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第十章微生物分類及鑒定幫助你理清基本概念,規(guī)律(完整版)

2025-05-13 04:00上一頁面

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【正文】 最高等級。變種是亞種的同義詞。是來自單個或純培養(yǎng)物的微生物,一個種內菌株間在許多方面有小差別。將假單胞菌屬(Pseudomonas)內的90個種分為5組。 4. 細菌分類系統(tǒng)Bergey’s ManualBergey’s Manual of Determinative Bacteriology1923年賓夕法尼亞大學的細菌學教授David Bergy和四個同事發(fā)表了細菌分類法,至1994年,發(fā)行了第9版. 從1974年的第8版開始,已經成為世界通用的“官方的分類”。 3. 血清型和噬菌體型(1).血清型: 細菌細胞和病毒等都含有蛋白質、脂蛋白、脂多糖等具有抗原性的物質方法:凝集反應。(2) 噬菌體型噬菌體對宿主的感染和裂解作用常具有高度的特異性,即一種噬菌體往往只能感染和裂解某種細菌,甚至只裂解種內的某些菌株。 CsCl浮力密度離心法(3). 染色體DNA分析Chromosomal fingerprintsRandom amplified polymorphic DNA (RAPD,隨機擴增多態(tài)性, 910mer, Williams JGK 1990) Arbitrary primerPCR ( APPCR,任意引物PCR ,20mer, Welsh J 1990)DNA amplification fingerprinting (DAF, DNA擴增指紋, 521mer, CaetanoAnolles,1991)(4). 核酸雜交探針(probe)核酸探針(probe)是指能識別特異核苷酸序列的、帶標記的一段單鏈DNA或RNA分子。 寡核苷酸探針。? (4)16SrRNA (18SrRNA) 普遍存在于真核生物和原核生物中因此它可以作為測量各類生物進化的工具(分子尺)。 231。②進行特征測定或從文獻中收集有關OTU的各項特征的資料;③根據所編制的計算機程序要求,將特征資料進行編碼、標準化并輸入計算機;④由計算機計算各OTU之間的相似性并根據相似性的數(shù)值進行聚類分析、分群歸類;⑤輸出分類結果。8 / 8。大量的數(shù)值分類系統(tǒng)采用相似系數(shù)方法。試驗時加入待檢測的某一種菌液,培養(yǎng)248小時,觀察鑒定卡上各項反應,按判定表判定試驗結果,用此結果編碼,查檢索表(根據數(shù)碼分類鑒定的原理編制成),得到鑒定結果,或將編碼輸入計算機,用根據數(shù)碼分類鑒定原理編制的軟件鑒定,打印出結果。 特征序列或序列印記(signature sequence):通過對rRNA全序列資料的分析比較(特別是采用計算機)發(fā)現(xiàn)的在不同種群水平上的特異特征性寡核苷酸序列,或在某些特定的序列位點上出現(xiàn)的單堿基印記。(5). rRNA的序列分析 生物大分子蛋白質、RNA和DNA序列,被看作是分子計時器(molecular chronometers)或進化鐘(evoluti onary clock),它們真實地記錄了各種生物的進化過程。根據特異性的不同,在微生物鑒定與檢測中的作用也不同,有的探針只用于某一菌型的檢測,有的可能用于某一種、屬、科甚至更大類 群范圍的微生物的檢測或鑒定。 噬菌斑測定 4. 蛋白質分析,就會產生特征性的電泳區(qū)帶組成的電泳圖譜,親緣關系相近的菌株,它們的圖譜也應相似。 補體結合。 伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第一版分類大綱p326伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第二版分類大綱 p327從1984年伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第一版開始發(fā)行以來,細菌分類已取得了巨大進展,新命名的種成倍增加、新描述的屬也在170個以上,尤其是80年代末以來,rRNA、DNA、蛋白質序列分析方法日趨實用,因而為細菌的系統(tǒng)發(fā)育積累了不少新的資料。屬名+ 種名加詞 + subsp. 亞種名加詞 Alcaligenes denitrificans subsp. xylosoxydans 反硝化產堿桿菌氧化木糖亞種 Bacillus subtilus subsp. nigar 枯草芽孢桿菌黑色亞種? 屬級以上分類單元的名稱 :特定的詞尾目 ales Rickettsiales(立克次
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