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dna重組ppt課件-在線瀏覽

2025-06-20 18:38本頁(yè)面
  

【正文】 點(diǎn)專一性重組的酶的表達(dá)被細(xì)胞中調(diào)節(jié)過(guò)程引發(fā)。3. 位點(diǎn)專一重組與同源重組的區(qū)別 位點(diǎn)專一 同源位點(diǎn) 同源短序列 同源大片段酶、蛋白 專一 RecA斷裂 專一 隨機(jī) 位點(diǎn)專一性重組機(jī)制 λphage 的溶源和溶菌途徑: 在溶源途徑時(shí), λphage DNA能通過(guò)重組作用整合進(jìn) 位點(diǎn),成為 前病毒( provirus、前噬菌體,prophage)。② 需兩個(gè)重組前體的 DNA短同源序列 中專一性核苷酸序列噬菌體的 DNA借著 att與大腸桿菌的 DNA靠在一起后,其整合酶即與 att結(jié)合,催化整合反應(yīng),將兩個(gè)環(huán)狀 DNA分子變成一個(gè)大環(huán)。高等生物 抗體基因形式。λ噬菌體和宿主的 DNA分子都有特異位點(diǎn)(小段同源序列,稱為 附著點(diǎn) att,attachment site)。attB和 attP中有相同的核心序列。整合酶不但要求特異的序列,且要求兩個(gè)核心序列有同源性。lHF整合宿主因子切除需要 lnt、 xis切除 酶 amp。a. 整合酶: λDNA編碼, λ phag侵染早期即產(chǎn)生有高活 性。b. 宿主整合因子 IHF( intergration hostfactor)Him突變阻止 λ位點(diǎn)專一性重組的發(fā)生?!? IHF與 int相互作用導(dǎo)致重組。編碼: 染色體 DNA。lHF切除需要 lnt、 xis amp。 整合核心序列造成缺口,干擾重組進(jìn) 行,即只切不連,得到中間體,研究 中間體結(jié)構(gòu)。與底物不同的是它還有潛伏的反應(yīng)基團(tuán) ,受酶催化之后即被活化 ,與酶活性中心基團(tuán)共價(jià)結(jié)合 ,使酶喪失活性 .互補(bǔ)連鏈末端進(jìn)行 交叉雜交 (互補(bǔ)單鏈為 7b)b. 整合過(guò)程: intf蛋白切斷 DNAattP(λ上)和 attB()發(fā)生交叉 互補(bǔ)斷裂封閉連接端切口Int蛋白松弛負(fù)超螺旋( attP上)。 (圖 3 –13)互補(bǔ)末端退火 attp形成 超螺旋圖 313圖 3 – 11 通過(guò)在 attP和attB間的相互重組 ,環(huán)狀的噬菌體 DNA轉(zhuǎn)換為整合的原噬菌體 ,原噬菌體通過(guò)attL和 attR間相互重組而切除 .整合需要 lntamp。 lHFattB和 attP中有相同的核心序列。整合酶不但要求特異的序列,且要求兩個(gè)核心序列有同源性。 IHF是由基因 himA和 himD編碼的 2個(gè)亞基組成的蛋白。 位點(diǎn)特異重組可通過(guò) Int和 IHF在體外來(lái)完成。 attP的功能需要一個(gè) 240bp序列,而attB僅需 23bp的片段就具有功能,核心區(qū)每側(cè)僅需 4bp。 attB和 AttP的大小就表明它們?cè)谥亟M中所起的作用是不同的。 很多位點(diǎn)特異重組復(fù)合體都是調(diào)節(jié)反應(yīng)所需的,所以當(dāng)病毒進(jìn)入溶原狀態(tài)時(shí)整合先進(jìn)行;當(dāng)原噬菌體進(jìn)入裂解周期時(shí),先進(jìn)行切離。att 位點(diǎn)有特殊序列attP 240bpattB 23bp (圖 3 –14)c. 整合體 : 識(shí)別和形成復(fù)合體Int和 IHF結(jié)合在attp不同位點(diǎn)上 , Int在核心區(qū)的識(shí)別序列包括 切割位點(diǎn)+3. 位點(diǎn)專一性重組調(diào)節(jié)基因表達(dá)重組位點(diǎn)的取向可導(dǎo)致插入片段除去或倒轉(zhuǎn) 。