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dna甲基化-文庫吧資料

2024-08-17 18:02本頁面
  

【正文】 基化的分析檢測(cè) DNA 甲基化的檢測(cè)大體分為兩個(gè)步驟: a.待檢測(cè)樣品的前期處理; b.目標(biāo)序列的定位和甲基化狀態(tài)的量化。 ?當(dāng)細(xì)胞所在的環(huán)境發(fā)生變化時(shí),這種平衡可能會(huì)被打破,阻止功能的增強(qiáng)或者侵入能力的提高則可能使 DNA 甲基化往 CpG 島外或者往內(nèi)移動(dòng),從而建立新的平衡。 超甲基化體現(xiàn)在抑癌基因的啟動(dòng)子區(qū)被異常甲基化,整體的欠甲基化同重復(fù)序列 (如轉(zhuǎn)座子 )以及癌基因的啟動(dòng)子區(qū)的甲基化程度減小、基因組遺傳不穩(wěn)定性的增加密切相關(guān)。 Memory at the cellular level 甲基化與發(fā)育 性成熟個(gè)體 配子母細(xì)胞 成熟配子 早期胚胎 成體模式的胚胎 體細(xì)胞 生殖細(xì)胞 原始生殖細(xì)胞 甲基化清洗 印記 保持印記 部分保持印記 保持印記 保持印記 甲基化清洗重塑 X染色體失活,基因的時(shí)空特異性表達(dá) 甲基化異常 導(dǎo)致的疾病, 衰老 DNA 甲基化同眾多疾病的發(fā)生與發(fā)展密切相關(guān),比如 Ⅱ 型糖尿病、自身免疫疾病以及各種癌癥。 精子和卵子的原核在受精后仍有一段時(shí)間的分離狀態(tài),可以在顯微操作下進(jìn)行原核去除或移植。 從受精卵到胚泡階段,基因組范圍的甲基化均被抹去,但某些印記基因保持甲基化。 印記基因 哺乳動(dòng)物配子形成晚期,絕大多數(shù)順序按程序去甲基化。 ?因此,成體基因組通常呈現(xiàn) 2 種 DNA 甲基化形式,奢侈基因呈現(xiàn)高密度甲基化,而含有豐富 CpG 島的管家基因則呈非甲基化。 ? 胚胎早期的植入期前,整個(gè)基因組發(fā)生了普遍的非特異性去甲基化,非甲基化狀態(tài)保持到細(xì)胞的桑葚期前。 甲基化與發(fā)育 DNA甲基化與配子形成、胚胎發(fā)育的關(guān)系 ?哺乳動(dòng)物生殖細(xì)胞在形成受精卵后的最初幾次卵裂中,發(fā)生 DNA 的去甲基化,即在去甲基化酶的作用下,去除 DNA 分子上幾乎所有從親代遺傳來的甲基化標(biāo)記。 piRNA是真核生物中主要控制轉(zhuǎn)座子活性的一類 24~31nt 的 RNA 分子,這類小分子 RNA與 Argonaute蛋白家族中的 Piwi亞家族蛋白相互結(jié)合,故命名為 Piwiinteracting RNAs。 組蛋白密碼 DNA甲基化與小 RNA的關(guān)系 近年研究表明, siRNA 和 miRNA 能在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中介導(dǎo) DNA 甲基化( RdDM)、組蛋白修飾及異染色質(zhì)的形成, 從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄基因沉默(TGS)。 1998年 ,英國(guó)愛丁堡大學(xué)的 Nan和美國(guó)馬里蘭州的 Johes等各自獨(dú)立發(fā)現(xiàn),選擇性地結(jié)合于甲基化 DNA上的特異的轉(zhuǎn)錄抑制因子 MeCP2與組蛋白脫乙?;?histone deacetylase,HDAC)在細(xì)胞中可存在于同一個(gè)復(fù)合物中。體外研究發(fā)現(xiàn),某些特異轉(zhuǎn)錄因子與甲基化靶序列的親和力明顯降低。 近 2年來,對(duì)去甲基化酶的研究有所突破。該現(xiàn)象促使人們思考為什么 CpG 島不易被甲基化。 ?DNMT1 的主要功能是作為 DNA 復(fù)制復(fù)合物(DNA synthesome) 中的組分 ,催化子鏈 DNA 半甲基化位點(diǎn)甲基化 ,維持復(fù)制過程中甲基化位點(diǎn)的遺傳穩(wěn)定性; ?DNMT3a 和 DNMT3b 主要催化從頭甲基化 ,以非甲基化的 DNA 為模板 ,催化新的甲基化位點(diǎn)形成 ,在胚胎發(fā)育中起重要作用。 異常的甲基化可分為高甲基化和低甲基化 ,前者指正常組織中不發(fā)生甲基化的位點(diǎn)被甲基化 ,后者是指在正常組織中發(fā)生甲基化的位點(diǎn)去甲基化。 ?成體基因組通常中,奢侈基因呈現(xiàn)高密度甲基化,而含有豐富 CpG 島的管家基因則呈非甲基化。 ?甲基化的 CpG 雙核苷酸通過募集轉(zhuǎn)錄抑制因子或者阻礙轉(zhuǎn)錄激活因子的結(jié)合 抑制基因的表達(dá) 。 ?CpG 位點(diǎn)不是均勻分布,而是呈現(xiàn)局部聚集傾向,形成一些 GC 含量較高、 CpG 雙核苷酸相對(duì)聚集的區(qū)域,即 CpG 島。 ?常見的 DNA 甲基化發(fā)生在 DNA 鏈上的胞嘧啶第 5位碳原子和甲基間的共價(jià)結(jié)合,胞嘧啶由此被修飾為 5甲基胞嘧啶 ( 5mC) 。 脊椎動(dòng)物與高等植物普遍利用 DNA甲基化作為重要的調(diào)控機(jī)制。 簡(jiǎn)單地把 DNA甲基化理解為“一把鎖”,凡是被 DNA甲基化標(biāo)記的部分,大都是需要被“塵封”“監(jiān)禁”的基因,比如基因組的“搗蛋鬼” — 轉(zhuǎn)座子,就是被甲基化這把“鎖”管制著,失去管制或管制不嚴(yán),這些“搗蛋鬼”會(huì)在基因組里
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