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基因芯片本科畢業(yè)論文范文(參考版)

2025-01-19 12:03本頁面
  

【正文】 s diseaseCOX7A2LAlzheimer39。s diseaseSDHAAlzheimer39。s diseaseNDUFS8Alzheimer39。s diseaseNDUFS5Alzheimer39。s diseaseNDUFV1Alzheimer39。s diseaseCOX7CAlzheimer39。s diseaseCOX4I1Alzheimer39。s diseaseATP2A1Alzheimer39。s diseaseCOX7A2LParkinson39。s diseaseSDHCParkinson39。s diseaseNDUFS8Parkinson39。s diseaseNDUFS5Parkinson39。s diseaseNDUFV1Parkinson39。s diseaseND3Parkinson39。s diseaseCOX7CParkinson39。s diseaseCOX4I1Parkinson39。s diseaseSLC25A5Parkinson39。見下表:PathwayNameGeneApoptosisAKT2ApoptosisTP53Tolllike receptor signaling pathwayAKT2Tolllike receptor signaling pathwayFOSTolllike receptor signaling pathwayMAP3K7Tolllike receptor signaling pathwayTBK1RibosomeRPSARibosomeRPL4RibosomeRPL18ARibosomeRPL21RibosomeRPL23ARibosomeRPL27RibosomeRPL36ALRibosomeRPL37RibosomeRPS15ARibosomeRPS19RibosomeRPS24RibosomeRPS25RibosomeRPS26RibosomeRPS29RibosomeRPL35T cell receptor signaling pathwayAKT2T cell receptor signaling pathwayCDC42T cell receptor signaling pathwayFOST cell receptor signaling pathwayNRAST cell receptor signaling pathwayMAP3K7Synthesis and degradation of ketone bodiesACAT1Fatty acid elongation in mitochondriaHADHAFatty acid elongation in mitochondriaHADHBChronic myeloid leukemiaACVR1BChronic myeloid leukemiaAKT2Chronic myeloid leukemiaCRKChronic myeloid leukemiaCTBP2Chronic myeloid leukemiaHDAC1Chronic myeloid leukemiaNRASChronic myeloid leukemiaTP53Fc epsilon RI signaling pathwayAKT2Fc epsilon RI signaling pathwayNRASFc epsilon RI signaling pathwayRAC2Fc epsilon RI signaling pathwayRAC3Small cell lung cancerAKT2Small cell lung cancerCDK2Small cell lung cancerLAMB1Small cell lung cancerMAXSmall cell lung cancerTP53Small cell lung cancerPIAS1Ubiquitin mediated proteolysisCDC27Ubiquitin mediated proteolysisSKP1Ubiquitin mediated proteolysisPIAS1Ubiquitin mediated proteolysisCDC23Ubiquitin mediated proteolysisKEAP1Ubiquitin mediated proteolysisUBE2E3Ubiquitin mediated proteolysisCDC26Regulation of autophagyINSProteasomePSMA5ProteasomePSMB2ProteasomePSMB3ProteasomePSMD2ProteasomePSMD3ProteasomePSMD7ProteasomePSME2ProteasomeSHFM1MelanogenesisCREB1MelanogenesisCTNNB1MelanogenesisGNAI2MelanogenesisNRASMelanogenesisFZD9Arginine and proline metabolismCKBArginine and proline metabolismCKMArginine