【正文】 態(tài)不是一成不變的，受環(huán)境條件影響（如溫度、培養(yǎng)基濃度及組成、菌齡等） 　　　　 異常形態(tài)　　　　 一般，幼齡，生長(zhǎng)條件適宜，形狀正常、整齊。是細(xì)菌中種類(lèi)最多的?！　　　?細(xì)菌是單細(xì)胞的，大小在1um左右，1000倍以上顯微鏡才能看到其形狀。 近年來(lái)，采用紅外、核磁、電鏡等新技術(shù)越來(lái)越廣泛?！　　　?每一菌株為一操作單位，確定很多特征（5060 個(gè)）　　　　 比較菌株間的最大相似性　　　　 陽(yáng)性和陰性符合的總和　　　　 100%　　　　 總的測(cè)定數(shù) 無(wú)效測(cè)定數(shù)　　　　 85%為同種，65%為同屬　　　　 據(jù)數(shù)值繪出矩陣圖并轉(zhuǎn)換成樹(shù)狀譜?！　　　?生活史　　　　 血清學(xué)反應(yīng)　　　　 近年又發(fā)展了紅外光譜，GC含量，DNA雜交等?！　　　?未確定種名或不指特定的種時(shí)?！　　　?（二）命名　　　　 命名按照《國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)》,采用林奈氏雙名法。　　 抗生素工業(yè)　　 酶制劑工業(yè)　　 氨基酸工業(yè)　　 酵母工業(yè)　　 多糖工業(yè)：黃原膠、右旋糖苷、等等　　石油發(fā)酵　　 1生物活性物質(zhì)：核酸類(lèi)、維生素等　　 1其它：微生物農(nóng)藥、沼氣發(fā)酵、生物制品（菌苗、疫苗）　　　　 4節(jié)：微生物分類(lèi) Microbial taxonomy　　　　 分類(lèi)主要是探索生物之間的親緣關(guān)系，把它們歸納為互相聯(lián)系的不同類(lèi)群。 1953，Watson amp。 Ivanovsky 發(fā)現(xiàn)煙草花葉病毒?！　　　?其他人　　　　 Serge Winogradsky,18561953,發(fā)現(xiàn)微生物的自養(yǎng)生活?！　　　?柯赫準(zhǔn)則　　　　 某一種微生物，當(dāng)被懷疑是病原體時(shí)，它一定伴隨著病害而存在?！　　　?觀察丁酸發(fā)酵時(shí)，發(fā)現(xiàn)厭氧生命，提出好氧、厭氧術(shù)語(yǔ)?！　　　?Pasteur 1877研究了雞霍亂、炭疽病和恐水病，發(fā)現(xiàn)鈍化病原體可以誘發(fā)免疫性和預(yù)防疾病。 加熱過(guò)的空氣通入汁液（煮沸過(guò)）并不導(dǎo)致微生物生長(zhǎng)。　　　　 已進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)：1665年，F(xiàn)racesco Redi 腐肉生蛆實(shí)驗(yàn)，否定了動(dòng)物自生說(shuō)?！　　　?微生物學(xué)的奠基生理學(xué)時(shí)期　　　　 Louis Pasteur，18221895　　　　 他的一生給人類(lèi)生活帶來(lái)了史無(wú)前例的影響。 歌德　　　　 中國(guó)古代　　　　 酒文化，儀狄作酒，禹飲而甘之。遺傳物質(zhì)易變異?！　　　?生長(zhǎng)旺、繁殖快　　　　 極高生長(zhǎng)繁殖速度，如E. coli 2030分鐘分裂一次，若不停分裂，1043 . 菌數(shù)增加，營(yíng)養(yǎng)消耗，代謝積累，限制生長(zhǎng)速度。　　　　 這一特點(diǎn)也是微生物與一切大型生物相區(qū)別的關(guān)鍵所在。