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ngs測(cè)序技術(shù)與分析流程圖(參考版)

2025-08-08 00:40本頁面
  

【正文】 知識(shí)回顧Knowledge Review 謝 謝! 放映結(jié)束 感謝各位的批評(píng)指導(dǎo)! 讓我們共同進(jìn)步 。 小 RNA測(cè)序 果蠅三種組織中 MiRNA表達(dá)情況 MiRNA表達(dá)模式分析 新 miRNA預(yù)測(cè) miRNA編輯情況分析與統(tǒng)計(jì) 分析軟件介紹 ? 質(zhì)量控制軟件 (Quality Control) ? 定位軟件 (Mapping the reads) ? 已知基因(差異)表達(dá)評(píng)估軟件 (Differential Expression) ? 新基因鑒定軟件 (New gene identification) ? 可視化展示軟件 (Virsulization) ? 基因功能注釋軟件 (GO term or KEGG pathway analysis) 數(shù)據(jù)格式示例 Fastq 格式 Color Space 格式 Phred score 質(zhì)量控制 利用 galaxy進(jìn)行原始數(shù)據(jù)處理 Galaxy History 39。91)43),(95, A. SOLiD Oligo熒光基團(tuán)模式圖 B. SOLiD 測(cè)序結(jié)果示例( Color Space) SOLiD 的特點(diǎn)與主要應(yīng)用 ? 讀長(zhǎng)較短, 5075bp ? 精度 高,可達(dá) Q40 ? 通量 高, 2030G每天, 1Run 可達(dá) 120G ? 主要 應(yīng)用:基因組重測(cè)序、 SNP檢測(cè)等 Ion torrent Ion Torrent 測(cè)序原理 精度 ? Examples: ? ?? 90% con?dence (10% error rate) = Q10 ? ?? 99% con?dence (1% error rate) = Q20 ? ?? % con?dence (.1% error rate) = Q30
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