and proline metabolismGATMArginine and proline metabolismP4HA2Reductive carboxylate cycle (CO2 fixation)IDH2Methane metabolismCATPathogenic Escherichia coli infection EPECCDC42Pathogenic Escherichia coli infection EPECCDH1Pathogenic Escherichia coli infection EPECCTNNB1Methionine metabolismAHCYMethionine metabolismBHMTMethionine metabolismMARSMethionine metabolismMTAPType II diabetes mellitusINSType II diabetes mellitusPKM2Maturity onset diabetes of the youngINSMaturity onset diabetes of the youngNEUROD1Fructose and mannose metabolismALDOBFructose and mannose metabolismALDOCFructose and mannose metabolismPFKFB4Propanoate metabolismACADMPropanoate metabolismACAT1Propanoate metabolismHADHAPropanoate metabolismLDHBPropanoate metabolismMUTPropanoate metabolismSUCLA2Renal cell carcinomaAKT2Renal cell carcinomaCDC42Renal cell carcinomaCRKRenal cell carcinomaNRASParkinson39。在PubMed能搜索到信號途徑的過程和功能。進(jìn)入NCBI的官方網(wǎng)站(美國國立生物技術(shù)信息中心)。7)、submit 后,點(diǎn)擊任務(wù)列表中的執(zhí)行按扭,出現(xiàn)提示,點(diǎn)擊確定,即開始運(yùn)行。6)、填寫分析任務(wù)信息,提交分析數(shù)據(jù)。3.信息分析方法步驟如下:1)、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備,第一列為基因symbol、ID 或探針I(yè)D,后面可以附帶數(shù)值,通常為fold change2)、用戶登陸,目前為免費(fèi)注冊使用。后一方法在多聚物的設(shè)計(jì)方面與前者相似,合成工作用傳統(tǒng)的DNA或多肽固相合成儀完成,只是合成后用特殊的自動化微量點(diǎn)樣裝置將其以比較高的密度涂布于硝酸纖維膜、尼龍膜或玻片上。因?yàn)楹铣伤玫膯误w分子一端按傳統(tǒng)固相合成方法活化,另一端受光敏保護(hù)基的保護(hù),所以發(fā)生偶聯(lián)的部位反應(yīng)后仍舊帶有光敏保護(hù)基團(tuán)。每次選取擇適當(dāng)?shù)谋喂饽ぃ╩ask)使需要聚合的部位透光,其它部們不透光。固相合成技術(shù)是當(dāng)前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法,技術(shù)成熟且已實(shí)現(xiàn)自動化。光引導(dǎo)聚合技術(shù)是照相平板印刷技術(shù)(photolithography)與傳統(tǒng)的核酸、多肽固相合成技術(shù)相結(jié)合的產(chǎn)物。作原位合成的支持物在聚合反應(yīng)前要先使其表面衍生出羥基或氨基(視所要固定的分子為核酸或寡肽而定)并與保護(hù)基建立共價(jià)連接;作點(diǎn)樣用的支持物為使其表面帶上正電荷以吸附帶負(fù)電荷的探針分子,通常需包被以氨基硅烷或多聚賴氨酸等。這些方法總體上有兩種,即原位合成(in situ synthesis)與合成點(diǎn)樣兩種。注射完畢,將胚胎置于28℃培養(yǎng)液中培養(yǎng)。方法1.Morpholino根據(jù)所要研究的斑馬魚基因序列設(shè)計(jì)特定的Morphoinos Antisense片段,將特定的Morphoinos片段溶于雙蒸水中配成3mM的儲液,置于20℃保存。谷歌搜索 。美國國立生物技術(shù)信息中心。而且,通過設(shè)計(jì)不同的探針陣列、使用特定的分析方法可使該技術(shù)具有多種不同的應(yīng)用價(jià)值,如基因表達(dá)譜測定、實(shí)變檢測、多態(tài)性分析、基因組文庫作圖及雜交測序等。該公司聚集有多位計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)和分子生物學(xué)專家,其每年的研究經(jīng)費(fèi)在一千萬美元以上,且已歷時(shí)六七年之久,擁有多項(xiàng)專例?,F(xiàn)在全世界已有十多家公司專門從事基因芯片的研究和開發(fā)工作,且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問世。