4-分子流行病學(xué)(參考版)
2024-10-05 20:36本頁面
【正文】 ?？寺∪?(clone cluster)：遺傳關(guān)系非常緊密的多個(gè)生物克隆，可以劃分為一個(gè)克隆群?；虮磉_(dá)異常和代謝異常。 1972年 Kilbourne 博士在美國傳染病學(xué)會(huì)第 10次年會(huì)上作了題為 “流感的分子流行病學(xué)〞的報(bào)告。 第五十九頁，共六十頁。隨著先進(jìn)的生物標(biāo)志檢測技術(shù)、計(jì)算機(jī)技術(shù)、信息技術(shù)和統(tǒng)計(jì)學(xué)方法等的不斷引入，分子流行病學(xué)將把流行病學(xué)提高到一個(gè)嶄新階段。 第五十七頁，共六十頁。 第五十六頁，共六十頁。 ? 病原體研究 ? 人群感染和傳染源研究 ? 傳播途徑研究 ? 人群易感性研究 ? 疫苗及免疫預(yù)防制劑的研究 ? 防治對(duì)策和措施研究及其效果評(píng)價(jià) 第五十五頁，共六十頁。 應(yīng)用前景 ?傳染病預(yù)防控制 ?慢性非傳染病預(yù)防控制 ?健康狀態(tài)研究 第五十四頁，共六十頁。該方法的使用可望為布氏桿菌病的分子流行病學(xué)研究提供了簡單和實(shí)用的生物學(xué)標(biāo)志。 ? 結(jié)果分析 用 REP－ PCR技術(shù)可把 34 種布氏桿菌進(jìn)一步分為 9 個(gè)型，后以 ERIC－ PCR又可分出 13 個(gè)型，綜合這兩種方法可以區(qū)除牛種的 3 型和 9 型生物型以外的各種不同布氏桿菌。 實(shí)例二 ? 研究目的 研究布魯氏菌的生物標(biāo)志 ? 測量指標(biāo) 布魯氏菌的核苷酸序列同源性 ? 測量方法 基因外重復(fù)回文 PCR(REP－ PCR)、細(xì)菌內(nèi)基 ? 因重復(fù)一致 PCR(ERIC－ PCR)和核酸測序 ? 研究設(shè)計(jì) 研究者選擇了來自近 20 個(gè)國家和地區(qū)的 34 株不同種、不同生物型的布氏桿菌，這些細(xì)菌分屬于牛種、豬種、犬種、沙林鼠種、羊種、綿羊附睪種等 6 種 7 個(gè)生物型。采用分子流行病學(xué)方法 ,有力地證實(shí)了 SNV 病毒是經(jīng)鹿鼠傳播給人的 ,并明確了暴露地點(diǎn) ,有助于深入研究相關(guān)因素 ,以有效地控制漢坦病毒肺綜合征的發(fā)生與流行。 實(shí)例一 ? 研究題目 人漢坦病毒病〔 SNV〕與病毒宿主關(guān)系確實(shí)定 ? 測量標(biāo)志 〔 SNV〕 /鹿鼠組織、血清、肺；死者取肺組織、 ? 存活者采集外周血單核細(xì)胞〔介質(zhì)〕 ? 測量方法 PCR、 Western blotting ? 研究設(shè)計(jì) SNV 病毒的序列患者住宅的鹿鼠、附近對(duì)照住宅的 ? 鹿鼠、遠(yuǎn)處對(duì)照住宅的鹿鼠，所攜帶 SNV 病毒的序列比對(duì)；用蛋白印跡法進(jìn)行 SNV 的 IgM和 IgG抗體檢測患者和死亡者的感染情況；用反轉(zhuǎn)錄 PCR(RT－ PCR)擴(kuò)增 SNV RNA 中的特征片段 ,比較該片段上患者體內(nèi)病毒與鼠攜帶病毒的基因序列，應(yīng)用種系發(fā)生分析法判定病毒與宿主的聯(lián)系。 第五十頁，共六十頁。狹義 一個(gè)生物體的無性繁殖群體，稱為一個(gè)克隆。 ? 基因型 (genotype)：具有相同遺傳結(jié)構(gòu)的一類生物體。 資料分析 ? 傳統(tǒng)流行病學(xué)分析 生物標(biāo)志發(fā)生率、檢出率、危險(xiǎn)度；均數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差等 ? 血清流行病學(xué)分析 抗體的幾何平均滴度、陽性率、感染率等 ? 遺傳多態(tài)性分析 等位基因頻率、遺傳多態(tài)度、雜合度等 ? 遺傳關(guān)系分析過 遺傳一致性 (如相似系數(shù) S)、遺傳差異 (如 遺傳距離 D) 遺傳關(guān)系樹等 第四十八頁，共六十頁。 ? 輔以動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究問題 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)可以較好控制 ? 影響因素，連續(xù)采樣、動(dòng)態(tài)觀察 ? 研究樣本量的估計(jì)問題 原理和方法同一般流行病學(xué)研 ? 究設(shè)計(jì)。 ? 宏觀資料的收集：不應(yīng)無視 ? 偏倚的控制： ? 選擇偏倚：樣本選擇偏倚、標(biāo)本采集偏倚〔如采集的部位、時(shí)間、機(jī)體狀態(tài)、方法等〕 ? 信息偏倚：檢測偏倚、標(biāo)本儲(chǔ)存偏倚〔儲(chǔ)存條件和時(shí)間〕。 第四十六頁，共六十頁。 研究模式的選擇： 〔見調(diào)查研究方法〕 生物標(biāo)志的選擇： 既要考慮到標(biāo)志物的特異性、檢測的敏感性、穩(wěn)定性以及費(fèi)用等，更要考慮研究的假設(shè)或目的。 實(shí)驗(yàn)室常用檢測技術(shù) ? 核酸技術(shù) 核酸電泳圖譜 核酸酶切電泳圖譜 核酸分子雜交 核酸體外擴(kuò)增 核酸序列分析 PCR ? 蛋白質(zhì)技術(shù) 凝膠電泳、蛋白轉(zhuǎn)印雜交、色譜分析、蛋白質(zhì)測序 ? 酶學(xué)技術(shù) 多位點(diǎn)酶電泳法 ? 生物芯片技術(shù) 基因芯片 ? 其他技術(shù) 免疫學(xué)技術(shù) 如酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) (ELISA)、熒光免疫試驗(yàn) (FIA) 等； 色譜技術(shù) 如高效液相色譜技術(shù) (HPLC)等 第四十五頁，共六十頁。 〔 3〕所有的生物標(biāo)本都應(yīng)有詳細(xì)的背景材料和鑒別標(biāo)識(shí)。 生物標(biāo)本采集和儲(chǔ)存是研究成功的關(guān)鍵 要求： 〔 1〕在采集和儲(chǔ)存過程中不能受到“污染〞，包括外界生物的、化學(xué)的和其他標(biāo)本的“交叉污染〞。 生物標(biāo)本庫〔 biological specimen bank, BSB〕：是指儲(chǔ)存有一種類型或多種類型生物標(biāo)本，并能保持它們的生物活性以供研究之用的系統(tǒng)。 第四十二頁，共六十頁。 現(xiàn)場調(diào)查研究方法 ? 傳統(tǒng)的現(xiàn)場流行病學(xué)研究方法 ,即描述性研究、分析性研究與干預(yù)性研究均可應(yīng)用于分子流行病學(xué)。 第四十頁，共六十頁。 標(biāo)本采集 ?
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