎn)軸 ，旋轉(zhuǎn)反軸 ， 空間點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)中只能容納有限的幾種旋轉(zhuǎn)軸 ， 即二重軸 、 三重軸 、 四重軸及六重軸 ， 所以其最基本的對(duì)稱(chēng)元素只有七種 。由于點(diǎn)陣的特性 ， 這個(gè)比值一定可化成互質(zhì)的整數(shù)之比1∕r :1∕s :1∕t ＝ h:k:l,所以平面點(diǎn)陣的取向就用指標(biāo) （ hkl） 表示 。 晶格中的一個(gè)晶胞 晶格是晶胞在三維空間中的堆積 晶面指標(biāo) 晶體的空間點(diǎn)陣可劃分為一組平行而等間距的平面點(diǎn)陣。 分布在同一平面的叫平面點(diǎn)陣； 分布在三維空間的叫空間點(diǎn)陣。 u， v， w 為整數(shù) ， a， b， c 為三個(gè)非共面的向量 。 能使一點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)復(fù)原的全部平移形成一個(gè)平移群 ua+vb+wc，稱(chēng)為該結(jié)構(gòu)的平移群 。 晶體的點(diǎn)陣結(jié)構(gòu) 點(diǎn)陣分類(lèi)： 分布在同一直線上的叫直線點(diǎn)陣 ?？臻g點(diǎn)陣按照確定的平行六面體單位劃分后，稱(chēng)為晶格。 但直接由截?cái)?shù)之比 r： s： t表示時(shí) ， 當(dāng)平面點(diǎn)陣和某一坐標(biāo)軸平行 ，截?cái)?shù)將出現(xiàn) ∞ ， 為了避免 ∞ 數(shù) ， 規(guī)定用截?cái)?shù)的倒數(shù)之比1∕r :1∕s :1∕t 作平面點(diǎn)陣的指標(biāo) 。 實(shí)際晶體中的幾個(gè)晶面 。受點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)的限制，晶體中只存在 1， 2， 3， 4， 6幾種旋轉(zhuǎn)軸，用