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微生物研究進(jìn)展chapter5分子生態(tài)學(xué)方法在環(huán)境微生物研究領(lǐng)域的應(yīng)用-文庫吧資料

2025-01-01 22:52本頁面
  

【正文】 起限制性內(nèi)切酶 酶切位點(diǎn) 的差異 信息量大 重復(fù)性高 周期長,過程繁瑣 RAPD 利用隨意設(shè)計(jì)的 非特異引物 簡單、迅速 重復(fù)性低 ERIC 腸桿菌基因間重復(fù)共有序列在不同種屬或 者同屬的不同種微生物之間的拷貝數(shù)和定 位的差異引起兩個(gè) ERIC之間序列的多態(tài)性 結(jié)果穩(wěn)定 重復(fù)性好 靈敏度高 PCR反應(yīng)本身的擴(kuò)增和 偏差可能會(huì)產(chǎn)生假 陽性, 不能對群落中 感興趣的菌進(jìn)一步研究 分析 方法 方法 類別 原理 優(yōu)點(diǎn) 缺點(diǎn) 基于 16S rDNA 的 方法 16S rDNA 克隆 文庫 可以用來揭示 不同物種的 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系 反映各種微 生物種類構(gòu)成和親緣關(guān)系 工作量大,成本高,不能對目標(biāo)種群進(jìn)行 原位和實(shí)時(shí)的檢測 DGGE 不同的 變性劑 濃 度,解鏈之后電泳速度將會(huì)急劇下降 DNA片段純化 后可以直接 用于測序 分辨率低, 被分析的片段不能大于 400bp TGGE 溫度梯度 ,利用不同序列結(jié)構(gòu)的 DNA,雙鏈 具有不同的熔點(diǎn)溫度 Tm 同上 同上 SSCP 長度相同但 序列不同的單鏈 DNA具有空間構(gòu) 象上的差異 操作比較簡便 價(jià)格低廉 靈敏度和重現(xiàn)度差,150~ 400bp最佳 的分離效果 ARDRA 16S rDNA序列的差異, 限制性核酸內(nèi)切酶酶切 后將得到長度與數(shù)量 不同的 DNA片段 分辨率高 對圖譜進(jìn)行定量化解析和進(jìn)行群落 間的比較都十分困難 T RFLP PCR擴(kuò)增中所用引物的一端或兩端帶有 熒光 標(biāo)記 方便快捷 分辨率高 靈敏度高 復(fù)雜群落多樣性的低估、 影響因素多、 無法對微生物定性分析 RISA 核糖體區(qū)間序列多態(tài)性 操作簡單、序 列多態(tài)性豐富 核糖體的拷貝數(shù)的不同 會(huì)產(chǎn)生假陽性 熒光原位雜交( FISH ) 利用 生物素或地高辛等非放射性物質(zhì) 標(biāo)記探針,并通過熒光直接標(biāo)記或者熒光素偶聯(lián)的抗原 抗體檢測系統(tǒng),對 DNA或 RNA進(jìn)行定性或定位分析 。 墨西哥灣“深海地平線”鉆油臺(tái) 2023年 4月 20日爆炸起火沉沒后不斷漏油。 微生物分子生態(tài)學(xué)的概念 利用 分子生物學(xué)技術(shù) 手段研究自然界 微生物與生物及非生物環(huán)境 之間 相互關(guān)系及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。 一、微生物分子生態(tài)學(xué)的理論 微生物分子生態(tài)學(xué)的產(chǎn)生 為了 突破傳統(tǒng)純培養(yǎng)方法的限制 ,必須要有一種能 繞過純培養(yǎng) 這一步的新技術(shù),來推動(dòng)微生物多樣性的研究。 傳統(tǒng)培養(yǎng)法的瓶頸 微生物多樣性被用于監(jiān)視和預(yù)測環(huán)境變化 ,也是新基因資源的重要來源。第五章 分子生態(tài)學(xué)方法在 環(huán)境 微生物 研究領(lǐng)域的應(yīng)用 農(nóng)學(xué) 系生物技 術(shù)專業(yè)課 程《微生物 學(xué)研 究 進(jìn) 展》 一、微生物分子生態(tài)學(xué)的理論 二、微生物分子生態(tài)學(xué)的研究方法 三、展望 墨西哥灣“深海地平線”鉆油臺(tái) 2023年 4月 20日爆炸起火沉沒后不斷漏油。鉆油臺(tái)所屬的英國石油公司近日宣布又發(fā)現(xiàn)一處泄漏點(diǎn),令漏油量多達(dá)每日 5000桶,是原先估計(jì)的 5倍,并正逼近美南部 4個(gè)州的海岸。傳統(tǒng)純培養(yǎng)技術(shù)雖然已經(jīng)幫助人們認(rèn)識(shí)了很多微生物,創(chuàng)造了巨大的財(cái)富,但是由于
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