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正文內(nèi)容

基因工程原理-文庫吧

2025-12-14 17:52 本頁面


【正文】 酸純化,檢測等一、限制性內(nèi)切酶(一)、限制修飾系統(tǒng)的種類(二)、限制性內(nèi)切酶的定義、命名(三)、限制酶的特點(diǎn)(四)、異源同序酶( isoschizomer,同裂酶)(五)、 限制酶的用途(一)、限制修飾系統(tǒng)的種類1.I型 : 由三個(gè)基因構(gòu)成, hsdR; hsdM; hsdS(hostspecificityforDNArestrictionmodificationandspecificity)位于染色體上,三個(gè)基因構(gòu)成一個(gè)復(fù)合體,限制酶需要 ATP、Mg2+、 SAM(5 — 腺苷甲硫氨酸),無特異切割位點(diǎn)。2.II型 : 限制與修飾基因產(chǎn)物獨(dú)立起作用,在 E . coli中這兩種基因位于質(zhì)粒上。3.III型 : 修飾酶與I型酶相同, hsdM與 hsdS基因產(chǎn)物結(jié)合成一亞單位,限制酶是獨(dú)立存在的。上述三個(gè)系統(tǒng)中,只有 II型限制酶與甲基化酶具有相當(dāng)高的核苷酸識(shí)別特異性,因而被廣泛用于基因工程中。(二)、限制性內(nèi)切酶的定義、命名1.定義 : 廣義指上述三個(gè)系統(tǒng)中的限制酶; 狹義指 II型限制酶。2.命名 : 限制酶由三部分構(gòu)成,即菌種名、菌系編號(hào)、分離順序?!±纾?HindⅢ   前三個(gè)字母來自于菌種名稱H. influenzae, “ d ” 表示菌系為d型血清型; “Ⅲ” 表示分離到的第三個(gè)限制酶。EcoRI— Escherichia coliRIHindⅢ — Haemophilusinfluensae dⅢSacI(II)— Streptomycesachromagenes I(Ⅱ )(三)、限制酶的特點(diǎn)1.識(shí)別順序和酶切位點(diǎn)1)識(shí)別4 8個(gè)相連的核苷酸MboINGATCN; AvaIIGG(A/T)CC BamHIGGATCC: PpuMIPuGG(A/T)CCPy NotIGCGGCCGC; SfiIGGCCNNNNNGGCCCCGGN’N’N’N’N’CCGG FokI5’GGATG (N )93’3’CCTAC (N )135’外側(cè),產(chǎn)生5 ’端突起2)富含GC3)對稱性 — 雙 對稱EcoRI5’GAATTC3’3’CTTAAG5’4)切點(diǎn)大多數(shù)在識(shí)別順序之內(nèi),也有例外5)限制酶切后產(chǎn)生兩個(gè)末端,末端結(jié)構(gòu)是5 ’P和3 ’OH2.末端種類1) 3 ’端突起 ,個(gè)數(shù)為2或4個(gè)核苷酸Pst I5’CTGCAG3’5’CTGCAG3’3’GACGTC5’3’GACGTC5’2) 5 ’端突起 ,個(gè)數(shù)為2或4個(gè)核苷酸 EcoRI5’GAATTC3’5’GOHPAATTC3’3’CTTAAG5’3’CTTAAPHOG5’粘性末端能與另一個(gè)相同的粘連末端相連接,任何兩個(gè)具有相同識(shí)別位點(diǎn)的 DNA分子經(jīng)限制酶切割后能夠重新連接成新的重組 DNA分子。在進(jìn)行 DNA重組時(shí),應(yīng)用限制酶同時(shí)切割目的基因和載體 DNA,使之產(chǎn)生相對的粘性末端,然后再將二者連接成重組 DNA分子3) 平齊末端SmaI5’CCCGGG3’5’CCCGGG3’3’GGGCCC5’3’GGGCCC5’4)非互補(bǔ)的粘性末端a)切點(diǎn)在識(shí)別順序之外的,如: FokI FokI5’GGATG(N )93’5’GGATG(N)93’CCTAC(N )135’3’CCTAC(N)13b)能識(shí)別簡并順序的,如: AvaIAvaI5’CPyCGPuG3’CCCGGG。CTCGGG。CCCGAG。CTCGAG(四)、異源同序酶(isoschizomer,同裂酶)1.定義:能識(shí)別相同序列但來源不同的兩種或多種限制 酶2.特點(diǎn): 1)識(shí)別相同順序2)切割位點(diǎn)的異同 KpnIGGTACCAsp718GGTACC SstICCGCGGSacICCGCGG(五)、 限制酶的用途1.DNA重組2.限制酶(物理)圖譜繪制3.突變分析( RFLP分析)4.限制酶的部分酶切與完全酶切附: IIS型限制酶的特點(diǎn)1.具有特異型核苷酸順序識(shí)別能力,但該順序不具有對稱結(jié)構(gòu)。2.酶切位點(diǎn)與識(shí)別位點(diǎn)不一致,切點(diǎn)常在識(shí)別位點(diǎn)的一側(cè), 120nt。3.酶切后的末端經(jīng)補(bǔ)平后又可發(fā)生酶切反應(yīng)。4.產(chǎn)生粘性末端可以是 15個(gè)核苷酸。5.均為單體,分子量為 47—108kD 。酶切圖譜的構(gòu)建( a)請構(gòu)建該環(huán)狀DNA分子的酶切圖譜酶切圖譜的構(gòu)建( b)二、 DNA甲基化 酶( 一)、 甲基化酶的種類與識(shí)別順序1.限制修飾系統(tǒng) I、 II、 III型中的甲基化酶三個(gè)系統(tǒng)中的甲基化酶可使細(xì)菌 DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤發(fā)生甲基化,形成 5’甲基胞嘧啶和 6’甲基腺嘌呤。在 DNA重組實(shí)驗(yàn)中,常用的甲基化酶屬于 II型,它與相應(yīng)的限制酶的識(shí)別順序相同,其甲基化位點(diǎn)與限制酶作用位點(diǎn)可同可不同。如: M.EcoRIGAmATTCCEcoRIGAATTC不同M. HpaICmCGGHpaICCGG相同2.II型甲基化酶對限制酶活性的影響 1) 抑制同種限制酶的活性 GGATmCC— BamHI(G?GATCC)GAmATTC— EcoRI(G?AATTC)2) 抑制不同種限制酶的活性a.順序完全重疊 如: M.ClaI( ATCGmAT) TaqI( TCGmA)b.順序邊界重疊 如: M.BamHI( GGATmCC) MepI( mCCGG)3) 抑制不同種限制酶的部分活性M. TaqI( TCGmA) HindII( GTPyPuAC):GTCAAC, GTTAAC, GTCGmAC, GTTGAC3.甲基化酶的用途 1) 改變某些限制酶識(shí)別順序的特異性,以便重組體的形成2) 在建立基因文庫時(shí),可先使 DNA分子部分甲基化,然后再用限制酶切 CH3CH3CH3RE RE RE RE RERE RERERE RERECH3 CH3CH3與載體相連甲基化酶人工接頭 RE用于基因組文庫的建立用于 cDNA的連接RE RE RE三、核酸酶( 一)、外切酶 III( ExoIII)1.一般特點(diǎn): 來自于 ,分子量 28,000kD2.催化反應(yīng)類型1)160
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