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2024-12-13 22:17本頁面
【正文】 wMeans(x)行的平均值 colsum(x) 列的和 colMeans(x)行的平均值 x[i,j] 第 i行，第 j個元素 x[i,],x[,j],x[1:5,2:4] x$colname 引用列，后面為列的名稱 54 矩陣的運算 cbind () 相同行數(shù)的矩陣組合 rbind() 相同列數(shù)的矩陣組合 head() 默認訪問矩陣的前 6行 tail()默認訪問矩陣的最后 6行 attach() 直接調(diào)用數(shù)據(jù)框內(nèi)的列，以列的名稱作為向量的名稱 detach() subset() 條件調(diào)用 subset (iris, select= c(, ), Species == setosa) x[order(177。 x[1:5]。 引用第 5個元素 x[c(3,5,7)] 引用第 3， 5， 7個元素 v c(3,5,7)。 46 數(shù)據(jù)保存 (x,file=“*.txt”) (x,file=“*.csv”) sink(“*.txt”) …… sink() sink開頭， sink()結(jié)束 (file=) edit(x) fix(x) 47 運算符 數(shù)學運算 運算后給出數(shù)值結(jié)果 +, , *, /, ^不僅是運算符，也是函數(shù) ,^(x,1/3) 比較運算 運算后給出判別結(jié)果 (TRUE FALSE) , , =, =, ==, != 三角函數(shù) sin,cos,tan,asin,acos,atan 對數(shù) log,exp,log10,log(x,base) abs()絕對值 組合數(shù) choose(4,2) 組合 bn(1:4,2) 排列 P(m,n)= factorial(m)/factorial(mn) 48 向量的創(chuàng)建 生成向量的函數(shù) c(),rep(),seq(),”:” c(2,5,6,9) rep(2,times=4) seq(from=3, to=21, by=3 ) [1] 3 6 9 12 15 18 21 “:” 1:15 (15:1) [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 通過與向量的組合，產(chǎn)生更為復(fù)雜的向量。 txt文件，制表符間隔 (“*.txt”,head=T) csv文件，逗號間隔 (“*.csv”,head=T) (file=(),header=T) (file=(),header=T) (clipboard) 可以彈出對話框，選擇文件。) 38 常用 R程序包 (I) ade4 利用歐幾里得方法進行生態(tài)學數(shù)據(jù)分析 adephylo 系統(tǒng)進化數(shù)據(jù)挖掘與比較方法 ape 系統(tǒng)發(fā)育與進化分析 apTreeshape 進化樹分析 boot Bootstrap檢驗 cluster 聚類分析 ecodist 生態(tài)學數(shù)據(jù)相異性分析 FD 功能多樣性分析 geiger 物種形成速率與進化分析 39 常用 R程序包 (II) Graphics 繪圖 lattice 柵格圖 maptools 空間對象的讀取和處理 mefa 生態(tài)學和生物地理學多元數(shù)據(jù)處理 mgcv 廣義加性模型相關(guān) mvpart 多變量分解 nlme 線性及非線性混合效應(yīng)模型 ouch 系統(tǒng)發(fā)育比較 pgirmess 生態(tài)學數(shù)據(jù)分析 phangorn 系統(tǒng)發(fā)育分析 40 常用 R程序包 (III) picante 群落系統(tǒng)發(fā)育多樣性分析 raster 柵格數(shù)據(jù)分析與處理 seqinr DNA序列分析 sp 空間數(shù)據(jù)處理 spatstat 空間點格局分析，模型擬合與檢驗 splancs 空間與時空點格局分析 stats R統(tǒng)計學包 SDMTools 物種分布模型工具 vegan 植物與植物群落的排序，生物多樣性計算 41 圖 9 CRAN Task Views： 對程序包的分類介紹 CRAN Task Views 42 R圖形界面： R mander ? R mander是 R的圖形界面之一，是 John Fox教授編寫的，適用于不希望 R編程的用戶。 library(vegan) This is vegan 37 查看程序包幫助文件 vegan 程序包內(nèi)部都有哪些函數(shù)？分別有什么功能？ 查詢程序包內(nèi)容最常用的方法： 1 菜單 幫助 Html幫助 2 查看 pdf幫助文檔 3 引用 citation(package = 39。 例如： 要安裝 vegan包 ,在控制臺中輸入 (vegan) 36 程序包使用 程序包的中函數(shù)，都要先導(dǎo)入，再使用，因此導(dǎo)入程序包是第一步。 如何尋找包 ? 29 如何尋找包 ? 30 如何尋找包 ? 31 如何尋找包 ? 32 如何尋找包 ? 33 如何尋找包 ? 34 35 安裝程序包的方法 1 安裝本地 zip包 路徑： Packagesinstall packages from local files 選擇本地磁盤上存儲 zip包的文件夾。 為什么要安裝程序包？ R程序包是 R功能擴展，特定的分析功能，需要用相應(yīng)的程序包實現(xiàn)。 Window下的 R程序包是經(jīng)過編譯的 z
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