分子生物學(xué)課件cha-閱讀頁
2025-02-02 00:54本頁面
【正文】 （ multiple allele 可保留在群體中） （ 有效的分子標記， SSR simple sequence repeat） CNV (copy number variation) ! b) 中度重復(fù)序列 ( middle repetitive sequence ) Kb / copy 10104 copies / genome C0t(1/2) ~ rDNA tDNA Alu family Histone gene cluster rDNA gene family Sea urchin 450copies Tobacco 750 copies Drosophila 100 copies T 18s T T 28s NT 18s T T 20s 32s 28s 45s 41s 18s 不同的生物不同 發(fā)育時期會發(fā)生 不同程度的擴增 5s rDNA 5s 5s 5s 5s 5s 上萬次重復(fù) 靈長類動物特有的 Alu family 人類 500,000 copies 分布于非重復(fù)序列間，占基因組 5－ 6％ Function ? 300bp 300bp 300bp 6000bp 6000bp 6000bp 6000bp DR DR IR IR AGCT Alu site A copy of Alu family Transposon ? 遺傳性疾病 Alu exon的發(fā)現(xiàn)，表明 Alu單元在不危及基因組完整的前提下，具有增強基因組編碼容量，產(chǎn)生新基因及調(diào)控多能性的進化潛力 middle repeat gene 特點 cluster gene tandem gene redundant gene 拷貝重復(fù)，多量 序列多為相似 排列成束 功能完全相同 具有進化的整體性，累積突變 rDNA tDNA Histone 數(shù)量性狀基因 QTG（量多， 微效 ? 效等 ? 累加） 不等于中度重復(fù)基因 Structure of repetitive sequence of DNA DR direct repeats IR Inverted repeats ATCGGCTA TAGCCGAT Bilateral symmetry ATCGNNNNNGCTA TAGCNNNNNCGAT Bilateral symmetry ATCGATCGATCG TAGCTAGCTAGC Tandem direct repeats ATCGNNNATCGNNNNNNATCG TAGCNNNTAGCNNNNNNTAGC Dispersed direct repeats ATCGNNNNNCGAT TAGCNNNNNGCTA Stemloop palindrome AAGCTT TTCGAA HindIII RE Mirror Structure ATCGNNNNNNNNCGAT ATCG TAGC When . DNA dNts contains two sequences that are plementary, and form a hairpin or stemloop structure. Structure of Inverted repetitive sequence (IR) of DNA ATCGNNNNNCGAT TAGCNNNNNGCTA In . DNA such structure consist of two copies of an identical sequence present in the inverted orientation c) 單拷貝序列 (single copy sequence, 13 copies) 低等真核生物 1020% 高等植物 80% repetitive sequence 高等動物 50% 多為結(jié)構(gòu)基因 . 重復(fù)序列形成的理論 a) 滾環(huán)擴增 — 突變 ( AmplificationMutation ) Mutation insertion cycling amplification 5‘ 3‘ 3‘ 3‘ DNA → RNA → DNA mRNA/cDNA DS cDNA b) 反轉(zhuǎn)座插入 ( retrotransposition ) c) 跳躍復(fù)制 saltatory replication C A A C Mutation in 4 site Insert C Insert triple mutation Saltatory replication 9 bp repeat 27 bp repeat 58 bp repeat 58 bp repeat 116 bp repeat 基因的重復(fù)可以通過復(fù)制產(chǎn)生 （ duplication） 復(fù)制后的拷貝發(fā)生突變和突變累積 (divergence) 形成基因簇 gene cluster 分化成執(zhí)行不同功能的基因 Gene duplication is a major force in evolution 抗病基因簇的形成 d) 不對稱交換 (unequal crossingover) unequal crossingover 5 Units 5 Units 6 Units 4 Units 基因組比較研究 禾本科植物 基因組比較 ● 基因組比較研究表明； 5 Rice genome Maize genome 40 Rice genome Wheat genome 但基因組成，排列表現(xiàn)驚人的相似 差異多存在于 repetitive sequence ﹤ ﹤ . 間隔基因（ splitting gene） Phillip Sharp amp。 HindIII mRNA of Hexon cp Sharp group Roberts group 1977 And presentation in CSH PNAS 74: 3173, 1977 Total DNA of chicken cDNA 7 DNA loop Chambon was inspired by Berget’s report Berget, S. M., C. Moore, and P. Sharp. 1977. PNAS
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