北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部生物物理學(xué)系(存儲(chǔ)版)
【正文】 系中超分子的自組裝離不開氫鍵的參與，如 DNA分子中的 A:T及 G:C殘基間的氫鍵作用 氫鍵 氫鍵的大小及方向 : ? 氫鍵的大小通常由氫鍵的鍵能來描述 ， 它是指發(fā)生下列過程所需要的能量 XH???YR→ XH + YR ? 氫鍵的鍵能比共價(jià)鍵弱，比范德華力強(qiáng)，在生物體系中通常為 ~(2~8kcal/mol)。 范德華力 誘導(dǎo)力 : ? 永久偶極矩將誘導(dǎo)鄰近分子使發(fā)生電荷位移 ， 出現(xiàn)誘導(dǎo)偶極矩 。 換句話說 ，范德華力是非特異性的作用力 ， 分子越復(fù)雜 ，原子或基團(tuán)間接觸點(diǎn)越多 ， 其引力總和越大 ? 根據(jù)熱力學(xué)計(jì)算 ， 甾類化合物與受體結(jié)合能的主要來源是范德華力與疏水作用 ? 疏水作用是有機(jī)分子在水溶液中 ， 由于有機(jī)基團(tuán)間的靜電力 、 氫鍵 、 范德華力的作用 ， 使有機(jī)分子傾向于聚集在一起 ， 因而產(chǎn)生排斥水分子的作用 ? 就配基和受體而言 ， 它們的非極性部分在體液中均為水合狀態(tài) 。這個(gè)動(dòng)態(tài)過程完成得越好，受體與配基之間所形成的復(fù)合物越穩(wěn)定 受體與配基相互作用的 立體結(jié)構(gòu)問題 ? 受體與配基具有生物效應(yīng)的相互作用應(yīng)該具備如下特點(diǎn)： ? 首先 ， 受體 、 配基雙方接觸面積要大 。 多巴胺 ， 幾茶酚胺也有類似情況 謝謝觀看 /歡迎下載 BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES. BY FAITH I BY FAITH 。在電性特征方面是指在氫鍵的形成、靜電相互作用、 ?鍵的堆積及疏水作用中鍵合位點(diǎn)上電荷分布的最佳匹配 ? 二是預(yù)組織原則（ preanization）。 現(xiàn)在應(yīng)用最廣泛的范德華半徑是由 Pauling所給定的數(shù)值 ，而數(shù)據(jù)最全而又被一些人認(rèn)為是最合適的范德華半徑是由 Bondi所給定的數(shù)值 。 在一些生物小分子水合物晶體中 ， 分叉氫鍵比普通氫鍵出現(xiàn)的機(jī)會(huì)更多一些 3. 范德華力 ? 范德華力是一種普遍存在的作用力，是一個(gè)原子的原子核吸引另一個(gè)原子外圍電子所產(chǎn)生的作用力 ? 范德華力是一種比較弱的、非特異性的作用力 ? 范德華力非常依賴原子間的距離，當(dāng)相互靠近到大約 ~（ 46197。 (KJmol1) ? 共價(jià)鍵 (170~420) ? 離子鍵 (21~42) ? 偶極鍵 (4~29) ? 氫鍵 (4~29) ? 疏水鍵 4 ? 范特華力 (2~4) 受體與配基相互作用 ? 實(shí)驗(yàn)證據(jù)表明 ， 配體與受體相互作用是可逆反應(yīng) ? 它們之間的作用力是屬于較弱的次級(jí)鍵 ? 靜電作用 ? 氫鍵 ? 范德華力 ? 疏水鍵等 受體與配基相互作用 1. 靜電作用 ? 靜電作用是指荷電基團(tuán) 、 偶極以及誘導(dǎo)偶極之間的靜電吸引力 ? 靜電作用包括離子鍵 、 離子 偶極相互作用和偶極 偶極相互作用等三個(gè)方面 ? 受體蛋白質(zhì)的表面都有可電離的基團(tuán)和偶極基團(tuán) ，受體蛋白質(zhì)的活性中心大都有極性區(qū)域 ， 易與含極性基團(tuán)的配基生成離子鍵和其他靜電作用 ? 就藥物而言 ， 它和受體的最初作用通常是由于受體的活性中心極性基團(tuán)對(duì)它的吸引所引起 。是成鍵時(shí)釋放的自由能，其值與 Ka的對(duì)數(shù)成正比，所以 Ka值是評(píng)估成鍵作用能力的物理量 , 是受體和配基的結(jié)合能力的物理量 ao KRTG ln??? 化學(xué)鍵類型與自由能的關(guān)系 化學(xué)鍵類型 ?G176。 這種方法依據(jù)譜波學(xué)和晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行分類 分類 ?OH (cm1) r(O???H) (nm) 實(shí)例 弱氫鍵 3200 H2O (冰 、 水合物 ） ROH (醇 、 酚 ) 中強(qiáng)氫鍵 2800~3100 ~ RCOOH (羧酸 ) 強(qiáng)氫鍵 700~2700 ~ MH(RCOO)2 (酸鹽 ) 氫鍵的分類 ? 兩種特殊形式的氫鍵 : ? 對(duì)稱氫鍵 ， 即氫鍵質(zhì)子位于給體和受體原子間連線的中點(diǎn) ， 已知的實(shí)例有 KHF2和二
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