四、微生物特點(diǎn)　　　　 生命基本特征：　　　　 生命通過(guò)它的耐久性、適應(yīng)性、它的生長(zhǎng)及修復(fù)的能力和它的繁殖而延續(xù)下去，這是生命的基本的和普遍的特征。隨后他又對(duì)包括某些真核生物在內(nèi)的大量菌株進(jìn)行了16Sr RNA(18SrRNA)序列的分析比較，又發(fā)現(xiàn)極端嗜鹽菌和極端嗜酸嗜熱菌也和產(chǎn)甲烷細(xì)菌一樣， 具有既不同其他細(xì)菌也不同于其核生物的序列特征，而它們之間則具有許多共同的序列特征。植物界 Plantae：具有細(xì)胞壁，不運(yùn)動(dòng)，可行光合作用。周德慶微生物學(xué)筆記第一節(jié)：微生物學(xué)的研究對(duì)象與任務(wù) 一、微生物的含義（什么是微生物）非分類(lèi)學(xué)上名詞，來(lái)自法語(yǔ)Microbe一詞。三界：原生生物界 Protista：（E. H. Haeckel, 1866年提出） 五界系統(tǒng) R. H. Whitakker, Science, 163: 150160, 1969原核生物界 Monera：細(xì)菌、放線菌等原生生物界 Protista：藻類(lèi)、原生動(dòng)物、粘菌等真菌界 Fungi：酵母、霉菌動(dòng)物界 Animalia：植物界 Plantae：五界系統(tǒng)是以細(xì)胞結(jié)構(gòu)分化的等級(jí)以及和光合、吸收、攝食這三種主要營(yíng)養(yǎng)方式有關(guān)的組織類(lèi)型為基礎(chǔ)的。于是提出將生物分成為三界(Kingdom)(后來(lái)改稱(chēng)三個(gè)域)：古細(xì)菌、真細(xì)菌( Eubacteria)和真核生物(Eukaryotes)?！　　　?新陳代謝，包括外部的和內(nèi)部的，是一切生命的另一基本特征?！　　　?特點(diǎn)1舉例　　　　 乳酸桿菌：120，000　　　　 雞蛋：　　　　 人（200磅）： 　　　　 吸收多、轉(zhuǎn)化快　　　　 這一特性為高速生長(zhǎng)繁殖和產(chǎn)生大量代謝物提供了充分的物質(zhì)基礎(chǔ)。 這一特性可在短時(shí)間內(nèi)把大量基質(zhì)轉(zhuǎn)化為有用產(chǎn)品，縮短科研周期?！　　　?分布廣、種類(lèi)多　　　　 分布區(qū)域廣，分布環(huán)境廣。《書(shū)經(jīng)》若作酒醴，爾惟曲蘗（nie）《齊民要術(shù)》提倡輪作制?！　　　?（1）證實(shí)了微生物活動(dòng)和否定了微生物自然發(fā)生學(xué)說(shuō)?！　　　?Spallanzani實(shí)驗(yàn)，充分加熱的有機(jī)汁液中長(zhǎng)出微生物原因是由于空氣將微生物帶進(jìn)了汁液，因而采取完全密封隔絕的封閉法。 在一封閉容器內(nèi)，對(duì)完全滅菌的汁液加上一些收集到的微生物，無(wú)例外地引起微生物生長(zhǎng)?！　　　?發(fā)酵研究　　　　 相信一切發(fā)酵作用都和微生物的存在及繁殖有關(guān)?！　　　?Robert Koch 18431910　　　　 建立微生物學(xué)研究基本技術(shù)　　　　 （1）分離和純化細(xì)菌：劃線法，混合倒平板法。 必須能自原寄主分離出這種微生物，并培養(yǎng)成為純培養(yǎng)。 Beijerinck M. W.,18511931，發(fā)現(xiàn)了非共生固氮菌。 P. Ehrlich 現(xiàn)代化療的開(kāi)始　　　　 現(xiàn)代微生物學(xué)發(fā)展分子生物學(xué)階段　　　　 現(xiàn)代發(fā)酵工業(yè)的形成：1941，F(xiàn)lorey amp。 