cr引物設(shè)計(jì)及相關(guān)軟件使用(文件)
【正文】 的長(zhǎng)度一般為 1530 bp，常用的是 1827 bp，但不應(yīng)大于 38，因?yàn)檫^長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致其延伸溫度大于 74℃ ，不適于 Taq DNA 聚合酶進(jìn)行反應(yīng)。不同的末位堿基在錯(cuò)配位置導(dǎo)致不同的擴(kuò)增效率，末位堿基為 A 的錯(cuò)配效率明顯高于其他 3 個(gè)堿基，因此應(yīng)當(dāng)避免在引物的 3’端使用堿基 A。上下游引物的GC含量不能相差太大。應(yīng)當(dāng)選用 3’端 ?G 值較低（絕對(duì)值不超過 9），而 5’端和中間 ?G 值相對(duì)較高的引物。 常用的引物設(shè)計(jì)軟件 ?Oligo 6 （引物評(píng)價(jià)） * ?Premier Primer （自動(dòng)搜索） * ?Vector NTI Suit ?Dnasis ?Omiga ?Dnastar ?Primer3 （在線服務(wù)） * Primer Premier 的使用技巧簡(jiǎn)介 主要功能 : 即引物設(shè)計(jì) 限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)分析 DNA 基元 (motif)查找 同源性分析 簡(jiǎn)并引物設(shè)計(jì) ?根據(jù)氨基酸序列來設(shè)計(jì)引物 DNA引物 Premier Primer 5提供了 8種生物遺傳密碼使用的偏好選擇 纖毛蟲大核（ Ciliate Macronuclear） 無脊椎動(dòng)物線粒體（ Invertebrate Mitochondrion） 支原體（ Mycoplasma） 植物線粒體（ Plant Mitochondrion） 原生動(dòng)物線粒體（ Protozoan Mitochondrion） 一般標(biāo)準(zhǔn)（ Standard） 脊椎動(dòng)物線粒體（ Vertebrate Mitochondrion） 酵母線粒體（ Yeast Mitochondrion） Primer Premier (1) Preimer Prem
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