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生物化學(xué)第二章蛋白質(zhì)化學(xué)課件3lijianbing(已修改)

2025-08-13 17:45 本頁面
 

【正文】 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 一 、 一級結(jié)構(gòu)及其特征 二 、 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定方法 三 、 二級結(jié)構(gòu)及其特征 四 、 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的類型及其特點(diǎn) 小結(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 有一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、 三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu) 小結(jié) 直接法 測定一級結(jié)構(gòu)的 要點(diǎn) a. 測定蛋白質(zhì)的分子量及其氨基酸組分 。 b. 斷裂多肽鏈內(nèi)的二硫鍵 。 c. 測定肽鍵的 N-末端和 C-末端 。 d. 應(yīng)用兩種或兩種以上的肽鍵內(nèi)切酶分別在多肽鍵的專一位點(diǎn)上斷裂肽鍵;也可用溴化氰法專一性地?cái)嗔鸭琢虬彼嵛稽c(diǎn) , 從而得到一系列大小不等的肽段 。 e. 分離提純所產(chǎn)生的肽段 , 并分別測定它們的氨基酸順序 。 f. 將這些肽段的順序進(jìn)行跨切口重疊 , 進(jìn)行比較分析 , 推斷出蛋白質(zhì)分子的全部氨基酸序列 。 Edman降解法 肽段的氨基酸序列測定方法 小結(jié) 研究核酸、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的意義 生物的遺傳信息儲存于 DNA的核苷酸序列中,蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由相應(yīng)的 DNA序列決定的,每一種蛋白質(zhì)分子所具有的特定的一級結(jié)構(gòu)又決定了其高級結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,也就表現(xiàn)出特定的生命現(xiàn)象。因此,研究核酸、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)可破譯生命的密碼,是在分子水平認(rèn)識生命的突破口。 小結(jié) α-螺旋 主要特點(diǎn) 1. 每圈螺旋含 ,沿螺旋方向上升 ; 2. ?螺旋中氨基酸殘基側(cè)鏈伸向外側(cè); 3. ?螺旋靠氫鍵維持,氫鍵的取向幾乎與中心軸平行; ,亦有少數(shù)左手螺旋存在(不穩(wěn)定);存在尺寸不同的螺旋 。 ?-轉(zhuǎn)角的 特點(diǎn) 存在于球狀蛋白質(zhì)分子表面 ,為非重復(fù)性結(jié)構(gòu); Gly, Pro常存在于 ?-轉(zhuǎn)角處。 無規(guī)卷曲 主要指那些不能被歸入明確的二級結(jié)構(gòu)如?螺旋或 ?-折疊片 的肽段,本身也具有一定的穩(wěn)定性。 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 無規(guī)則卷曲示意圖 無規(guī)則卷曲 細(xì)胞色素 C的三級結(jié)構(gòu) 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 超二級結(jié)構(gòu) supersecondary structure 蛋白質(zhì)中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位(即單個 α -螺旋或 β -折疊或 β -轉(zhuǎn)角)組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辯認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體稱為蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu) 基本組合方式 : αα; β β ; β β β 超二級結(jié)構(gòu)類型 βββ αα β β 1 2 3 4 5 5 2 3 4 1 Β鏈 β αβ β 迂回 回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu) 回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu) β 迂回 超二級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位(即單個 α -螺旋或 β -折疊或 β -轉(zhuǎn)角)組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辯認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體稱為蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu) 基本組合方式: αα; β β ; β β β 重要 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 結(jié)構(gòu)域 structure domain 在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 , 多肽進(jìn)一步卷曲折疊成幾個相對獨(dú)立 、 近似球形的三維實(shí)體 , 再由兩個或兩個以上這樣的三維實(shí)體締合成三級結(jié)構(gòu) , 這種相對獨(dú)立的三維實(shí)體稱為結(jié)構(gòu)域 。 卵溶菌酶的三級結(jié)構(gòu)中的兩個結(jié)構(gòu)域 ?螺旋 ?轉(zhuǎn)角 ?折疊 二硫鍵 結(jié)構(gòu)域 1 結(jié)構(gòu)域 2 重要 在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 , 多肽進(jìn)一步卷曲折疊成幾個相對獨(dú)立 、 近似球形的三維實(shí)體 , 再由兩個或兩個以上這樣的三維實(shí)體締合成三級結(jié)構(gòu) , 這種相對獨(dú)立的三維實(shí)體稱為結(jié)構(gòu)域 。 結(jié)構(gòu)域 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域 形成的意義 ? 動力學(xué)上更為合理; ? 蛋白質(zhì) ( 酶 ) 活性部位往往位于結(jié)構(gòu)域之間 , 使其更具柔性 。 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu) 多肽鍵在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 , 通過側(cè)鏈基團(tuán)的相互作用進(jìn)一步卷曲折疊 , 借助次級鍵維系使α -螺旋 、 β-折疊片 、 β-轉(zhuǎn)角等二級結(jié)構(gòu)相互配置而 形成特定的構(gòu)象 。 三級結(jié)構(gòu)的形成使肽鏈中所有的原子都達(dá)到空間上的重新排布 。 實(shí)例: 肌紅蛋白 核糖核酸酶 肌紅蛋白三級結(jié)構(gòu) 核糖核酸酶三級結(jié)構(gòu)示意圖 N His12 C His119 Lys41 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 維持三級結(jié)構(gòu)的作用力 主要是非共價鍵,即、氫鍵、離子鍵、疏水鍵、范德華力,此外還有二硫鍵。 如果破壞了這些作用力,蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)就被破壞,其生物功能就喪失。 重要 主要是非共價鍵,即、氫鍵、離子鍵、疏水鍵、范德華力,此外還有二硫鍵。 如果破壞了這些作用力,蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)就被破壞,其生物功能就喪失。 維持三級結(jié)構(gòu)的作用力 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) 四級結(jié)構(gòu)是指由相同或不同的稱作亞基 (subunit) 的亞單位按照一定排布方式聚合而成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) , 維持四級結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的作用力是疏水鍵 、 離子鍵 、 氫鍵 、 范得華力 。 亞基本身都具有球狀三級結(jié)構(gòu) , 一般只包含一條多肽鏈 , 也有的由二條或二條以上由二硫鍵連接的肽鏈組成 。 實(shí)例: 血紅蛋白 煙草花葉病毒的外殼蛋白四級結(jié)構(gòu) 血紅蛋白四級結(jié)構(gòu) 煙草花葉病毒外殼蛋白四級結(jié)構(gòu)的自我組裝 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法 (一 ) X射線衍射技術(shù) (Xray diffraction method) X射線( ?= ) 蛋白質(zhì)晶體 ( mm) 原子水平 第四節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法 (二)核磁共振 ( Nuclear magic resonance, NMR) 在原子水平,蛋白質(zhì)溶液
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