有些生物能利用這種重組倒置來(lái)控制基因表達(dá)。 (圖 3 15)重組位點(diǎn)取向相反:插入片段倒轉(zhuǎn)。(在基因工程中有意義)? 生物利用這種機(jī)制常常調(diào)節(jié)體表蛋白的表達(dá)。? 沙門氏菌(如鼠傷寒沙門氏菌, Salmonella typhimurium)的鞭毛抗原表達(dá)也是這個(gè)機(jī)理。是 1951年美國(guó)遺傳學(xué)家 McClintock在根據(jù)玉米染色體的長(zhǎng)期觀察研究提出的概念。 通過(guò)載體導(dǎo)入 DNA至受體基因組(如根癌農(nóng)桿菌的 Ti質(zhì)粒)。 細(xì)菌質(zhì)粒通過(guò) 接合作用 轉(zhuǎn)移信息( F因子使質(zhì)粒轉(zhuǎn)移)。 噬菌體通過(guò) 侵染 傳遞信息。 質(zhì)?;蚴删w與寄主染色體 重組 (轉(zhuǎn)化、偶然、隨復(fù)制子)。 病毒侵染(如真核逆轉(zhuǎn)錄病毒)167。167。 轉(zhuǎn)座子 ( transposon or transposable element)概述 轉(zhuǎn)座子( transposon, Tn)是存在于染色體 DNA上可 自主復(fù)制和移位 的基本單位 。(在轉(zhuǎn)移時(shí)原來(lái)位置上的這些結(jié)構(gòu)依然存在或不存在)。它依賴于 DNA的復(fù)制。( 2)原核生物和真核生物均有轉(zhuǎn)座子。40年代 , (美)在研究玉米行為遺傳學(xué)中發(fā)現(xiàn)玉米粒上有色素和斑點(diǎn)的變化,提出在生物體基因中有可移動(dòng)的控制因子( controlling element)。(1952年發(fā)表其論文)。3. 轉(zhuǎn)座子的發(fā)現(xiàn):轉(zhuǎn)座子發(fā)現(xiàn)者(美)? McClintock在 1952年發(fā)表了關(guān)于轉(zhuǎn)座子的論文,但在1967年 Shapiro從 , Mcclintock的理論才引起重視, 1980年獲諾貝爾獎(jiǎng)。 gal操縱子的 galK、 T、 E基因分別編碼gal激酶( galactokinase, K)、 gal轉(zhuǎn)移酶( galactose transferase, T)和 gal表異構(gòu)酶( glactose epimerase, E)。? 但意外發(fā)現(xiàn) galE- galT-也能生存,這種突變型由于 Gal1P積累是不可能存活的, 但卻居然生長(zhǎng)良好。K、 T、 E酶催化 Gal的分解,其中間產(chǎn)物 Gal1p是有毒的,因此 galT-在含半乳糖的培養(yǎng)基上因使Gal1p積累而不能成活。? 因此推測(cè) galE-的突變可能也是部分 DNA的插入(突變)和切離(回復(fù)突變)所致。? ① 密度梯度離心實(shí)驗(yàn) : Jordon、 Starlinger和 Shapiro等分別進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),他們將含有 gal+和 galm(極性突變,即gal- )λ噬菌體分別分離出,同時(shí)加入到離心管中進(jìn)行 密度梯度離心 ,結(jié)果出現(xiàn)了兩條帶, λgalm的密度 gal+,表明 galm有可能具有 小片斷 DNA的插入。? 實(shí)驗(yàn)結(jié)果在雜交鏈上出現(xiàn)了 一個(gè)額外 的 莖環(huán)結(jié)構(gòu) ,長(zhǎng)800nt(核苷酸) 的就是插入序列 1( insertion sequence1,IS1)。DNA的轉(zhuǎn)座(移位,transposition)是由可移位因子( transposable element)介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。McClintock首先觀察了玉米中轉(zhuǎn)座因子。當(dāng)時(shí)已知很多基因共同控制紅色花青素的合成,使玉米胚乳呈紫色。