它使得合成、固定高密度的數(shù)以萬計(jì)的探針分子切實(shí)可行,而且借助激光共聚焦顯微掃描技術(shù)使得可以對雜交信號進(jìn)行實(shí)時(shí)、靈敏、準(zhǔn)確的檢測和分析。早在八十年代,Bains ,借助雜交方式進(jìn)行序列測定。因此在深入研究中,將采用多個(gè)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)綜合考查,同時(shí)擴(kuò)大從Friend病毒基因序列預(yù)測多肽的范圍,和從FBL3細(xì)胞表面酸洗抗原混合液中尋找腫瘤抗原,此工作正在進(jìn)行之中。 T細(xì)胞表位或腫瘤抗原的預(yù)測是當(dāng)前免疫學(xué)熱門課題,但尚處于初步階段。認(rèn)為CTL TCR僅識別1到2個(gè)關(guān)鍵氨基酸,并不是對多肽全序列的識別行為。表明這二個(gè)多肽有別于FBL3的腫瘤抗原。表1和表2顯示,多肽體內(nèi)免疫可誘導(dǎo)多肽特異的CTL產(chǎn)生,表明它的免疫原性是確實(shí)存在的。合成多肽驗(yàn)證的第三步是用多肽替代FBL3作體內(nèi)免疫,觀察免疫小鼠能否建立抗FBL3的免疫反應(yīng)。在實(shí)驗(yàn)中把FBL3誘導(dǎo)的活化淋巴細(xì)胞(未經(jīng)過克隆的細(xì)胞)作為效應(yīng)細(xì)胞,觀察到它們明顯地殺傷Gag3,Gag5結(jié)合的EL4,間接表明預(yù)測的7個(gè)多肽中,這二個(gè)多肽很可能是FBL3的腫瘤抗原。預(yù)實(shí)驗(yàn)表明,預(yù)測的7個(gè)多肽均能與H2Db分子結(jié)合。因此用合成多肽來驗(yàn)證多肽的MHC結(jié)合性可以選用這一方法,它可以作為篩選多肽抗原的第一步。根據(jù)MHC等位型特異的多肽結(jié)合基序,可以設(shè)計(jì)出與MHC分子結(jié)合的多肽,這可崐以通過體外實(shí)驗(yàn)予以驗(yàn)證。由于Morphoinos寡核苷酸具有靶基因結(jié)合的高度特異性以及極強(qiáng)的核苷酶抗性,因此可以長效的、特異性誘導(dǎo)目標(biāo)基因的表達(dá)下調(diào)。Zebrafish Morphoinos文庫包括上千個(gè)寡核苷酸序列,每個(gè)寡核苷酸序列都是針對目標(biāo)序列的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的序列互補(bǔ)而設(shè)計(jì)的,在目的基因mRNA轉(zhuǎn)錄起始端形成穩(wěn)定的RNARNA雙鏈,通過阻礙mRNA和核糖體的結(jié)合而抑制翻譯的起始,它能減少傳統(tǒng)反義寡核苷酸非特異性的效應(yīng),快速誘導(dǎo)蛋白表達(dá)水平的下調(diào)。此分子可應(yīng)用在一些模式生物的研究上,包括小鼠、斑馬魚、Xenopus(一類青蛙)等。2.Morpholino技術(shù)嗎啉基又稱嗎啉(英語:Morpholino),是一種用來修飾基因表現(xiàn)的分子,嗎啉基寡核苷酸是一種反義技術(shù),可用來阻礙其它分子與特定核酸序列的結(jié)合。因此在這個(gè)領(lǐng)域,研究者面臨的最大挑戰(zhàn)就是要尋找更多下游的、對心臟發(fā)育具有特異調(diào)控作用的分子和信號途徑。因此,它們屬于發(fā)育調(diào)控過程中較上游的基因,而非控制心臟發(fā)育所特有的信號途徑。但是從目前的研究成果不難發(fā)現(xiàn),確定和尋找到的這些基因大多數(shù)都屬于發(fā)育生物學(xué)中的經(jīng)典信號途徑,并且這些基因或者信號途徑本身在發(fā)育過程中都具有多重身份,調(diào)節(jié)多個(gè)發(fā)育環(huán)節(jié),甚至調(diào)節(jié)多種器官的發(fā)育。對心臟發(fā)育過程中基因表達(dá)調(diào)控的研究有助于人們找到這些疾病的根源,找到重要的藥物靶標(biāo),指導(dǎo)預(yù)防干預(yù)先天性心臟病發(fā)生或者心血管疾病的治療。而在更晚的階段,后側(cè)的側(cè)板中胚層中則位于Nodal信號途徑的下游,調(diào)節(jié)著心臟的環(huán)化過程。二是在體節(jié)形成階段晚期,BMP信號途徑不再調(diào)節(jié)內(nèi)臟發(fā)育的不對稱性,但是仍然調(diào)節(jié)心臟左右發(fā)育的不對稱性。一是斑馬魚體節(jié)形成階段,在右側(cè)的側(cè)板中胚層區(qū)域BMP4抑制了spw的表達(dá),從而調(diào)節(jié)了內(nèi)臟和心臟的左右不對稱性。在斑馬魚中注射了shh mRNA之后,BMP4的表達(dá)增強(qiáng),同時(shí)心臟的環(huán)化過程就受到了影響。研究發(fā)現(xiàn),如果心臟BMP4 不對稱表達(dá)模式的改變,將會影響心臟的環(huán)化過程。胚胎發(fā)育 20 體節(jié)的時(shí)期(心管融合時(shí)期),BMP4 在心臟區(qū)域就有非常
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