第十章微生物分類及鑒定幫助你理清基本概念，規(guī)律-文庫吧在線文庫
【正文】 的耐受性或嗜鹽性(9)對抗生素及抑菌劑的敏感性: 對抗生素、氰化鉀(鈉)、膽汁、弧菌抑制劑或某些染 料的敏感性(10)代謝產(chǎn)物:各種特征性代射產(chǎn)物 (11)與宿主的關(guān)系: 共生、寄生、致病性等值得強調(diào)的是，由于不少生理生化特征是染色體外遺傳因子編碼的、加上影響生理生化特征表達的因素比較復(fù)雜，所以根據(jù)生理生化特征來判斷親緣關(guān)系進行系統(tǒng)分類時，必須與其他特征特別是基因型特征綜合分析，否則就可能導(dǎo)致錯誤的結(jié)論。血清型的劃分在流行病的研究中有重要意義。常用方法：熔點溫度（Tm）測定法。 cDNA探針。如細菌5SrRNA（約含120個核苷酸）、16SrRNA(約含1540個核苷酸)、23SrRNA (約含2900個核苷酸)。(2). 磷酸類脂類分析：CM上的磷酸類脂5型PE 磷酯酰乙醇胺PME 磷酯酰甲基乙醇胺PC 磷酯酰膽堿PG 磷酯酰甘油Glu Nu 含葡萄糖胺未知結(jié)構(gòu)的磷酸類脂(3). 枝菌酸分析：諾卡氏型放線菌（CW IV型）細胞抽提物中高分子脂肪酸 β α R1CHCHCOOH 231。OTU確定后即選擇分類特征，數(shù)值分類要求特征函蓋面廣, 數(shù)目多(50100以上)。? 局限: 計算機用于微生物鑒定嚴格說目前應(yīng)是輔助鑒定，因為它不能代替人進行微生物特征的試驗，而取得原始數(shù)據(jù)資料。(4)．?dāng)?shù)值分類的優(yōu)點和局限:? 存貯、分析、處理極為錯綜復(fù)雜的龐大數(shù)據(jù)。Microbial ID/Characterization（Carbon source metabolic fingerprints）The Biolog Systems can rapidly identify over 1,900 species of aerobic and anaerobic bacteria, yeasts, and fungi. 2. 數(shù)值分類(numerical taxonomy)(1). 數(shù)值分類法：通過廣泛比較分類單位的性狀特征，然后計算它們之間的相似性，再根據(jù)相似性的數(shù)值劃分類群的一種分類方法。特征序列有助于迅速確定某種微生物的分類歸屬，或建立新的分類單位。因此，我們可以通過比較不同類群的生物大分子序列的改變量來確定它們彼此系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性或進化距離。? 染色體基因組174。蛋白質(zhì)指紋圖(protein profiles，protein fingerprinting)，已成功地應(yīng)用于種和種以下分類和鑒定。直接或間接的免疫熒光抗體技術(shù)。伯杰氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊第二版中更多地采用了核酸序列資料對分類群進行新的調(diào)整，無疑這是細菌系統(tǒng)發(fā)育分類的重大進展. 二. 微生物分類鑒定的特征和技術(shù)1987年, Wayne等提出:一個種的所有菌株DNA的相似性接近或大于70%, DTm≤5℃(一個正式的微生物種的分子學(xué)定義)1990年, Murry等提出,再確切的分類應(yīng)該依據(jù)于分子學(xué)特征.1. 形態(tài)學(xué)特征(1)培養(yǎng)特征: 最重要是菌落特征：如菌落的形狀、大小、顏色、隆起、表面狀況、質(zhì)地、光 澤、水溶性色素等 .(2)細胞形態(tài): 形態(tài)(球形、桿狀、弧形、螺旋形、絲狀、分枝及特殊形狀)大小(其中最重要的是細胞的寬度或直徑)排列(單個、成對、成鏈或其他特殊排列方式)(3)特殊的細胞結(jié)構(gòu): 鞭毛(有無鞭毛、著生位置及其數(shù)量)。 屬和亞屬的命名模式是模式種。當(dāng)同種或同亞種不同菌株之間的性狀存在差異，不足以分為新的亞種時，可以細分為不同的型。通常是把具有某些共同特征或密切相關(guān)的種歸為一個高一級的分類單元，稱之屬。在這里，“生殖隔離”被看作是區(qū)分物種的標(biāo)準(zhǔn)。 國際公認的7個生物分類單元:界(亞界 ), 門 (亞門 ), 綱(亞綱 ), 目(亞目 ), 科(亞科 ), 屬(亞屬 ), 種(亞種 ). 除此之外, 在M的分類中, 還常使用一些非正式的類群術(shù)語, 亞種以下常用培養(yǎng)物、菌株、居群和型；種以上常使用群、組、系等類群名稱 ；近年伍斯 還在界之上使用域(domain)，他把全部生物分為古生菌域、細菌域和真核生物域，域下面再 分界，把域作為分類單元的
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