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2022-09-06 00:11:29 本頁面
【正文】 準(zhǔn)參考圖像之外的所有數(shù)據(jù)。此選項(xiàng)用于當(dāng)你以MRI結(jié)構(gòu)像為標(biāo)準(zhǔn)重排PET圖像數(shù)據(jù)，而又不想在結(jié)果中再生成一個(gè)等同的MRI標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu)像時(shí)。All Images + Mean Image : 重排圖像文件之外，另生成一個(gè)重排后的平均圖像文件。Mean Image Only : 只生成重排后的平均圖像文件。 Interpolation圖像文件重采樣和重寫入的方式。Nearest Neighbour ：最快，但不推薦使用。Bilinear Interpolation：可用于PET數(shù)據(jù)，但不是太適用于fMRI數(shù)據(jù)。Fourier Interpolation：此選項(xiàng)僅適用于純剛體變換，也就是說象元大小必須是相同，并且等方性（正方體）的[17, 14]。 Wrapping 此參數(shù)指示一個(gè)volume中數(shù)據(jù)wrap around in的方向（此處具體理解有待大家補(bǔ)充）。No wrapping：適用于PET數(shù)據(jù)或者已進(jìn)行過空間變換的數(shù)據(jù)。同時(shí)當(dāng)你不確定自己數(shù)據(jù)類型時(shí)，推薦使用此選項(xiàng)。Wrap in Y：適用于沒有重排（resilce）過的在Y方向上進(jìn)行相位編碼的MRI數(shù)據(jù)。 Masking因?yàn)閽呙柽^程中被試總會(huì)或多或少有頭動(dòng)，造成同一個(gè)時(shí)間系列數(shù)據(jù)里所采集到的圖像的邊界不會(huì)完全重合。在有些圖像還有數(shù)據(jù)的地方（信號(hào)值大于0），其它一些圖像已經(jīng)超出了圖像邊界（信號(hào)值為0）了。在這些信號(hào)為0的區(qū)域是無法采樣數(shù)據(jù)的，因此SPM只要檢測到某一幅圖像在某個(gè)區(qū)域已經(jīng)超出了邊界（即信號(hào)為0），就會(huì)將其它所有圖像的此區(qū)域信號(hào)值均設(shè)為0。此做法相當(dāng)于取了時(shí)間系列數(shù)據(jù)中所有圖像的交集。 Realign: Estimate amp。 Reslice將上述參數(shù)估計(jì)與數(shù)據(jù)重排合到一起做。Normailze選用realign步驟中得到的平均象與模板進(jìn)行比較，獲得進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的參數(shù)，然后依據(jù)此參數(shù)文件對(duì)每個(gè)img文件進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。具體操作如下：在預(yù)處理面板標(biāo)準(zhǔn)化選項(xiàng)中選擇“Normalise: Estimate amp。 Write”，出現(xiàn)如下對(duì)話框：我們做如下設(shè)置：選中“data”——“new sbject”，在data下新出現(xiàn)的 “subject” 選項(xiàng)中作如下設(shè)置， “source image”選擇空間校準(zhǔn)步驟中生成的mean文件， “image to write”選擇所有剛進(jìn)行完校準(zhǔn)的文件“ra*.img”，“template image”我們選擇“”，其余采用默認(rèn)設(shè)置，點(diǎn)綠三角運(yùn)行。SmoothFWHM推薦為象素大小的兩至三倍。在預(yù)處理面板標(biāo)準(zhǔn)化選項(xiàng)中選擇“smooth”，出現(xiàn)如下對(duì)話框：我們?cè)凇癷mage to smooth”選項(xiàng)中選擇所有剛進(jìn)行完標(biāo)準(zhǔn)化的文件“wra*.img”，然后點(diǎn)綠三角運(yùn)行即可。這里FWHM我們采用默認(rèn)設(shè)置“8 8 8”。fMRI models依據(jù)提示填入刺激出現(xiàn)的間隔與時(shí)間，并選擇實(shí)驗(yàn)涉及類型，然后進(jìn)行估計(jì)。，保留在當(dāng)前工作目錄。即以前版本的“fMRI model”，spm5和spm8的分析選項(xiàng)有所變化,使用Specify 1st level做單個(gè)被試(single subject)分析；使用 Specify 2nd level 做組分析(group analysis)。比如我們選擇“Specify 1st level”，出現(xiàn)如下對(duì)話框（見下一頁）：我們選擇Directory指定一個(gè)文件夾存放結(jié)果數(shù)據(jù)，其余做如下設(shè)置：“Units for design”選擇“Scans”，“Interscan interval”輸入“2”，選擇“Data and Design”后選擇“New Subject/Session”，再選擇新出現(xiàn)的“Subject/Session”，選擇“Scans”并用文件選擇器選擇相應(yīng)任務(wù)的所有平滑后的功能圖像（swra*.img）然后點(diǎn)擊“down”，選擇“Condition”后選擇“New condition”，然后選中新出現(xiàn)的“Condition”，“name”選項(xiàng)輸入任務(wù)條件的名稱，“onset”輸入任務(wù)條件的啟動(dòng)向量，代表任務(wù)刺激啟動(dòng)的掃描數(shù)，選中“Durations”輸入任務(wù)組塊的持續(xù)時(shí)長，如是事件相關(guān)設(shè)計(jì)請(qǐng)輸入“0”。如還有其他任務(wù)，要再次選中“Condition”——“New condition”——“Condition”定義其他任務(wù)條件。設(shè)置完畢后點(diǎn)擊綠三角運(yùn)行。下面要估計(jì)我們剛建立的模型，在模型設(shè)置面板中點(diǎn)擊“estimate”，將打開如下對(duì)話框：很簡單，我們只須選擇剛生成的“”文件點(diǎn)擊“down”然后點(diǎn)擊綠三角運(yùn)行即可。估計(jì)完成后，我們選擇“results”，將打開如下對(duì)話框： 上圖設(shè)計(jì)矩陣表明一個(gè)掃描序列中我們有三個(gè)任務(wù)條件，均為事件相關(guān)設(shè)計(jì)，選中“tcontrasts”，點(diǎn)擊“define new contra
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