北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部生物物理學(xué)系(參考版)
2024-12-31 21:47本頁(yè)面
【正文】 多巴胺 ， 幾茶酚胺也有類(lèi)似情況 謝謝觀看 /歡迎下載 BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES. BY FAITH I BY FAITH 。柔性也是一個(gè)動(dòng)態(tài)性質(zhì)的表征，有柔性才會(huì)發(fā)生構(gòu)象重組織。 所以配基與受體必須在空間結(jié)構(gòu)和電性特征上有很強(qiáng)的互補(bǔ)性才能產(chǎn)生有效的作用 受體與配基相互作用的 立體結(jié)構(gòu)問(wèn)題 ? 第三，必須照顧到剛性與柔性的平衡。這個(gè)動(dòng)態(tài)過(guò)程完成得越好，受體與配基之間所形成的復(fù)合物越穩(wěn)定 受體與配基相互作用的 立體結(jié)構(gòu)問(wèn)題 ? 受體與配基具有生物效應(yīng)的相互作用應(yīng)該具備如下特點(diǎn)： ? 首先 ， 受體 、 配基雙方接觸面積要大 。在電性特征方面是指在氫鍵的形成、靜電相互作用、 ?鍵的堆積及疏水作用中鍵合位點(diǎn)上電荷分布的最佳匹配 ? 二是預(yù)組織原則（ preanization）。配基與受體的互補(bǔ)包括空間結(jié)構(gòu)的互補(bǔ)性及電性特征的互補(bǔ)性。 一條受體蛋白質(zhì)的多肽鏈只有通過(guò)折疊成特定的空間構(gòu)象 ， 才有功能可言 ? 所謂受體的活性 ， 實(shí)際上就是受體的活性構(gòu)象 ，對(duì)受體與配基相互作用的研究也是主要圍繞著受體的構(gòu)象展開(kāi)的 受體與配基相互作用的 立體結(jié)構(gòu)問(wèn)題 ? 受體和配基的相互作用有著嚴(yán)格的立體化學(xué)要求。 換句話說(shuō) ，范德華力是非特異性的作用力 ， 分子越復(fù)雜 ，原子或基團(tuán)間接觸點(diǎn)越多 ， 其引力總和越大 ? 根據(jù)熱力學(xué)計(jì)算 ， 甾類(lèi)化合物與受體結(jié)合能的主要來(lái)源是范德華力與疏水作用 ? 疏水作用是有機(jī)分子在水溶液中 ， 由于有機(jī)基團(tuán)間的靜電力 、 氫鍵 、 范德華力的作用 ， 使有機(jī)分子傾向于聚集在一起 ， 因而產(chǎn)生排斥水分子的作用 ? 就配基和受體而言 ， 它們的非極性部分在體液中均為水合狀態(tài) 。 現(xiàn)在應(yīng)用最廣泛的范德華半徑是由 Pauling所給定的數(shù)值 ，而數(shù)據(jù)最全而又被一些人認(rèn)為是最合適的范德華半徑是由 Bondi所給定的數(shù)值 。和吸引力相比 ， 排斥力是短程力 ， 其作用能可近似表達(dá)為： ? 式中， A是個(gè)正值參數(shù)、 n為 9~12的數(shù)值 nrAE ?斥 范德華力 ? 分子間相互作用的范德華力的總的勢(shì)能可表示為： ? A和 B為常數(shù) ， 可通過(guò)實(shí)驗(yàn)測(cè)定 6rBrAEn ??總 范德華力 ? LennardJones認(rèn)為多數(shù)物質(zhì) n=12時(shí)符合較好 ， 這樣分子間作用能可用 LennardJones 612關(guān)系式表達(dá)： ? 根據(jù)該公式作 Er曲線時(shí) ， 曲線會(huì)出現(xiàn)最低點(diǎn) ， 相應(yīng)這點(diǎn)的距離為平衡距離 ， 此時(shí)體系的能量最低 ， 分子間保持一定的接觸距離 。 瞬間偶極矩將在鄰近分子中誘導(dǎo)出新的偶極矩 。 范德華力 誘導(dǎo)力 : ? 永久偶極矩將誘導(dǎo)鄰近分子使發(fā)生電荷位移 ， 出現(xiàn)誘導(dǎo)偶極矩 。 在一些生物小分子水合物晶體中 ， 分叉氫鍵比普通氫鍵出現(xiàn)的機(jī)會(huì)更多一些 3. 范德華力 ? 范德華力是一種普遍存在的作用力，是一個(gè)原子的原子核吸引另一個(gè)原子外圍電子所產(chǎn)生的作用力 ? 范德華力是一種比較弱的、非特異性的作用力 ? 范德華力非常依賴(lài)原子間的距離，當(dāng)相互靠近到大約 ~（ 46197。 ? 非直線型氫鍵比直線型弱，一般只有 （ 2kcal/mol）左右，比水分子氫鍵的特征值(5kcal/mol) 弱得多，但許多這樣的弱作用的合力是很大的，對(duì)穩(wěn)定生物大分子的高級(jí)結(jié)構(gòu)起重要作用 氫鍵的分類(lèi) ? 按氫鍵強(qiáng)弱進(jìn)行分類(lèi) 。~125176。質(zhì)子接受體均有未成鍵的 p電子或 π電子，通常有 OH、 OR、 NH N（芳香氮）、 NHR、鹵素、 SR、 C=C、 C=N等 氫鍵 ? 在生物體系中，基本溶劑水以及蛋白質(zhì)、核酸等都含有大量能形成氫鍵的基團(tuán) ? 藥物進(jìn)入生物體系以及構(gòu)成特殊狀態(tài)與受體分子間相互作用的過(guò)程中，氫鍵對(duì)分子的取向有非常重要的作用 ? 最常見(jiàn)的氫鍵在羥基和胺基之間形成 ? 生物體系中超分子的自組裝離不開(kāi)氫鍵的參與，如 DNA分子中的 A:T及 G:C殘基間的氫鍵作用 氫鍵 氫鍵的大小及方向 : ? 氫鍵的大小通常由氫鍵的鍵能來(lái)描述 ， 它是指發(fā)生下列過(guò)程所需要的能量 XH???YR→ XH + YR ? 氫鍵的鍵能比共價(jià)鍵弱，比范德華力強(qiáng)，在生物體系中通常為 ~(2~8kcal/mol)。水分子是偶極分子，它可
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