北京大學醫(yī)學部生物物理學系(存儲版)
【正文】 系中超分子的自組裝離不開氫鍵的參與，如 DNA分子中的 A:T及 G:C殘基間的氫鍵作用 氫鍵 氫鍵的大小及方向 : ? 氫鍵的大小通常由氫鍵的鍵能來描述 ， 它是指發(fā)生下列過程所需要的能量 XH???YR→ XH + YR ? 氫鍵的鍵能比共價鍵弱，比范德華力強，在生物體系中通常為 ~(2~8kcal/mol)。 范德華力 誘導力 : ? 永久偶極矩將誘導鄰近分子使發(fā)生電荷位移 ， 出現(xiàn)誘導偶極矩 。 換句話說 ，范德華力是非特異性的作用力 ， 分子越復雜 ，原子或基團間接觸點越多 ， 其引力總和越大 ? 根據(jù)熱力學計算 ， 甾類化合物與受體結合能的主要來源是范德華力與疏水作用 ? 疏水作用是有機分子在水溶液中 ， 由于有機基團間的靜電力 、 氫鍵 、 范德華力的作用 ， 使有機分子傾向于聚集在一起 ， 因而產生排斥水分子的作用 ? 就配基和受體而言 ， 它們的非極性部分在體液中均為水合狀態(tài) 。這個動態(tài)過程完成得越好，受體與配基之間所形成的復合物越穩(wěn)定 受體與配基相互作用的 立體結構問題 ? 受體與配基具有生物效應的相互作用應該具備如下特點： ? 首先 ， 受體 、 配基雙方接觸面積要大 。 多巴胺 ， 幾茶酚胺也有類似情況 謝謝觀看 /歡迎下載 BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES. BY FAITH I BY FAITH 。在電性特征方面是指在氫鍵的形成、靜電相互作用、 ?鍵的堆積及疏水作用中鍵合位點上電荷分布的最佳匹配 ? 二是預組織原則（ preanization）。 現(xiàn)在應用最廣泛的范德華半徑是由 Pauling所給定的數(shù)值 ，而數(shù)據(jù)最全而又被一些人認為是最合適的范德華半徑是由 Bondi所給定的數(shù)值 。 在一些生物小分子水合物晶體中 ， 分叉氫鍵比普通氫鍵出現(xiàn)的機會更多一些 3. 范德華力 ? 范德華力是一種普遍存在的作用力，是一個原子的原子核吸引另一個原子外圍電子所產生的作用力 ? 范德華力是一種比較弱的、非特異性的作用力 ? 范德華力非常依賴原子間的距離，當相互靠近到大約 ~（ 46197。 (KJmol1) ? 共價鍵 (170~420) ? 離子鍵 (21~42) ? 偶極鍵 (4~29) ? 氫鍵 (4~29) ? 疏水鍵 4 ? 范特華力 (2~4) 受體與配基相互作用 ? 實驗證據(jù)表明 ， 配體與受體相互作用是可逆反應 ? 它們之間的作用力是屬于較弱的次級鍵 ? 靜電作用 ? 氫鍵 ? 范德華力 ? 疏水鍵等 受體與配基相互作用 1. 靜電作用 ? 靜電作用是指荷電基團 、 偶極以及誘導偶極之間的靜電吸引力 ? 靜電作用包括離子鍵 、 離子 偶極相互作用和偶極 偶極相互作用等三個方面 ? 受體蛋白質的表面都有可電離的基團和偶極基團 ，受體蛋白質的活性中心大都有極性區(qū)域 ， 易與含極性基團的配基生成離子鍵和其他靜電作用 ? 就藥物而言 ， 它和受體的最初作用通常是由于受體的活性中心極性基團對它的吸引所引起 。是成鍵時釋放的自由能，其值與 Ka的對數(shù)成正比，所以 Ka值是評估成鍵作用能力的物理量 , 是受體和配基的結合能力的物理量 ao KRTG ln??? 化學鍵類型與自由能的關系 化學鍵類型 ?G176。 這種方法依據(jù)譜波學和晶體結構數(shù)據(jù)進行分類 分類 ?OH (cm1) r(O???H) (nm) 實例 弱氫鍵 3200 H2O (冰 、 水合物 ） ROH (醇 、 酚 ) 中強氫鍵 2800~3100 ~ RCOOH (羧酸 ) 強氫鍵 700~2700 ~ MH(RCOO)2 (酸鹽 ) 氫鍵的分類 ? 兩種特殊形式的氫鍵 : ? 對稱氫鍵 ， 即氫鍵質子位于給體和受體原子間連線的中點 ， 已知的實例有 KHF2和二
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