【正文】 分：快速?gòu)?fù)性部分，占基因組 DNA摩爾分?jǐn)?shù)的 25％，在 Cot值 1042 102范圍內(nèi)復(fù)性 第二部分：中速?gòu)?fù)性部分，占基因組 DNA摩爾分?jǐn)?shù)的 30％，在 Cot值 第三部分：慢速?gòu)?fù)性部分，占基因組 DNA摩爾分?jǐn)?shù)的 45％，在 Cot值 80104范圍內(nèi)復(fù)性 C0t1/2（任何基因組 DNA） 任何基因組 DNA的復(fù)雜性 = C0t1/2（大腸桿菌 DNA） 任何基因組 DNA的復(fù)雜性 C0t1/2（任何基因組 DNA） = C0t1/2（大腸桿菌 DNA） 重復(fù)序列分類(lèi) 1）高度重復(fù)序列（ 105次） （ 1）衛(wèi)星 DNA： 根據(jù)長(zhǎng)度可將其分為 3類(lèi) ★ 衛(wèi)星（ satellite） DNA： 重復(fù)長(zhǎng)度 510bp，其在人群中多態(tài)性不強(qiáng)。 有些重疊基因讀框相同，只是起始部位不同 如 SV40DNA基因組中，編碼三個(gè)外殼蛋白 VPVP VP3基因之間有 122個(gè)堿基的重疊 但密碼子的讀框不一樣 而小 t抗原完全在大 T抗原基因里面，它們有共同的起始密碼子。 （ 2）部分重疊。 而該病毒 DNA本身只有 5375個(gè)核苷酸，最多能編碼總分子量為 20萬(wàn)的蛋白質(zhì)分子， Sanger在弄清 ΦX174的 11個(gè)基因中有些是重疊的之前 ,這樣一個(gè)矛盾長(zhǎng)時(shí)間無(wú)法解決。 基因組計(jì)劃的最終目標(biāo)。 ? 遺傳圖譜（ geic map） 繪制 稱(chēng)連鎖圖譜（ linkage map），基因或 DNA標(biāo)記之間連鎖關(guān)系和染色體定位圖譜； 利用兩點(diǎn)的重組程度，反映兩點(diǎn)之間連鎖關(guān)系。如 B細(xì)胞成熟過(guò)程中 Ig基因結(jié)構(gòu)的重排及 TCR基因在分化過(guò)程中的重排 5. 存在重復(fù)序列 (repetitive sequence) 五 、 真核生物基因組的特點(diǎn) Geics與 Genomics 水生動(dòng)物基因組 : 對(duì) 1600多種魚(yú)類(lèi)及其他少數(shù)水產(chǎn)動(dòng)物研究表明 : 水生動(dòng)物基因組大小差異很大 : 多數(shù)魚(yú)類(lèi) /甲殼類(lèi)單倍體染色體數(shù)為 20— 25, 相當(dāng)于人類(lèi)基因組大小的 50%70% 鯉科和鮭科某些魚(yú)類(lèi)達(dá) 100條染色體 (四倍體化 ) 斑馬魚(yú)的基因組研究中 ,構(gòu)建了多個(gè)基因圖譜 斑馬魚(yú)的基因組測(cè)序已經(jīng)完成 水生動(dòng)物基因組 : 水生動(dòng)物基因組 : Zebrafish The Zebrafish Information Network Well conceived, easily navigated trove of zebrafish info The Interactive Atlas of Zebrafish Vascular Anatomy Extraordinary developmentalbiology site, featured in Science39。 2. 基因組結(jié)構(gòu)復(fù)雜 ， 有多個(gè)復(fù)制啟始位點(diǎn) ， 但每個(gè)復(fù)制子的長(zhǎng)度較小 。 如某些植物和兩棲類(lèi)的 DNA含量是人的幾十乃至上百倍 。 噬菌體基因組中無(wú)內(nèi)含子，但感染真核細(xì)胞的病毒基因組中具有內(nèi)含子（ SV40早期基因 T和 t） 6．有重疊基因 （同 ORF重疊、異 ORF重疊和反 ORF重疊） DNA用于編碼蛋白質(zhì)，只有一小部分是不翻譯的。一般 DNA病毒較大 ， RNA病毒較小 。在細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中，加適當(dāng)氯霉素可使松弛型質(zhì)粒的拷貝數(shù)由原來(lái)的 20多個(gè)擴(kuò)增至 10003000個(gè)。 5. 基因組中僅有少數(shù)基因存在基因重疊現(xiàn)象。 操縱子的末端具有特殊的終止序列 。 DNA總量變化范圍的產(chǎn)生至少有一個(gè)原因，即在染色體上存在著不同數(shù)目的重復(fù)順序，這些重復(fù)順序是不表達(dá)的。 