第十章微生物分類及鑒定幫助你理清基本概念，規(guī)律-wenkub
2023-04-22 04:00:57 本頁(yè)面
【正文】 統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第一版中，主要根據(jù)表型特征將全部原核生物分為33組。當(dāng)同種或同亞種不同菌株之間的性狀存在差異，不足以分為新的亞種時(shí)，可以細(xì)分為不同的型。純培養(yǎng)(pure culture): 單一微生物細(xì)胞繁殖產(chǎn)生的培養(yǎng)物.(6). 菌株(strain)：在一個(gè)特定分類學(xué)中至少與其他一些群體是可以區(qū)別的生物群體。通常是把具有某些共同特征或密切相關(guān)的種歸為一個(gè)高一級(jí)的分類單元，稱之屬。當(dāng)某一個(gè)種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定的變異特征或遺傳性狀而又不足以區(qū)分成新種時(shí)，可以將這些菌株細(xì)分成兩個(gè)或更多的小的分類單元亞種。在這里，“生殖隔離”被看作是區(qū)分物種的標(biāo)準(zhǔn)。命名(nomenclature)：給予分類類群?jiǎn)卧c公布規(guī)則相符的名稱.2. 分類單元及其等級(jí)分類單元(taxon,復(fù)數(shù)taxa)：是指具體的分類群，如： 原核生物界(Procaryotae)、桿菌科(Enterobacteriaceae)、 枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)等都分別代表一個(gè)分類單元。 國(guó)際公認(rèn)的7個(gè)生物分類單元:界(亞界 ), 門 (亞門 ), 綱(亞綱 ), 目(亞目 ), 科(亞科 ), 屬(亞屬 ), 種(亞種 ). 除此之外, 在M的分類中, 還常使用一些非正式的類群術(shù)語, 亞種以下常用培養(yǎng)物、菌株、居群和型；種以上常使用群、組、系等類群名稱 ；近年伍斯 還在界之上使用域(domain)，他把全部生物分為古生菌域、細(xì)菌域和真核生物域，域下面再 分界，把域作為分類單元的最高等級(jí)。 微生物的種：菌株的一個(gè)集合，這批菌株有許多共同穩(wěn)定特征，并與其他類菌株有顯著區(qū)別。變種是亞種的同義詞。(4). 科(family): 系統(tǒng)分類中，把具有某些共同特征或相關(guān)的屬歸為更高一級(jí)的分類單元稱為科。是來自單個(gè)或純培養(yǎng)物的微生物，一個(gè)種內(nèi)菌株間在許多方面有小差別。由于type一詞既代表型又可代表模式 ，為避免混淆，現(xiàn)在對(duì)表示型的詞作了修改，用var代替type。將假單胞菌屬(Pseudomonas)內(nèi)的90個(gè)種分為5組。 科(以及高于科的分類單元)的命名模式是模式屬.(3). 新名稱的合格發(fā)表: 國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)規(guī)定,對(duì)于一個(gè)新名稱的有效發(fā)表,必須在International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)上發(fā)表, 或其他雜志發(fā)表后，必須向IJSEM遞交論文拷貝，同時(shí)將該菌株培養(yǎng)物保存在美國(guó)ATCC或德國(guó)DSMZ。 4. 細(xì)菌分類系統(tǒng)Bergey’s ManualBergey’s Manual of Determinative Bacteriology1923年賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授David Bergy和四個(gè)同事發(fā)表了細(xì)菌分類法,至1994年,發(fā)行了第9版. 從1974年的第8版開始,已經(jīng)成為世界通用的“官方的分類”。芽孢(有無芽孢、形狀、著生位置、孢囊是否膨大)孢子(孢子形狀、著生位置、數(shù)量及排列)。 3. 血清型和噬菌體型(1).血清型: 細(xì)菌細(xì)胞和病毒等都含有蛋白質(zhì)、脂蛋白、脂多糖等具有抗原性的物質(zhì)方法:凝集反應(yīng)。酶聯(lián)免疫等抗原性組分:全細(xì)胞、細(xì)胞壁、鞭毛、莢膜或粘液層、純化的蛋白質(zhì) (以比較不同細(xì)菌同源蛋白質(zhì)之間的結(jié)構(gòu)相似性) 。(2) 噬菌體型噬菌體對(duì)宿主的感染和裂解作用常具有高度的特異性，即一種噬菌體往往只能感染和裂解某種細(xì)菌，甚至只裂解種內(nèi)的某些菌株。對(duì)于屬以上分類單元的分類或鑒定效果較差。 CsCl浮力密度離心法(3). 染色體DNA分析Chromosomal fingerprintsRandom amplified polymorphic DNA (RAPD,隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性, 910mer, Williams JGK 1990) Arbitrary primerPCR ( APPCR,任意引物PCR ,20mer, Welsh J 1990)DNA amplification fingerprinting (DAF, DNA擴(kuò)增指紋, 521mer, CaetanoAnolles,1991)(4). 核酸雜交探
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