轉(zhuǎn)座重組DNA的轉(zhuǎn)座(移位,transposition)是由可移位因子(transposable element)介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。 簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)座子 也稱插入序列 ( insertion sequence IS).216。 v 具有編碼轉(zhuǎn)座酶的基因 ( transposase) 。轉(zhuǎn)座酶催化轉(zhuǎn)座子插入新位點(diǎn)。具編碼轉(zhuǎn)座酶(transposase)的基因,轉(zhuǎn)座酶可催化轉(zhuǎn)座子插入新位置。不含有任何宿主基因。一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞常帶有少于 10個(gè) IS序列。IS序列都是可以獨(dú)立存在的單元,帶有介導(dǎo)自身移動(dòng)的蛋白。表示法: IS 加鑒定類型的編號(hào)。此類基因一般長(zhǎng)有約 1000bp左右,最小的 IS 1為 768bp,最長(zhǎng)的 2088bp (表 31) 表 31 某些 IS 序列的參數(shù)元件 長(zhǎng)度( bp) 末端反向重復(fù) 靶位點(diǎn)反向重復(fù) 靶位點(diǎn)選擇IS1 768 23 9 隨意IS2 1327 41 5 熱點(diǎn)IS4 1428 18 11 或 12 AAAN20TTT IS5 1195 16 4 熱點(diǎn)IS10R 1329 22 9 NGCTNAGCNIS50R 1531 9 9 熱點(diǎn)IS903 1057 18 9 未知 IS是一自主單位,每種 IS元件具有不同序列,但有共同的組織形式(圖 3 16)。反向重復(fù)( IR)IS 末端只有反向 轉(zhuǎn)座酶A C T G C A G T T G A C G T C AA C T G T G A CT G A C A C T G順向重復(fù)末端反向 /順向重復(fù)序列的效應(yīng)不同!轉(zhuǎn)座子兩邊的反向重復(fù)序列變性后形成的發(fā)夾結(jié)構(gòu)? IS具有 1kb左右的編碼區(qū),它僅編碼和轉(zhuǎn)座有關(guān)的轉(zhuǎn)座酶( transposase)。IS的轉(zhuǎn)座是在轉(zhuǎn)座酶催化下交錯(cuò)切開宿主靶位點(diǎn),然后 IS插入,與宿主的單鏈末端相連接,余下的缺口由 DNA聚合酶和連接酶加以填補(bǔ),結(jié)果使插入的 IS兩端形成了 DR。表示法: 通常以 Tn和后面加上數(shù)碼表示,如 Tn903。? 兩側(cè)有重復(fù)序列。 (圖 3 – 20)結(jié)構(gòu):Figure 3 20 A posite transposon has a central region carrying markers (such as drug resistance) flanked by IS modules. The modules have short inverted terminal repeats. If the modules themselves are in inverted orientation 功能:和 IS 一樣可以從一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)座到另一個(gè)位點(diǎn)。 ? 復(fù)合式轉(zhuǎn)座子兩翼序列表明 IS序列插入到某個(gè)功能基因兩端時(shí)就可能產(chǎn)生復(fù)合轉(zhuǎn)座子。 表 32 幾種復(fù)合轉(zhuǎn)座子 元件 長(zhǎng)度 (bp) 遺傳標(biāo)記 末端組件 組件取向 組 組件功能Tn903 3100 Kanr IS903 反向 完全相同 兩者皆有Tn9 2500 Canr IS1 正向
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