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2025-08-15 00:11本頁面
【正文】 Wrapping此參數(shù)指示一個(gè)volume中數(shù)據(jù)wrap around in的方向（此處具體理解有待大家補(bǔ)充）。 Interpolation在估計(jì)最佳變換時(shí)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行重采樣的方法。MRI數(shù)據(jù)一般注冊(cè)到第一幅圖像。PET 數(shù)據(jù)一般注冊(cè)到平均圖像。 Num Passes Register to first: 所有圖像文件對(duì)齊注冊(cè)到第一幅圖像。PET數(shù)據(jù)一般使用7mm。 Smoothing (FWHM)高斯平滑的半高寬值。 Separation 此參數(shù)以毫米為單位，表示對(duì)參考圖像文件進(jìn)行重采樣時(shí)采樣點(diǎn)之間的間隔。此參數(shù)的設(shè)定實(shí)際影響到的是參與參數(shù)估計(jì)的象元（voxel）的數(shù)目。 Quality質(zhì)量與速度的權(quán)衡。 Session選擇session里所有的scan。然后再把每個(gè)session里的其它scan與該session的第一個(gè)scan進(jìn)行對(duì)齊。 選擇一個(gè)被試需要進(jìn)行此步驟處理的所有sessions。每個(gè)session的重排參數(shù)會(huì)被存儲(chǔ)到名為 rp*.txt 的文件中。圖像數(shù)據(jù)的頭文件會(huì)被改寫以反映數(shù)據(jù)相對(duì)空間位置的變化。參考圖像文件不一定非用采集到的第一幅圖像，使用最有“代表性”的一幅圖像也許更好。使用者所選取的第一幅圖像文件將被作為其它圖像重排的參考標(biāo)準(zhǔn)。其余選項(xiàng)采用默認(rèn)設(shè)置，點(diǎn)擊上方綠色的三角開始運(yùn)行。 Res)”，出現(xiàn)如下對(duì)話框，我們按下面設(shè)置進(jìn)行： 選中“data”, 選擇“New Session”, 然后選中data下出現(xiàn)的 “Session”選項(xiàng)。采用SPM8，頭動(dòng)信息和空間標(biāo)準(zhǔn)化的圖形文件將以spm_“data”.ps的形式保存于matlab的工作目錄下，如我們是2009年4月30日處理的數(shù)據(jù)。Rotation表示被試頭部在實(shí)驗(yàn)過程當(dāng)中繞X(LR)，Y(AP)，Z(SI)三條軸的轉(zhuǎn)動(dòng)角度。另外，頭動(dòng)校正信息將以plot 圖形顯示。校正信息(頭動(dòng)信息)將在結(jié)果窗口(Graphics Window)顯示。用戶可指定某個(gè)volume作為隨后volumes的參考。做完這一步，能給出該序列中被試的頭動(dòng)情況，以作為是否放棄該數(shù)據(jù)的依據(jù)，如果頭動(dòng)超過1個(gè)voxel（功能圖像掃描矩陣一般是64*64，則體素的大小為（FOV/64）*（FOV/64）*（層厚+層間距）），則要考慮放棄該時(shí)間點(diǎn)數(shù)據(jù)。以上兩步具體解釋如下——即使我們對(duì)被試的頭部做了很好的固定，在實(shí)驗(yàn)過程中，被試也會(huì)不由自主的有一些輕微的頭動(dòng)，這在fMRI實(shí)驗(yàn)中尤為明顯。（為什么？）Realign（相當(dāng)于AFNI中的registration）分兩步：1）coregister，將每個(gè)session的第一個(gè)scan與第一個(gè)session的第一個(gè)scan進(jìn)行比較，然后將每個(gè)session中的其他scan與本session中的第一個(gè)scan進(jìn)行比較，同時(shí)為每個(gè)session生成一個(gè)對(duì)齊參數(shù)（realignment parameters），文件名為realignment_params_*.txt 2）reslice。運(yùn)行完后將會(huì)生成一系列a*.img文件，這就是時(shí)間校準(zhǔn)后的數(shù)據(jù)。Filename Prefix，是指新生成的圖像前加何標(biāo)記，一般采用默認(rèn)設(shè)置。選擇參考掃描層（一般可使用默認(rèn)值），其它掃描層的起始時(shí)間都將以此層的起始時(shí)間為標(biāo)準(zhǔn)來移動(dòng)進(jìn)行校正。向量?jī)?nèi)的數(shù)字排列順序是這些層的獲取時(shí)間順序。指定層獲取順序的層次序參數(shù)是一個(gè)含N個(gè)數(shù)的向量，這里N是每個(gè)volume所含的層數(shù)。如前述此順序可通過SPM的Display功能查看。比如，TR為3秒，掃描了20層，則可以直接寫為：3(3/20)。一般可以用以下公式計(jì)算：TA＝TR(TR/掃描層數(shù))。Number of Slices，我們輸入每禎圖像的層數(shù)，如“32”，即掃描層總數(shù)。點(diǎn)擊data并在下面的面板中點(diǎn)擊“new session”,這樣在data下會(huì)出現(xiàn)“session”的分支項(xiàng)，選中該項(xiàng)并點(diǎn)擊面板下方的“select files”，然后用spm文件選擇器選擇你要處理的數(shù)據(jù)，最后點(diǎn)擊“Done”。我們?cè)诎粹o窗口中的預(yù)處理面板中點(diǎn)擊“Slice Timimg”，將出現(xiàn)如下對(duì)話框：對(duì)上圖右側(cè)選項(xiàng)我們做如下設(shè)置————Data，預(yù)備數(shù)個(gè)被試或者session的數(shù)據(jù)。一種常用的數(shù)學(xué)轉(zhuǎn)換方法：傅立葉轉(zhuǎn)換可以把任何復(fù)雜信號(hào)轉(zhuǎn)換為由不同頻率和相位的簡(jiǎn)單正弦曲線的線性組合。常規(guī)的糾正方法是在保持整段采集信號(hào)不變的條件下推前或者推后采集的起始時(shí)間。這些掃描層是一個(gè)接一個(gè)按照上面所說的sliceorder（掃描層序數(shù)）的順序來采集的，因此各個(gè)掃描層之間的采集時(shí)間是有差異的。核磁儀采集數(shù)據(jù)的時(shí)間精度為一個(gè)TR，因此我們通常默認(rèn)一個(gè)TR內(nèi)采集到的數(shù)據(jù)（一個(gè)volume）采自完全相同的時(shí)間。我們可以用SPM的Display功能來查看這個(gè)順序。每個(gè)Sliceorder（掃描層系數(shù)）同時(shí)指明了每個(gè)掃描層
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