【正文】 我國地域遼闊，生態(tài)環(huán)境多樣，生物種類豐富。因此，開展物種多樣性與生態(tài)系統(tǒng)功能關(guān)系的研究具有重要的理論和實(shí)踐意義。生物多樣性是控制生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定性、生產(chǎn)力、養(yǎng)分動態(tài)和外來種侵入的重要因素之一。 12， 物種多樣性與生態(tài)系統(tǒng)功能的關(guān)系 生態(tài)系統(tǒng)功能是指生態(tài)系統(tǒng)執(zhí)行其基本生態(tài)系統(tǒng)過程的能力，包括水分的流動和儲存、生物生產(chǎn)力、生物地球化學(xué)循環(huán)和生物多樣性的維持等。進(jìn)化研究涉及的問題非常廣泛，在有限的時(shí)間內(nèi)只能根據(jù)我國的特色和優(yōu)勢集中一些科學(xué)問題進(jìn)行探索?；蚪M研究的突破性進(jìn)展為進(jìn)化研究創(chuàng)造了難得的機(jī)遇。 11. 系統(tǒng)發(fā)育重建與分子進(jìn)化 進(jìn)化是生命科學(xué)的基本問題之一，沒有進(jìn)化論的指導(dǎo)，生物學(xué)一切問題都難以解釋。 主要科學(xué)問題： 生命對于極端自然環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制；極端生物的代謝特點(diǎn)及特殊代謝產(chǎn)物；典型極端自然環(huán)境中的生物物種結(jié)構(gòu)、基因構(gòu)成、協(xié)同適應(yīng)機(jī)制及與環(huán)境的相互作用 。生活在極端自然環(huán)境中的生物蘊(yùn)涵著生命進(jìn)化歷程的豐富信息，代表著生命對于環(huán)境的極限適應(yīng)能力，推動著地球上的物質(zhì)循環(huán)，是生物遺傳和代謝多樣性的寶藏。 主要科學(xué)問題： 行為的發(fā)生、發(fā)展和演化規(guī)律；利用模式動物和人類遺傳性精神與心理障礙疾病資源，鑒定和研究與行為相關(guān)的功能和致病基因及作用機(jī)理；生存環(huán)境對神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、功能性修飾和病理性改變的影響，及其與行為形成和改變的相關(guān)性；探尋治療精神與心理障礙的新策略和新方法。行為受神經(jīng)系統(tǒng)控制。 9．精神、心理和行為的神經(jīng)生物學(xué)基礎(chǔ) 人與動物的行為均受遺傳和社會兩方面制約。在深入研究免疫耐受誘導(dǎo)及調(diào)節(jié)和消除的分子機(jī)理的基礎(chǔ)上，結(jié)合基于免疫耐受機(jī)制的臨床治療手段，為包含免疫性疾病、過敏性疾病、腫瘤、器官移植排斥等提供新的干預(yù)途徑和方法，并為疫苗設(shè)計(jì)提供重要的分子信息。目前對天然－獲得性免疫應(yīng)答的相互聯(lián)系迄今了解還很少，因此深入了解天然免疫系統(tǒng)如何啟動并調(diào)節(jié)獲得性免疫應(yīng)答已成為目前免疫學(xué)前沿領(lǐng)域之一。 迄今包括淋巴細(xì)胞識別抗原后的活化 、 抗原信息處理 、 加工 、整合 、 提呈和轉(zhuǎn)導(dǎo) ， 效應(yīng)產(chǎn)生及免疫自穩(wěn)的形成 ， 共刺激信號分子及其信號調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò) ， 抗原提呈細(xì)胞的作用等重要過程和環(huán)節(jié)的調(diào)控機(jī)制等基礎(chǔ)免疫學(xué)問題仍有許多深入研究的空間 ， 所以應(yīng)該繼續(xù)鼓勵(lì)具有概念 、 理論和方法創(chuàng)新的相關(guān)命題研究 ， 豐富對免疫學(xué)基本理論的認(rèn)識 。 主要科學(xué)問題： 干細(xì)胞增殖和分化的分子調(diào)控機(jī)制；體細(xì)胞核基因組重編程的機(jī)理以及重編程分子的鑒定；線粒體基因組在體細(xì)胞核基因組重編程中的作用；疾病相關(guān)的干細(xì)胞如腫瘤干細(xì)胞等的研究。 