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分子生物學(xué) 第二章 基因與基因組-新-文庫吧

2024-12-18 03:39 本頁面


【正文】 成染色體結(jié)構(gòu),此結(jié)構(gòu)又叫 類核體 ,習(xí)慣上仍將其基因組 DNA與支架蛋白組成的結(jié)構(gòu)稱為染色體,有時也將 其核酸分子稱做原核生物染色體 。 原核生物基因組都很小,如大腸桿菌,整個基因組由 (也有說 ) 10 6bp組成,相對分子質(zhì)量為10 9,大約包括 3000~ 4000個基因。所有原核生物的遺傳物質(zhì)均為 DNA。 與病毒相比,原核生物有較完整的代謝系統(tǒng),進行較復(fù)雜的代謝活動,如從外界環(huán)境攝取營養(yǎng)物質(zhì)、對外界環(huán)境的改變做出反應(yīng)等。故原核生物基因組結(jié)構(gòu)基因的數(shù)量和功能遠(yuǎn)多于病毒基因組。 二 .染色體基因 組 的特點1.常僅由一條環(huán)狀雙鏈 DNA分子組成 細(xì)菌染色體的環(huán)化性使得在缺少端粒( telomere) 的情況下,仍能夠完整的復(fù)制。這條環(huán)狀雙鏈 DNA分子在細(xì)胞內(nèi)形成一個較為致密的區(qū)域,稱為類核。類核無核膜與胞漿分開,其中央部分由 RNA和支架蛋白組成,外圍是呈超螺旋狀的雙鏈閉環(huán)染色體 DNA。但現(xiàn)在也發(fā)現(xiàn)有線形基因組。2.只有一個復(fù)制起始點,一個復(fù)制起點 3.具有 操縱子 ( operon)結(jié)構(gòu)。 DNA序列中功能相關(guān)的 RNA或蛋白質(zhì)基因往往前后排列在一起形成一個轉(zhuǎn)錄單位,從同一啟動子開始轉(zhuǎn)錄形成一個多順反子 mRNA, 再被分別表達(dá)成不同的RNA或蛋白質(zhì)。4.基因組的序列絕大部分是用來編碼蛋白質(zhì)的,只有極少部分不轉(zhuǎn)錄,而不轉(zhuǎn)錄部分通常是控制基因表達(dá)的序列。越是簡單的生物,其已知 基因數(shù)越接近于從其 DNA分子量所估計的基因數(shù)。 5.基因是連續(xù)的,無內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄后不需剪接。6.編碼區(qū)在基因組中所占比例遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于真核基因組, 小于病毒基因組 。編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因是單拷貝的 ,而rRNA基因往往是多拷貝的。7. 存在著少量基因重疊的現(xiàn)象。 編碼順序一般不會重疊?;蚪M中重復(fù)序列很少,一般為單拷貝,如結(jié)構(gòu)基因。但編碼 rRNA的基因往往是多拷貝 。具有編碼同工酶的基因( isogene). 細(xì)菌基因組中存在可移動的 DNA序列,包括插入序列和轉(zhuǎn)座子。1基因組 DNA有多種調(diào)控區(qū)(也有人稱之為功能識別區(qū)域),如復(fù)制起始區(qū)、終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動子、終止子等特殊序列,還有重復(fù)序列,比病毒基因組要復(fù)雜。病毒和原核生物基因組總結(jié)病毒基因組 細(xì)菌基因組基因組較小,編碼少數(shù)蛋白質(zhì) 基因組 106 bp ; 具有單一的復(fù)制起點可以為單 /雙鏈、環(huán)狀 /線性 DNA或 RNA; 單一片段或多個片段(節(jié)段基因組)環(huán)狀或線形,均為 DNA。 “類核 ”的主基因組和獨立的 DNA分子(質(zhì)粒)常為 重疊基因 存在 重疊基因非編碼區(qū)占基因組的小部分 非編碼區(qū)占基因組比例很小功能相關(guān)基因集中成簇,構(gòu)成一個功能單元或轉(zhuǎn)錄單位有 操縱子 結(jié)構(gòu)連續(xù)(噬菌體) /不連續(xù)基因 (真核細(xì)胞病毒)連續(xù),無內(nèi)含子大部分序列是單一序列(結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控區(qū)); 重復(fù)序列少 , ?1%, 拷貝數(shù) ?10有可移動的 DNA序列三 .質(zhì)粒( plasmid)基因組(一 )質(zhì)粒的概念質(zhì)粒是細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)攜帶的染色體外的 DNA分子,是共價閉合的環(huán)狀 DNA分子( covalentclosedcircularDNAcccDNA),大小在 1~200kb,能獨立進行復(fù)制。它存在于許多細(xì)菌以及酵母菌等生物中。質(zhì)粒離開宿主細(xì)胞則無法復(fù)制和擴增,質(zhì)粒 “友好 ”地借居于宿主細(xì)胞內(nèi)??克拗骷?xì)胞才能完成自己的復(fù)制。而 質(zhì)粒對宿主細(xì)胞的生存而言卻不是必需的 ,宿主細(xì)胞丟失了質(zhì)粒依然能夠存活。質(zhì)粒不是單純的寄生, 所攜帶的遺傳信息能賦予細(xì)菌特定的遺傳性狀 。例如,致育性質(zhì)粒( F質(zhì)粒)可以決定細(xì)菌的性別;耐藥性質(zhì)粒( R質(zhì)粒)帶有耐藥基因,可以使宿主菌獲得耐受相應(yīng)抗生素的能力;大腸桿菌素質(zhì)粒 (Col質(zhì)粒 )能使大腸桿菌合成大腸桿菌素,后者可以殺死不含大腸桿菌素質(zhì)粒的親緣細(xì)菌。(二 )質(zhì)粒的分類根據(jù)復(fù)制性質(zhì),可以把質(zhì)粒劃分為兩類:一是嚴(yán)緊型粒( stringentplasmid),當(dāng)細(xì)胞染色體復(fù)制一次時質(zhì)粒也復(fù)制一次,每個細(xì)胞只有 1~2個質(zhì)粒,也稱為低拷貝數(shù)質(zhì)粒 。另一類是松弛型粒( relaxedplasmid),當(dāng)染色體復(fù)制停止后仍繼續(xù)復(fù)制,每一個細(xì)胞內(nèi)一般有 20個左右的質(zhì)粒,也稱為高拷貝數(shù)質(zhì)粒。一般分子量較大的質(zhì)粒屬嚴(yán)緊型,分子量較小的屬松弛型。需要指出,一種質(zhì)粒屬于松弛型還是嚴(yán)緊型并不是絕對的,這往往同宿主的狀況有關(guān)。同一質(zhì)粒在不同的宿主細(xì)胞中可能具有不同的復(fù)制型,這說明質(zhì)粒的復(fù)制不僅受自身的制約,同時還受到宿主的控制。根據(jù)質(zhì)粒 DNA中是否含有接合轉(zhuǎn)移基因,可以分成兩大類。接合型質(zhì)粒( conjugativeplasmid)也稱自我轉(zhuǎn)移的質(zhì)粒,這類質(zhì)粒除含有自我復(fù)制的基因外,還帶有一整套控制細(xì)菌配對和質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移的基因,因此能從一個細(xì)胞自我轉(zhuǎn)移到另的細(xì)胞。如 F質(zhì)粒,部分 R質(zhì)粒和部分 Col質(zhì)粒。如 F質(zhì)粒,雌雄細(xì)胞通過性纖毛相互接觸而結(jié)合,質(zhì)粒便從一個細(xì)胞傳遞給另一個細(xì)胞。非接合型質(zhì)粒也稱不能自我轉(zhuǎn)移的質(zhì)粒。此類質(zhì)粒含有自我復(fù)制的基因,能進行自我復(fù)制,但不含轉(zhuǎn)移基因。因此,這類質(zhì)粒不能從一個細(xì)胞自我轉(zhuǎn)移到另外的細(xì)胞。質(zhì)粒有相容性和不相容性兩種。