原核生物的轉(zhuǎn)錄及調(diào)控-文庫(kù)吧資料
2025-01-19 14:43本頁(yè)面
【正文】 polyU結(jié)構(gòu)。 NusA protein ： ★ 69 Kd, acid protein ★ RNApolattaching factor ★ Impel RNApol. pausing in terminator for 1’15’ and waiting for Rho factor to stop transcription of RNA ★ After initiation → substituting σ → NusA + core E antitermination N protein utilization substance NusA binds to polymerase, and N binds to both NusA and box B of the nut site region of the transcript, creating a loop in the growing RNA. This plex is relatively weak and can cause antitermination only at terminators near the nut site (These conditions exist only in vitro.). (Nut N binding site ) antitermination N protein 三、 原核生物 轉(zhuǎn)錄 的終止 ? 轉(zhuǎn)錄的終止依賴于 RNA產(chǎn)物的特定序列； ? 原核和某些真核生物的終止子要求轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 RNA 3’端具有發(fā)夾的二級(jí)結(jié)構(gòu)，莖部富有 GC序列； ? 終止子的分類： 根據(jù)終止反應(yīng)是否需要 ρ蛋白 不依賴于 ρ因子的終止子（強(qiáng)終止子） ? 結(jié)構(gòu)特點(diǎn) ： RNA具有一個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu)（富含 GC）和隨后 polyU片段。 ? GC富集區(qū) ：產(chǎn)物 RNA不易釋放； ? IR： 產(chǎn)物形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)，妨礙上游的模板恢復(fù)雙鏈。 Model of the interaction between E. coil RNA polymerase holoenzyme and a promoter DNA Incorporating the first few Nt 二、原核生物轉(zhuǎn)錄的延伸 ? RNA pol沿著模板鏈移動(dòng)， RNA鏈不斷延伸，并保持三元復(fù)合物的結(jié)構(gòu)； ? 轉(zhuǎn)錄泡中的 DNA螺旋前開、后合， RNA延長(zhǎng)，不斷脫離 DNA； ? RNA鏈的延伸速度不是恒定的，在模板富含GC的區(qū)域，轉(zhuǎn)錄就會(huì)減慢 /停頓。 ? σ因子解離，核心酶與模板的親和性下降到非特異性結(jié)合的水平， RNA pol在 DNA鏈上變得容易移動(dòng)，為鏈的延伸創(chuàng)造了條件； ? 游離的 σ因子可以重新進(jìn)行功能循環(huán)。 ? mRNA的起始位點(diǎn)多為 G， 其次為 A ， 很少為 U, 起始點(diǎn)核苷酸的兩側(cè)分別為 C 和 T。 轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的決定 ? 酶與 10 box 的結(jié)合，決定了第一個(gè)起始?jí)A基的選擇。 weak promoter； ★ 35 box, 10 box的差異影響啟動(dòng)子與 RNA pol 中 σ因子的 結(jié)合能力 ； ★ 不同啟動(dòng)子的 35， 10 box間存在較為 保守的標(biāo)準(zhǔn)序列（標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子） ； ★ σ factor is responsible for recognition of consensus sequence of promoter and only required for initiation. RNA pol與啟動(dòng)子的結(jié)合 ? σ因子識(shí)別啟動(dòng)子上結(jié)合位點(diǎn)。 RNA pol. firmly binding site（ B site） Initiation site ： +1 site。 promoter 由兩個(gè)重要部分組成 （一）原核啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu) ● 70 ~ 40 ： up element（ 上游元件） CAPcAMP binding site ● 35 ~ 10： core promoter（ 核心啟動(dòng)子） RNA pol. binding site 基因表達(dá)調(diào)控的正控制位點(diǎn) CAP： Cat
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