生物工程開題報告甲殼類動物4種過敏原的序列分析、抗原表位預(yù)測及三維結(jié)構(gòu)建模(參考版)
2025-01-24 18:06本頁面
【正文】 例如：[1] 李峰,胡征,景蘇等. 納米粒子的控制生長和自組裝研究進展[J]. 無機化學學報， 2001, 17(3): 315~324[2] , ,. Fabrication of zinc oxide nanorods[J]. Journal of Crystal Growth, 2001,233:5～7學術(shù)會議論文集 作者﹒論文題目﹒文集編者姓名﹒學術(shù)會議文集名稱[C]，出版地：出版者，出版年份：頁次例如：[3] 司宗國 謝去病 王群﹒重子湮沒快度關(guān)聯(lián)的研究﹒見趙維勤，高崇壽編﹒第五屆高能粒子產(chǎn)生和重離子碰撞理論研討會文集[C]，北京：中國高等科學技術(shù)中心，1996：105圖書 著者﹒書名[M]﹒版本﹒出版地：出版者，出版年﹒頁次如果該書是第一版則可以略去版次。 (4) 6月1號~6月12號根據(jù)實驗的結(jié)果認真撰寫畢業(yè)論文，要嚴格按學校教務(wù)處規(guī)定的學位論文書寫格式要求撰寫，材料方法詳細明確，結(jié)果可靠，并對實驗結(jié)果進行分析。 (2) 5月09號~5月18號對預(yù)測結(jié)果進行認真的分析、總結(jié)，得出合理的結(jié)論。(1) 4月6號~5月08號搜索6種過敏蛋白的相關(guān)的信息，應(yīng)用相應(yīng)軟件（DNAstar、Bcepred等），采用不同的算法對6種蛋白的抗原指數(shù)、親水性、蛋白表面的可及性及柔韌性進行預(yù)測，應(yīng)用ProtParam、TargetP、SiganalP、ProtScale、TMHMM 、SOPMA等軟件分析蛋白的結(jié)構(gòu)功能。采用Jamesonwolf法對抗原指數(shù)進行預(yù)測，KyteDoolittle法預(yù)測親水性，Enimin法預(yù)測蛋白表面可極性，KarplusSchulz法預(yù)測柔韌性。（4）對模建的結(jié)構(gòu)進行優(yōu)化和評價。（2）依次模建目的蛋白結(jié)構(gòu)保守區(qū)的主鏈、結(jié)構(gòu)變異區(qū)的主鏈。在此通過SWISSMODEL同源模建各蛋白的三級結(jié)構(gòu)。 motif分析在此試使用PROSITE進行motif搜索。亞細胞定位預(yù)測的過程包括以下幾個步驟:（1)建立數(shù)據(jù)庫，抽取出一個高質(zhì)量的亞細胞定位數(shù)據(jù)集并分為訓(xùn)練集和測試集；（2）從這些蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)中抽取出特征信息向量；（3）選擇合適的算法，根據(jù)前面的特征信息向量作出預(yù)測；（4）用檢驗數(shù)據(jù)集對預(yù)測結(jié)果進行評價。在此使用SecretomeP預(yù)測真核生物中非經(jīng)典類型的和無導(dǎo)肽的分泌蛋白。在此我使用ProtScale程序在線分析和和使用生物軟件BioEdit分析其疏水性。 蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測殼可以通過同源建模、Threadding、TPITS等方法進行，同源建模是最主要的方法。（1） B細胞抗原表位理論預(yù)測方案包括：級結(jié)構(gòu)預(yù)測方案、抗原性方案、可及性方案、電荷分布方案、可塑性方案、親水性方案、柔韌性方案、抗原指數(shù)方案。（9) 蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測：蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)指的是一條多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)，超二級結(jié)構(gòu)，甚至在結(jié)構(gòu)域的基礎(chǔ)之上，再進一步折疊盤繞，依靠次級鍵的固定維系所形成的一種特定的空間結(jié)構(gòu)。（7) 結(jié)構(gòu)域分析：結(jié)構(gòu)域是蛋白質(zhì)的功能、結(jié)構(gòu)和進化單元，結(jié)構(gòu)功能域分析對于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分類和預(yù)測有著重要的作用。（5) Coil區(qū)分析：卷曲螺旋（Coiled coil)是蛋白質(zhì)由27條螺旋鏈纏繞形成類似麻花狀結(jié)構(gòu)的總稱。（3) 跨膜區(qū)分析：目前跨膜蛋白預(yù)測的算法都是基于統(tǒng)計學模型或神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，綜合不同的軟件預(yù)測結(jié)果并結(jié)合疏水性圖，可獲得較好的預(yù)測結(jié)果。（2) 疏水性分析：組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸各自帶有不同極性的側(cè)鏈集團。 Immunology,2012,46(3):180～197.[3] [D].泰安:山東農(nóng)業(yè)大學2008． [4] Vale RD ,Milligan R A ,The way things move:looking under the hood of molecular motor proteins [J ].Science,2000,5463 (288):88～95.[5] Daul CB ,Slattery M ,Reese G ,eta1,Identifi cation of the major brow shrimp as the muscle protein tropomyosin [J].Int Arch allergy Clin Immunol,1994,105(1):49～55．[6]郭春艷,趙向絨, 細胞抗原表位的研究進展及其應(yīng)用[J].生物技術(shù)通 訊,2013,24(2):266～270.[7] 劉光明,沈苑,曹敏杰,純化和檢測技術(shù)研究[J].中國食品學報,2008,8(6):142～148.[8] 黃園園,劉光明,周利亙,[J].,9(4):15～22．[9] Leung PS，Chow WK，Dufey S，eta1．IgE reactivity against acrossr
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