7. 干細(xì)胞特性與定向分化 干細(xì)胞具有在體外大量增殖和分化為多種細(xì)胞的潛能，是研究細(xì)胞生物學(xué)基礎(chǔ)科學(xué)問題如自我更新、定向分化和細(xì)胞可塑性的理想模型，也可以為疾病治療和組織器官重建提供可能。因此，膜系統(tǒng)和物質(zhì)跨膜運(yùn)輸一直是細(xì)胞生物學(xué)研究的中心問題之一。胞內(nèi)運(yùn)輸涉及內(nèi)膜系統(tǒng)的動態(tài)變化、囊泡運(yùn)輸、胞吞和胞吐等重要過程。 6. 膜系統(tǒng)及物質(zhì)跨膜運(yùn)輸 細(xì)胞作為生命活動的基本單元，不斷地與外界進(jìn)行物資交換。細(xì)胞運(yùn)動性是細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域中的一個(gè)重要的基礎(chǔ)性理論問題。 在體內(nèi)，細(xì)胞定向遷移需要胞外信號分子的引導(dǎo)，這一過程為胚胎發(fā)育、神經(jīng)系統(tǒng)形成和免疫系統(tǒng)趨化功能所必須。 主要科學(xué)問題： 信號網(wǎng)絡(luò)新組分的鑒定和功能分析；信號網(wǎng)絡(luò)組分間的相互作用及其調(diào)節(jié)機(jī)制；信號通路間的對話機(jī)制及生物學(xué)意義；信息整合機(jī)制和應(yīng)答方式的系統(tǒng)整合生物學(xué)分析；生理與病理?xiàng)l件下信號傳遞的異同等。盡管目前在這一領(lǐng)域已取得一些研究進(jìn)展，但對生命活動的信息調(diào)控機(jī)制的認(rèn)識還遠(yuǎn)非完善。 4， 細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié)及效應(yīng) 生命活動離不開信息交流。本領(lǐng)域鼓勵(lì)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能及其相互關(guān)系等方面開展創(chuàng)新性研究。蛋白質(zhì)的功能通過其結(jié)構(gòu)、運(yùn)動和相互作用得以實(shí)現(xiàn)。 主要科學(xué)問題： 基因組結(jié)構(gòu)與遺傳語言，其中包括非編碼 DNA的鑒定和功能研究；基因組 DNA序列元件的鑒定及其生物學(xué)功能；基因表達(dá)的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控；從比較基因組的角度研究基因起源；研究基因組學(xué)的新方法和新技術(shù)等。如何解讀和注釋基因組測序獲得的海量數(shù)據(jù)，成為今后的研究重點(diǎn)，也成為世界各國競爭的焦點(diǎn)。 主要科學(xué)問題： 發(fā)育過程中基因時(shí)空表達(dá)的遺傳和表觀遺傳調(diào)控機(jī)制；機(jī)體形成時(shí)的格式化（ patterning）；組織和器官形成中細(xì)胞分化和移動的分子基礎(chǔ)；以動物發(fā)育為模型研究人類重大疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)制等。 1. 重要組織器官發(fā)育的細(xì)胞與分子基礎(chǔ) 發(fā)育生物學(xué)是當(dāng)今生命科學(xué)中的一門前沿學(xué)科，主要利用小鼠、斑馬魚、爪蟾、海膽、果蠅、線蟲、擬南芥、水稻等模式生物研究生物體從精子和卵子的發(fā)生、受精、胚胎發(fā)育、生長，到衰老、死亡的規(guī)律。加強(qiáng)生物組織的功能化定量研究，力爭在感覺神經(jīng)信息處理及模擬，分子成像的理論和方法等方面取得突破。 要大力提倡和鼓勵(lì) 學(xué)科交叉與合作 。 醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究 要充分發(fā)掘和利用我國豐富的醫(yī)學(xué)資源（包括 各種疾病家系 和病例、隔離人群、天然藥物資源、病原微生物和復(fù)雜的自然環(huán)境等），以 重大疾病的發(fā)生、發(fā)展機(jī)理與防治為主線 ，開展相關(guān)的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)和藥學(xué)的前沿研究。 在 農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域 ，要以國家需求為目標(biāo)開展基礎(chǔ)研究，努力解決涉及食品安全、生態(tài)安全、防病治病和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展的深層次基礎(chǔ)問題。 ?充分利用基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué) 所取得的理論和技術(shù)成就， 帶動 遺傳、發(fā)育、細(xì)胞、免疫、神經(jīng)、進(jìn)化和生態(tài)學(xué)等前沿領(lǐng)域的發(fā)展。上述問題應(yīng)當(dāng)在“十二五”期間引起重視并予以改進(jìn)。雖然近年來研究論文數(shù)量增長很快 ， 但具有 原始創(chuàng)新性 的高質(zhì)量論文較少 ， 在世界生命科學(xué) 權(quán)威學(xué)術(shù)雜志 的文章數(shù)量還較少 。此外，在學(xué)習(xí)與記憶的化學(xué)基礎(chǔ)研究、微量分析、單細(xì)胞單分子分析、高通量分析（包括生物轉(zhuǎn)化、某些生物過程的化學(xué)介入或干擾研究）等方面有了很好的研究積累。 感覺神經(jīng)生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)展迅速 ，在知覺的基因表達(dá)、視覺的腦機(jī)制、學(xué)習(xí)與記憶、腦的發(fā)育及可塑性等方面獲得了有國際影響力的研究成果。 隨著學(xué)術(shù)交流和合作的日漸加強(qiáng)，交叉研究在我國也獲得了迅速發(fā)展。 高通量藥物篩選已經(jīng)步入實(shí)用階段。 乙肝疫苗等 在預(yù)防和控制我國高發(fā)傳染病中發(fā)揮了重要作用。在精神分裂癥為代表的復(fù)雜性疾病發(fā)生機(jī)理的系統(tǒng)、整合分析中，初步建立起多元聯(lián)合分析體系，取得了一系列有價(jià)值的成果。 ? 在心腦血管病，惡性腫瘤，內(nèi)分泌與代謝性疾病，精神與神經(jīng)性疾病和遺傳病的研究中 建立了重要的遺傳資源庫 、 信息數(shù)據(jù)庫和高通量技術(shù)平臺 ， 克隆和鑒定出若干單基因病和多基因復(fù)雜性疾病的致病基因或易感基因。應(yīng)該說，我國農(nóng)業(yè)科學(xué)基礎(chǔ)研究正面臨非常好的發(fā)展機(jī)遇。 ? 利用細(xì)胞核移植和體細(xì)胞克隆成功地獲得了 克隆牛、克隆羊和克隆豬 等。通過有效的突變體遺傳分析和信號傳導(dǎo)途徑研究，深化了對植物抗逆機(jī)制的認(rèn)識。 ? 在農(nóng)學(xué)領(lǐng)域 ? 進(jìn)一步深化了對雜種優(yōu)勢機(jī)理的認(rèn)識，找到了 顯性、超顯性、上位性 都可成為雜種優(yōu)勢形成的遺傳組分以及可在同一遺傳體系中共存現(xiàn)象的分子證據(jù)，提出了“ 上位性是雜種優(yōu)勢的主要遺傳基礎(chǔ) ”的學(xué)術(shù)觀點(diǎn)。 近年來，我國科學(xué)家在國際頂級學(xué)術(shù)期刊如《 Cell》 、 《 Nature》 、 《 Science》 等以及權(quán)威性專業(yè)期刊的發(fā)文量明顯增多，標(biāo)志著我國基礎(chǔ)研究快速發(fā)展，研究水平不斷提高。 ? 中國不僅是 四大國際研究計(jì)劃 （世界氣候研究計(jì)劃（ WCRP）；國際地圈 —— 生物圈計(jì)劃（ IGBP）；全球環(huán)境變化的人文因素（ IHDP） 。 ? 我國 古生物學(xué) 的一系列重大發(fā)現(xiàn)，如澄江