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蛋白質生物合成-文庫吧

2025-09-15 15:48 本頁面


【正文】 T y r U A C , U A U GUA C UA U A GS u p C ( s u 4 ) T y r U A C /U A U GUA U UA U A A /U A GS u p G ( s u 5 ) L y s A A A /A A G UUU UU A U A A /U A GS u p U ( s u 7 ) T r p UGG CCA U CA U G A /U G G2) 錯義抑制 ?抑制 tRNA識別錯義突變位點,通過插入原來的氨基酸或其它的氨基酸而抑制錯義突變,從而能完全恢復或部分恢復蛋白質活性 。 ? 有兩種方式可以形成抑制型 tRNA: ? 1) tRNA反密碼子發(fā)生突變 , ? 2) tRNA其他的結構變化或是氨酰 tRNA合成酶的突變而改變了其荷載氨基酸的變化 。 錯義突變 錯義突變A U G A G A U A A A U G G G A U A A A U G A G A U A AUC U C C U U CU 抑制突變 A r g Gl y Gl y圖 14 18 反密碼子發(fā)生突變可抑制錯義突變4)抑制突變的特點: 1)不是所有終止密碼子的抑制基因都產(chǎn)生有功能的蛋白質,起到抑制或校正的作用,關鍵是要看氨基酸取代的情況。 2) 校正的作用不可能是完全的,抑制基因的效率很低,通常為 1~5%。 ? tRNA怎樣接受特定的氨基酸: 氨基酰- tRNA合成酶 (AARS) ? 氨基酰 tRNA合成酶 (AARS)怎樣識別 tRNA; ? tRNA中的哪些結構和接受特定氨基酸有關 。 ? 蛋白質合成的真實性主要決定于 AARS是否能使氨基酸與對應的 tRNA相結合 。 3 tRNA對氨基酸的識別 氨?;?tRNA ? 模板 mRNA只能識別特異的 tRNA而不是 AA。 ? 氨基酰 tRNA合成酶 (AARS)特異 識別連接氨基酸和 tRNA,成為氨基酰 tRNA 。 ? 氨?;?tRNA在蛋白質合成中扮演重要作用: ? 為肽建的合成提供能量; ? 執(zhí)行遺傳信息的解讀。 AA– tRNA合成酶( AARS ) ★ 需要三種底物 AA tRNA ATP ★ 因此有三個位點 aa binding site tRNA binding site ATP site ★ 反應: 活化:氨基酸 +ATP+E→ 氨基酰 ATPE+PPi 轉移:氨基酰 ATPE +tRNA→aa tRNA+AMP+E ★ Prok中 AARS有 20種 ,對 AA及 tRNA高度專一,準確結合; ★ 40kDa~100kDa之間,有單聚體、二聚體和四聚體。 ★ 可分為兩類: 反應機制的差別: Ⅰ 類酶 先將氨基酰轉移到 tRNA 3’ 端 A的 2’OH 然后通過轉酯反應轉移到 3’OH上。 Ⅱ 類酶 直接將氨基酰轉移至 3’OH 上。 ? AARS 上有 4種活性區(qū)域: ? 催化區(qū)域: ATP和氨基酸結合位點 ? tRNA接受臂螺旋結合區(qū)域 ? tRNA反密碼子結合區(qū)域 ? 聚合區(qū)域( II類沒有聚合) ? 催化過程: ? 接受臂結合區(qū)域先介入至催化區(qū)域中 , 使得 tRNA的 3’末端接近催化位點 , 然后進行反應 。 ? I類合成酶有聚合區(qū)域 , 使酶分子聚合 , ? II類合成酶沒有聚合方式 。 AARS 識別 tRNA的活性區(qū)域; 兩類酶與 tRNA反應時--接近模式不同 蛋白沿 L型分子的一側束縛 tRNA( tRNA的兩端被束縛) tRNA兩個端點與合成酶結合,大部分的序列并不被合成酶識別。 I類和 II類合成酶與 tRNA的相互作用有所區(qū)別。 經(jīng)晶體結構分析,兩類酶與 tRNA接觸的方位正好相反, tRNA中和接受特定氨基酸有關的結構 表 1 4 5 每種合成酶通過幾個特殊堿基來識別其同質 t R N At R N A 合成酶識別的堿基一類氨基酰 t R N A 合成酶V al 反密碼子上的三個堿基Me t 反密碼子上的三個堿基I l e 反密碼子上的 C 3 4 修飾堿基G l n U 3 5 (反密碼子) 。 U 1 A 7 2 和 G 7 3 (受體臂)二類氨基酰 t R N A 合成酶Ph e (酵母) 反密碼子上的三個堿基, G 2 0 (D 環(huán) )。 A 7 3 ( 末端 )Se r G 1 C 7 2 。 G 2 C 7 1 。 A 3 U 7 0 ( 受體臂 ) 。 C 1 1 G 2 4 (D 環(huán) )Ala G 3 U 7 0 ( 受體臂 )Paracodon of tRNA 裝載 Amino Acid( R) AARS tRNA binding site aa binding site tRNA中的副密碼子與 AARS 的 tRNA binding site的特異基團間的分子識別結合 副密碼子 (paracodon) ? tRNA 分子上決定其攜帶氨基酸分子的區(qū)域, ? 被氨酰 tRNA合成酶識別的堿基。 副密碼子特點 : ① 一組同功 tRNA 的副密碼子有共同的特征; ② 副密碼子沒有固定的位置,亦不止 1個堿基對; ③ AARS對副密碼子 識別與結合是通過氨基酸與堿基之間的連接實現(xiàn)的。 按 AAtRNA合成機制將 AARS分為兩類 相應的 tRNA上的副密碼子的空間位置不同 type I Val,Arg,Gln,Glu,Ile,Leu,Met,Trp,Tyr 副密碼子大多位于反密碼子臂 type II 副密碼子大多位于氨基酸接受臂 個別還同時在附加臂上有相應堿基 第三節(jié) mRNA的特點 1 mRNA 分子的組成: ?轉錄啟動區(qū) ?5’UTR AUG之前的 5’ 端非編碼區(qū)(前導序列) ?編碼區(qū) 起始碼、閱讀框、終止碼 ?3’UTR 終止密碼子之后,不翻譯的 3’ 端 ?轉錄終止區(qū) CAA A ATT CGA TCG A TTC GAT CGC AA AT TCG ATC GCA 1) 3) 2) ?但只有一種具有編碼的作用,稱為 開放閱讀框( open reading frame, ORF)。 ? 根據(jù)密碼子的起始位置, 一個 DNA順序可能有 3種 閱讀框 ( reading frames) ? 例如,序列 ATTCGATCGCAA ( 2) 其他特征 a、 5’ 端有 300個左右 NT的非翻譯區(qū)( A/G---- AUG) b、 AUG作為起始密碼子( GUG、 UUG) 2 原核生物 mRNA的特征 ( 1) 大部分為多順反子 c、 S – D 序列 S – D序列( ShineDalgarno sequence): 位于 AUG上游 4 ~13 個 NT處的富含嘌呤的 3 ~9 個 NT的共同序列, AGGAGG。 ? 與核糖體結合; ? 與核糖體小亞基內 16S rRNA 的 3’端富含嘧啶的序列 3’UCCUCC5’互補,使 tRNA正確定位于起始密碼子。 S t r u c t r u e o f 3 ’ e n d o f 1 6 5 r i b o s o m a l R N A A G U A G C A C C U G C G G U U A CCUCCU U U A 3 ’ G G G A U G C C A A U G G A r R N A du pl ex G 1 6 S r R N A
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