生物的復(fù)雜性和其 DNA含量之間有較好的相關(guān)性 但在其它的一些門(mén)中，這種相關(guān)性有的并不存在 實(shí)際上一個(gè)門(mén)中的 C值變化并沒(méi)有一定的規(guī)律。 “生物體的復(fù)雜性并不是簡(jiǎn)單地與基因數(shù)量相關(guān)聯(lián)的。 DNA的長(zhǎng)度是根據(jù)堿基對(duì)的多少推算出來(lái)的。 各門(mén)生物存在著一個(gè) C值范圍，在每一門(mén)中隨著生物復(fù)雜性的增加，其基因組大小的最低程度也隨之增加?！?(G. Rubin) 人類(lèi)基因組 線粒體基因組 () 核基因組 (3200Mb) 基因外序列 基因和基因有關(guān)序列 約 10% 約 90% 專(zhuān)一或中等重復(fù)序列 Noncoding DNA 假基因 內(nèi)含子 基因片段 10% 90% 專(zhuān)一的或低 拷貝數(shù)序列 中度至高度重復(fù)序列 20~30% 70~80% 分散重復(fù)序列 串聯(lián)重復(fù)序列 / 成簇重復(fù)序列 約 60% 約 40% 蛋白編碼 基因 rRNA 基因 tRNA 基因 Coding DNA C值的資料表明，在不同的門(mén)中 C值的變化是很大的。 例如在哺乳類(lèi)、鳥(niǎo)類(lèi)和爬行類(lèi)的 C值變化范圍都很小，而在兩棲類(lèi)中這種變化范圍增大，而植物的 C值變化范圍更為寬廣，常成倍成倍地增加。 二 、 細(xì)菌的基因組及特點(diǎn) （ 一 ） 組成：細(xì)菌染色體和質(zhì)粒 （ 二 ） 細(xì)菌基因組的特征 1. 基因組相對(duì)較小 （ 如 Ecoli, 106bp， 4000個(gè)基因 ） ， 只有一個(gè)復(fù)制啟始位點(diǎn) 。 3. 基因是連續(xù)的：結(jié)構(gòu)基因中沒(méi)有內(nèi)含子（ intron）成分，在轉(zhuǎn)錄后不需剪接加工，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的壽命較短。 6. 結(jié)構(gòu)基因是單拷貝， rRNA基因是多拷貝。 （三）質(zhì)粒 (plasmid) 質(zhì)?；蚩删幋a多種重要的生物學(xué)性狀： 1)致育質(zhì)粒（ F質(zhì)粒）與有性生殖功能關(guān)聯(lián) 2)耐藥性質(zhì)粒 編碼細(xì)菌對(duì)抗菌藥物或重金屬鹽類(lèi)的耐藥性。 3． 除了反轉(zhuǎn)錄病毒以外，一切病毒基因組都是單倍體，每個(gè)基因在病毒顆粒中只出現(xiàn)一次。不翻譯區(qū)通常是基因表達(dá)的調(diào)控序列 8. 調(diào)控序列可以被宿主細(xì)胞所識(shí)別，其遺傳密碼和基因組的結(jié)構(gòu)必須與宿主體系相匹配 五 、 真核生物基因組的特點(diǎn) 1. 基因組含有更大的 DNA分子 ， 以染色體形式儲(chǔ)存于細(xì)胞核內(nèi) ， 除配子細(xì)胞外 ， 體細(xì)胞內(nèi)的基因的基因組是雙份的 。 （ 2） 同一類(lèi)復(fù)雜性差不多 ， 形態(tài)也相似的生物 ， 理論上其基因組也應(yīng)比較接近 ， 其實(shí)不然 。 3. 基因是不連續(xù)的 。s NetWatch column, offering views of the plete vascular anatomy of the developing zebrafish. WashUZebrafish Genome Resources Project 水生動(dòng)物基因組 : 美國(guó)農(nóng)業(yè)部在上世紀(jì) 90 年代初已開(kāi)始資助 個(gè)別 水產(chǎn) 養(yǎng)殖動(dòng)物的基因組研究 并在 1997 年 9 月正式啟動(dòng)了較為全面的水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物的基因組計(jì)劃 選 5 種水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物 斑點(diǎn)叉尾 ( Ictalurus punctatus) 虹鱒 ( Onchorhynchus mykiss) 羅非魚(yú) ( Oreochromis niloticus) 太平洋對(duì)蝦 ( Penaeus vannamei ) 牡蠣 ( Crassostrea gigas) 水生動(dòng)物基因組