相容性質(zhì)??梢栽谕凰拗骶募?xì)胞內(nèi)同時存在。但也有些質(zhì)粒不能相容,不能在同一個宿主菌的細(xì)胞內(nèi)同時存在。通常親緣關(guān)系密切的兩種質(zhì)粒不能在同一宿主細(xì)胞中穩(wěn)定共存,這一現(xiàn)象稱為質(zhì)粒的不相容性( plasmidinpatibility),也稱不親和性。窄宿主譜質(zhì)粒存在于一種或數(shù)種密切相關(guān)的宿主,而廣宿主譜質(zhì)??梢栽诓煌疲瑢?,種細(xì)菌之間傳遞。質(zhì)粒的宿主范圍是由質(zhì)粒復(fù)制時對宿主的依賴程度決定的。R質(zhì)粒:抗藥性質(zhì)粒F質(zhì)粒 (fertilityfactor):性質(zhì)粒( sexplasmid)可決定細(xì)菌的性別Col質(zhì)粒:大腸桿菌素質(zhì)粒 ,合成大腸桿菌素,殺死不含大腸桿菌素質(zhì)粒的親緣細(xì)菌。質(zhì)粒 DNApBR322EcoRⅠ 、 PstⅠ、 HindⅢ 、BamHⅠ 、 SalⅠ只有一個酶切位點,便于外源基因的插入。(三 )質(zhì)粒的遺傳控制1. 復(fù)制調(diào)控系統(tǒng):控制質(zhì)粒的拷貝數(shù)。 復(fù)制調(diào)控系統(tǒng)控制質(zhì)粒的拷貝數(shù)。該系統(tǒng)由質(zhì)粒的復(fù)制起點( ori)、rep基因和 cop基因構(gòu)成。Rep基因產(chǎn)物 Rep蛋白結(jié)合于復(fù)制起始位點,啟動質(zhì)粒的復(fù)制。但當(dāng) Rep蛋白過量時,即可通過抑制自身基因的啟動子( promoter)抑制其基因的進一步轉(zhuǎn)錄,減少 Rep蛋白的生成,從而使質(zhì)粒的復(fù)制保持一定頻率。Cop基因序列及其表達(dá)產(chǎn)物對復(fù)制起抑制作用,從而控制質(zhì)粒的拷貝數(shù)。2. 分配系統(tǒng):使質(zhì)粒在細(xì)菌分裂過程中精確分配到子細(xì)胞。分配系統(tǒng)的作用是使質(zhì)粒在細(xì)菌分裂過程中精確地分配到子細(xì)胞中。該系統(tǒng)的缺陷將影響質(zhì)粒在細(xì)胞中的穩(wěn)定存在,導(dǎo)致質(zhì)粒丟失頻率增高。:抑制細(xì)胞分裂,使細(xì)胞分裂與質(zhì)粒復(fù)制相協(xié)調(diào)。細(xì)胞分裂控制系統(tǒng)能夠抑制宿主細(xì)胞的分裂,使細(xì)胞分裂與質(zhì)粒復(fù)制協(xié)調(diào)。該系統(tǒng)對低拷貝數(shù)質(zhì)粒的穩(wěn)定遺傳尤其重要。位點特異重組系統(tǒng)由質(zhì)粒的附著位點、質(zhì)粒編碼的整合酶、切除酶和宿主提供的輔助因子 FIS( factorforinversionstimulation)等組成。其作用是調(diào)節(jié)高拷貝質(zhì)粒向子代細(xì)胞的平均分配過程。具有相同復(fù)制起始位點和分配區(qū)的兩種質(zhì)粒不能共存于一個宿主菌。(四 )質(zhì)粒 DNA的提?。嚎杉由倭靠股兀ㄈ缏让顾兀┮种扑拗鞯鞍踪|(zhì)的合成,質(zhì)粒大量擴增。:離心棄上清 DNA的分離純化第四節(jié) 真核生物基因組及其特點 真核生物的遺傳物質(zhì)主要集中在核膜包圍著的細(xì)胞核中, DNA和特殊的蛋白質(zhì) (如 組蛋白、非組蛋白 )相結(jié)合組裝成為染色體 。 在真核細(xì)胞中 每條染色體只含有 一個 DNA分子 。真核生物的基因組一般比較 龐大 ,例如人的單倍體基因組由 310 9 bp堿基組成,按 1000個堿基編碼一種蛋白質(zhì)計,理論上可有 300萬個基因。 但實際上,人細(xì)胞中所含基因總數(shù)大概不會超過 4萬個
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