Crick 提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)以及半保留復(fù)制假說(shuō)?！　　　?具體任務(wù)就是分類(lèi)、鑒定和命名?！　　　?屬名 + 種名 +命名人　　　　 如大腸桿菌: Escherichia coli (Migula) Castellani amp?！　　　?舉例　　　　 真菌界 Fungi 真菌門(mén) Eumycophyta 子囊菌綱 Asycetes　　　　 原子囊亞綱 Protoasycetes 內(nèi)孢霉目 Endomycetales　 內(nèi)孢霉科 Endomycetaceae　　　　 酵母亞科 Sacchromycetoideae 酵母屬 Sacchromyces 釀酒酵母 S. cerevisiae Hansen　　　　 二、分類(lèi)依據(jù)　　　　 形態(tài)特征（個(gè)體和群體） 　　　　 細(xì)胞形態(tài)：形狀、大小、排列、染色反應(yīng)等?！　　　?三、分類(lèi)方法　　　　 （一）經(jīng)典分類(lèi)法　　　　 隨機(jī)地和不系統(tǒng)地根據(jù)一些特征進(jìn)行分類(lèi)?！　　　?（三）分子與遺傳方法　　　　 DNA堿基組成：GC%　　　　 相同不能說(shuō)明是同種，但不同則肯定不是同種。　　　　 四、分類(lèi)系統(tǒng)　　　　 原核生物：　　　　 《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》第8版，1973《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第9版，1984　　　　 真菌：Ainsworth (1973)系統(tǒng) 酵母：Lodder分類(lèi)系統(tǒng)　　　　 菌種鑒定工作三部曲　　　　 獲得該微生物的純培養(yǎng) 測(cè)定一系列必要的鑒定指標(biāo) 查找權(quán)威性鑒定手冊(cè)　　　　 一章：微生物類(lèi)群與形態(tài)結(jié)構(gòu)　　　　 非細(xì)胞型：病毒　　　　 細(xì)胞型：原核微生物：細(xì)菌、放線菌等，　　　　 無(wú)明顯核，也無(wú)核膜、核仁?！　　　?一、細(xì)菌的形態(tài)和大小　　　　 （一）基本形態(tài)　　　　 球菌 Coccus：球形或近球形，根據(jù)空間排列方式不同又分為單、雙、鏈、四聯(lián)、八疊、葡萄球菌?！　　　?螺旋菌 Spirillum：是細(xì)胞呈彎曲桿狀細(xì)菌統(tǒng)稱(chēng)，一般分散存在。老齡，不正常，異常形態(tài)?！　　　?細(xì)胞重量10131012g ，每g細(xì)菌二、細(xì)菌細(xì)胞結(jié)構(gòu)　　　　 研究細(xì)菌細(xì)胞結(jié)構(gòu)是分子生物學(xué)重要內(nèi)容之一，有了電子顯微鏡才有可能?！　　　?（一）基本結(jié)構(gòu)　　　　 細(xì)胞壁 cell wall：位于細(xì)胞表面，較堅(jiān)硬，略具彈性結(jié)構(gòu)。 凡是經(jīng)乙醇脫色，呈復(fù)染劑顏色，稱(chēng)為革蘭氏陰性菌 G.　　　　 結(jié)果不同主要是細(xì)胞壁組成及結(jié)構(gòu)差異造成的。1，4糖苷鍵相連而成。根據(jù)多元醇不同，有甘油型、核糖醇型等5種類(lèi)型。　　　　 與G+區(qū)別：交聯(lián)低；DAP取代 LLys；肽橋?！　　　?脂多糖 lipopolysaccharide LPS　　　　 G特有成分。　　　　 （3）細(xì)胞壁缺陷細(xì)菌　　 原生質(zhì)體protoplast：人工條件下用溶菌酶除去細(xì)胞壁或用青霉素抑制細(xì)胞壁合成后，所留下的部分。 特點(diǎn)：對(duì)滲透壓敏感；長(zhǎng)鞭毛也不運(yùn)動(dòng)；對(duì)噬菌體不敏感；細(xì)胞不能分裂等。厚78nm?！　　　?間體 mesosome(中質(zhì)體）　　　　 細(xì)胞膜內(nèi)陷形成。 特點(diǎn)：無(wú)核膜、核仁、固定形態(tài)，結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單，細(xì)胞分裂前核分裂?！　　　?原核：游離態(tài)、多聚核糖體，70S　　　　 真核：游離態(tài)、結(jié)合內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上，70、80S　　　　 多聚核糖體：一條mRNA與一定數(shù)目的單個(gè)RS結(jié)合而成。　　　　 不同細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)，含不同內(nèi)含物，是細(xì)胞的貯藏物質(zhì)或代謝產(chǎn)物。 成分：90%以上為水，余為多糖（肽）。電鏡或特殊染色法觀察，懸滴法觀察運(yùn)動(dòng)?！　　　?趨性運(yùn)動(dòng)：栓菌實(shí)驗(yàn)　　　　 菌毛fimbria (pilus )：許多G尤其是腸道菌，表面有比鞭毛更細(xì)，數(shù)目多， ,長(zhǎng)23um?！?芽孢結(jié)構(gòu)、形成、萌發(fā)（自學(xué)）　　　　 伴孢晶體　　　　 孢囊 cyst，等等。　　　　 純培養(yǎng)：克隆clone　　　　 菌苔lawn　　　　 四、常見(jiàn)常用細(xì)菌　　　　 細(xì)胞結(jié)構(gòu)、菌落特點(diǎn)、代謝產(chǎn)物等。突出特性是產(chǎn)各種抗生素。　　　　 孢子形成方式：橫隔分裂　　　　 孢囊孢子　　　　 放線菌生活史（發(fā)育周期）　　　　 三、代表屬及常見(jiàn)菌　　　　 （一）鏈霉菌屬 Streptomyces　　　　 90%抗生素，菌絲發(fā)育良好?！　　　?（五）鏈孢囊菌屬Streptosporangium　　　　 形成孢子囊，孢囊孢子。細(xì)胞球狀或桿狀，不運(yùn)動(dòng)。G，可濾過(guò)?？蔀V過(guò)，專(zhuān)性活細(xì)胞內(nèi)寄生。由于抵抗力和固氮能力，可在貧瘠沙灘荒巖上生長(zhǎng)，稱(chēng)為 　　　　 先鋒生物 。第一種 家養(yǎng)微生物 ，與人類(lèi)關(guān)系密切。 大小在15um X 530um之間。由于有細(xì)胞器分化，功能不及細(xì)菌多，主要是調(diào)節(jié)滲透壓、吸收營(yíng)養(yǎng)、分泌代謝物等　　　　 細(xì)胞質(zhì)及內(nèi)含物　　　　 細(xì)胞核：真核：雙層單位膜，大量核孔，可見(jiàn)染色體，一個(gè)或幾個(gè)核仁，核膜外有中心體?！　　　?環(huán)狀 2um質(zhì)粒 ：外源DNA載體?！　　　?有性繁殖　　　　 產(chǎn)生子囊和子囊孢子。僅有一個(gè)雙倍體生活，單倍體短?！　　　?一、形態(tài)和構(gòu)造　　　　 營(yíng)養(yǎng)體由菌絲（hyphae)構(gòu)成，直徑310um，菌絲再形成菌絲體（mycelium）　　　　 菌絲：無(wú)隔，多核單細(xì)胞，低等真菌　　　　 有隔，多細(xì)胞，高等真菌　　　　 菌絲體：營(yíng)養(yǎng)菌絲，伸入培養(yǎng)基吸收營(yíng)養(yǎng)　　　　 氣生菌絲，向空中生成，形成繁殖器官。