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北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部生物物理學(xué)系-全文預(yù)覽

2025-01-12 21:47 上一頁面

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【正文】 ? 根據(jù)該公式作 Er曲線時 , 曲線會出現(xiàn)最低點 , 相應(yīng)這點的距離為平衡距離 , 此時體系的能量最低 , 分子間保持一定的接觸距離 。 范德華力 誘導(dǎo)力 : ? 永久偶極矩將誘導(dǎo)鄰近分子使發(fā)生電荷位移 , 出現(xiàn)誘導(dǎo)偶極矩 。 ? 非直線型氫鍵比直線型弱,一般只有 ( 2kcal/mol)左右,比水分子氫鍵的特征值(5kcal/mol) 弱得多,但許多這樣的弱作用的合力是很大的,對穩(wěn)定生物大分子的高級結(jié)構(gòu)起重要作用 氫鍵的分類 ? 按氫鍵強弱進行分類 。質(zhì)子接受體均有未成鍵的 p電子或 π電子,通常有 OH、 OR、 NH N(芳香氮)、 NHR、鹵素、 SR、 C=C、 C=N等 氫鍵 ? 在生物體系中,基本溶劑水以及蛋白質(zhì)、核酸等都含有大量能形成氫鍵的基團 ? 藥物進入生物體系以及構(gòu)成特殊狀態(tài)與受體分子間相互作用的過程中,氫鍵對分子的取向有非常重要的作用 ? 最常見的氫鍵在羥基和胺基之間形成 ? 生物體系中超分子的自組裝離不開氫鍵的參與,如 DNA分子中的 A:T及 G:C殘基間的氫鍵作用 氫鍵 氫鍵的大小及方向 : ? 氫鍵的大小通常由氫鍵的鍵能來描述 , 它是指發(fā)生下列過程所需要的能量 XH???YR→ XH + YR ? 氫鍵的鍵能比共價鍵弱,比范德華力強,在生物體系中通常為 ~(2~8kcal/mol)。水分子是偶極分子,它可與帶有羰基或雜原子的藥物作用 ? 藥物也可與蛋白質(zhì)受體等生物大分子的極性基團作用 ? 偶極 偶極作用對配基 — 受體相互作用的特異性和立體選擇性非常重要 2. 氫鍵 氫鍵的形成 : ? 氫鍵是由兩個負(fù)電性原子 (N, O, S等 ) 對氫原子的靜電引力所形成,是一種特殊的偶極 偶極鍵 ? 它是質(zhì)子給予體 XH和質(zhì)子接受體 Y之間一種特殊類型的相互作用,是 H原子和電負(fù)性很強的雜原子之間作用的鍵,即 XH這種偶極部分與持久電荷可以形成靜電作用 離子 — 偶極相互作用 ? 相互作用能由下式表示 ? 式中 ?為偶極矩, θ為偶極方向與電荷至偶極中心連線的夾角, q為電荷電量, ?為介電常數(shù), r為電荷與偶極中心的距離。 Kd值小于109mol/L的通常稱為高親和力 ? 受體的親和力和配基種類有關(guān) , 評價 Kd 值的絕對值大小必須指明配基的種類 受體與配基結(jié)合反應(yīng)的基本特性 4. 生物效應(yīng)的相關(guān)性 ? 受體的主要功能是介導(dǎo)配基的生物學(xué)效應(yīng) , 如果一種蛋白能與某種物質(zhì)相結(jié)合而并不介導(dǎo)特定的生物學(xué)效應(yīng) , 那么這種蛋白不能稱之為受體 ? 生物效應(yīng)和受體結(jié)合反應(yīng)需有兩方面的匹配 :一是濃度上的匹配 , 二是組織分布的匹配 ? 如果某種化合物與某種受體有結(jié)合 , 但該化合物的結(jié)合濃度明顯不同于它引起生物效應(yīng)的濃度 , 或者它引起生物效應(yīng)的組織和它結(jié)合的組織不一致 , 那么這種化合物和受體的結(jié)合是否屬于特異結(jié)合就有疑問 受體與配基相互作用 受體和配基的相互作用力和結(jié)合能 ? 受體與配基的相互作用的本質(zhì)為物理化學(xué)過程 ? 作用力源自于帶電荷基團間的靜電作用或者非極性分子間的吸引作用 ? 配基與受體的相互作用既然是一種物理化學(xué)過程 , 必然有成鍵過程 , 一定有能量釋放 受體與配基相互作用 ? 根據(jù) Hammett方程 ? R是氣體常數(shù) , T是絕對溫度 , Ka是結(jié)合平衡常數(shù) ? ?G176。 ? 特異的受體結(jié)合反應(yīng)其受體呈高親和性和低容量 , 非特異結(jié)合則呈低親和性和高容量 受體與配基結(jié)合反應(yīng)的基本特性 2. 可逆性 ? 內(nèi)源性配基和特異受體的結(jié)合反應(yīng)屬于可逆反應(yīng) ? 當(dāng)周圍的配基濃度降低時 , 形成的復(fù)合物就會解離 ,重新變成游離的配基和受體 ? 這種可逆性是受體對周圍環(huán)境變化快速和正確反應(yīng)的基礎(chǔ) ? 外源性配基則有兩類不同的情況 ? 很多外源性配基和受體的結(jié)合也是可逆反應(yīng) , 解離后的配基是原形 ? 另有一類不可逆阻斷劑與受體形成的復(fù)合物是不可逆的 , 最終導(dǎo)致受體分子的破壞和配基的代謝變化 受體與配基結(jié)合反應(yīng)的基本特性 3. 特異性 ? 受體具有特異識別配基的性能 , 特定的受體只識別特定的配基 ? 受體識別配基的基礎(chǔ)是受體某個部位的立體結(jié)構(gòu) , 即受體蛋白的構(gòu)象 ? 各種受體的識別能力是不同的 , 受體識別能力強 , 受體特異性就好 ? 受體的識別還和配基的構(gòu)型和構(gòu)象有關(guān) ,只有存在嚴(yán)格構(gòu)型和構(gòu)象的配基分子才能選擇性地與其受體結(jié)合 ? 受體的特異性還表現(xiàn)在器官或組織的專一性 ( 稱靶器
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