基因組與基因組學ppt課件-在線瀏覽
2025-06-24 22:10本頁面
【正文】 （ transposable phage） 具有轉座功能的溫和性噬菌體，能整合 到宿主基因組內。 三、轉座因子 第二節(jié) 病毒基因組 第二節(jié) 病毒基因組 ? 病毒 自然界普遍存在的一種結構簡單、不能單獨繁殖，只能在宿主細胞內進行復制以保證遺傳信息傳遞的微生物。 第二節(jié) 病毒基因組 一、病毒基因組特征 二、 DNA病毒 三、 RNA病毒 一、病毒基因組特征 一、病毒基因組特征 ，轉錄出 多種 mRNA分子 一、病毒基因組特征 病毒基因組結構相對簡單，基因數(shù)少，所含信息 量也少，不同病毒的基因組大小有較大差異。 如果與 mRNA互補，則稱為負鏈 DNA(DNA)或負鏈RNA(RNA)病毒。 一、病毒基因組特征 這種結構的意義在于使較小的基因組能攜帶較多的遺傳信息，使病毒利用有限的基因，編碼更多的蛋白質。 二、 DNA病毒 （一） DNA病毒基因組的一般特點 （二） 幾種典型的 DNA病毒 二、 DNA病毒 （一） DNA病毒基因組的一般特點 DNA為常見 ，不同基因可以不同的鏈作 為轉錄模板 DNA病毒都是在活宿主細胞核內復制 二、 DNA病毒 4．較大的雙鏈 DNA病毒可引起多種嚴重疾病， 而較小的 DNA病毒會在宿主體內誘發(fā)腫瘤。 6． DNA病毒一般比 RNA病毒大，生活周期較復雜。 長鏈為負鏈： L() 長度固定，攜帶有病毒全部的編碼信息。 二、 DNA病毒 二、 DNA病毒 HBV DNA復制周期 三、 RNA病毒 （一）基因組的一般特點 （二）幾種典型的 RNA病毒 三、 RNA病毒 （一）基因組的一般特點 ，但以單鏈 RNA為多見 ，因此病毒RNA 鏈有正負之分 RNA，含有 2個 相同的 (＋ )RNA，屬于雙倍體 三、 RNA病毒 ，平均每 103～ 104個堿基 中有一個突變 RNA病毒的復制方式不相同，但均需 經逆轉錄完成其基因組的復制 （二）幾種典型的 RNA病毒 三、 RNA病毒 三、 RNA病毒 ? 病毒呈球型顆粒，直徑約 50nm，有脂質包膜 ? 基因組為單鏈正鏈 RNA病毒，鏈長約 ? 整個基因組只有一個 ORF，編碼 3011或 3010個氨基酸 三、 RNA病毒 HCV基因組的兩個突出特征： ? 5′ 末端有一個長度和序列非常穩(wěn)定的非編碼區(qū)（ UTR），此區(qū)是整個基因組中最保守的區(qū)域 ? 3′ 端 UTR長度取決于病毒的來源 三、 RNA病毒 三、 RNA病毒 人類免疫缺陷病毒是獲得性免疫缺陷綜合征（ AIDS）的病原體，屬于 逆轉錄病毒 。 一、細胞核基因組及其特點 ? 內含子是非編碼序列，在 mRNA的成熟過程中被剪切，對外顯子的正常表達可能具有調節(jié)作用。 一、細胞核基因組及其特點 一、細胞核基因組及其特點 DNA(spacer DNA) ? 真核生物基因之間的編碼空白區(qū)或轉錄空 白區(qū)，一般位于單拷貝的結構基因之側翼 。 一、細胞核基因組及其特點 （三）細胞核基因組的特點 —— 重復序列 ? 分為 反向（倒位）重復序列 與 衛(wèi)星 DNA ? 重復頻率可達 106以上 ? 在基因組中所占比例隨種屬而異，約占 10%～ 60％在人類基因組中約占 20％ ? 復性速率快，復雜度低 一、細胞核基因組及其特點 反向（倒位）重復序列 ? 兩個相同順序的互補拷貝在同一 DNA鏈上反 向排列而成 ? 發(fā)夾式或 “ +”字形結構 ? 回文結構 一、細胞核基因組及其特點 一、細胞核基因組及其特點 一、細胞核基因組及其特點 衛(wèi)星 DNA（ satellite DNA） ? 一般由 2～ 10bp組成，成串排列 ? 堿基序列不同于其他部份，等密度梯度離心可將其與主體 DNA分開 高度重復順序的功能 ? 參與復制水平的調節(jié) ? 參與基因表達的調控 ? 參與轉位作用 ? 與進化有關 ? 與個體特征有關 ? 與染色體減數(shù)分裂時染色體配對有關 一、細胞核基因組及其特點 ? 重復數(shù)十 ～ 數(shù)萬次（ 105） ? 復性速度快于單拷貝序列，但慢于高度重復序列 ? 大多與單拷貝基因間隔排列，少數(shù)在基因組中成 串排列在一個區(qū)域 ? 依據重復序列的長度可分為： 短分散片段、長分散片段 一、細胞核基因組及其特點 短分散片段 ? 重復序列的平均長度為 300bp（一般 500bp） ? 拷貝數(shù)可達 10萬左右，如 Alu家族、 Hinf家族 一、細胞核基因組及其特點 長分散片段 ? 平均長度為 3500～ 5000bp，與單拷貝序列間隔排列 。 ? 有些中度重復序列編碼蛋白質或 rRNA的結構基因，如HLA基因、 rRNA基因、 tRNA基因、組蛋白 ? 基因、免疫球蛋白基因 等。 ? 假基因（ pseudo gene） 多基因家族中不產生有功能的基因產物的某些成員。 一、細胞核基因組及其特點 一、細胞核基因組及其特點 ? 單個核苷酸的變異，人群中個體差異最具代表性的 DNA多態(tài)性 ? 人類基因組中每 1kb就有一個 SNP位點 ,共約 300萬個
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