子實(shí)體、子囊果　　　　 擔(dān)孢子：擔(dān)子菌特征 　　　　 （二）生活史　　　　 霉菌指從一種孢子開(kāi)始，經(jīng)過(guò)一定的生長(zhǎng)和發(fā)育，最后又形成同一種孢子為止。通常栽培的僅10多種。　　　　 栽培：發(fā)展栽培同時(shí)，重視采用菌絲體的深層培養(yǎng)，特別是風(fēng)味特殊而鮮美的種類(lèi)。　　　　 應(yīng)用：食用子實(shí)體、菌絲體深層培養(yǎng)。目前認(rèn)為抗癌物質(zhì)主要是多糖，如香菇多糖、銀耳酸性異多糖、蕓芝多糖（PSK）、茯苓多糖、豬苓多糖、靈芝多糖等。病毒的核酸與細(xì)胞型也不同。頭部為廿面體對(duì)稱(chēng)，尾部為螺旋對(duì)稱(chēng)。雙鏈DNA噬菌體三階段轉(zhuǎn)錄：　　　　 遺傳信息轉(zhuǎn)移：　　　　 成熟（裝配）：潛伏期　　　　 裂解（釋放）：裂解期　　　　 上述烈性噬菌體的生長(zhǎng)方式，稱(chēng)為一步生長(zhǎng)?！　　　?溫和性噬菌體：噬菌體侵染宿主后，并不增殖，裂解，而與宿主DNA結(jié)合，隨宿主DNA復(fù)制而復(fù)制，此時(shí)細(xì)胞中找不到形態(tài)上可見(jiàn)的噬菌體，這種噬菌體稱(chēng)為溫和性噬菌體?！　　　?雙層平板法　　　　 單層平板法　　　　 玻片快速法　　　　 效價(jià)（titre），噬菌斑形成單位（pfu）　　　　 （二）防治措施　　　　 消滅phage，杜絕其依賴(lài)生存條件?！　　　?五、亞病毒　　　　 類(lèi)病毒viroid：沒(méi)有衣殼包裹的RNA分子?！　　　?HIV專(zhuān)門(mén)侵犯淋巴細(xì)胞，造成免疫缺陷。　　　　 1節(jié)：營(yíng)養(yǎng)物及其功能　　　　 一、細(xì)胞化學(xué)組成　　　　 整個(gè)生物界大體相同，主要是C、H、O、N（占干重9097%），C（約50%），此外為各種無(wú)機(jī)元素，由這些元素再組成化合物?！　　　?（一）碳源物質(zhì)　　　　 定義：凡能提供微生物營(yíng)養(yǎng)所需碳元素的營(yíng)養(yǎng)源?！　　　?種類(lèi)：維生素、AA、base、FA等?！　　　?無(wú)機(jī)元素來(lái)源與功能：　　　　 一些無(wú)機(jī)元素加入鹽：　　　　 （六）水　　　　 存在狀態(tài)：游離態(tài)（溶媒）和結(jié)合態(tài)（結(jié)構(gòu)組成）　　　　 生理作用：組成成分；反應(yīng)介質(zhì)；物質(zhì)運(yùn)輸媒體；熱的良導(dǎo)體。　　　　 營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型劃分不是絕對(duì)的，不同生活條件下，可相互轉(zhuǎn)變?！　　　?脂溶性物質(zhì)：易透過(guò)　　　　 離子化合物：弱快強(qiáng)慢（極性）　　　　 一、營(yíng)養(yǎng)物吸收　　　　 單純擴(kuò)散 simple diffusion　　　　 依靠胞內(nèi)外溶液濃度差，順濃度梯度運(yùn)輸，不消耗代謝能，無(wú)特異性。硫酸根、磷酸根、糖（真核）　　　　 主動(dòng)運(yùn)輸 active transport　　　　 吸收營(yíng)養(yǎng)物的主要機(jī)制?！　　　?基團(tuán)轉(zhuǎn)位 group translocation　　　　 屬主動(dòng)運(yùn)輸，但溶質(zhì)分子發(fā)生化學(xué)修飾定向磷酸化。 　　　　 二、代謝物分泌