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2025-05-09 12:34 本頁面
【正文】 Outline Regulatory RNAs in Bacteria Discovery of sRNA Target of sRNA Prediction sRNA in Bacillus cereus group Regulatory RNAs in Bacteria Riboswitches CRISPR sRNAs (small RNAs) Riboswitches 位于所調(diào)節(jié)的 mRNA的 5’端 與所調(diào)節(jié)的 mRNA一起轉(zhuǎn)錄 通過改變 RNA的結(jié)構來影響轉(zhuǎn)錄或翻譯 由兩部分組成： aptamer region，結(jié)合配體； expression platform，改變 RNA結(jié)構 能感應氨基酸，核苷酸，金屬離子等小分子，也能感應細胞組分（如特殊的 tRNA），還能感應溫度等環(huán)境因素 Riboswitches的響應配體的作用方式 通過改變 mRNA的結(jié)構影響轉(zhuǎn)錄或翻譯 Waters and Storz ,Cell, 2022 Riboswitches響應溫度的作用方式 低溫時， SD序列與 ASD序列配對形成莖環(huán)結(jié)構，當溫度升高時， 莖環(huán)結(jié)構解開，露出 SD序列 Henkin, Genes Dev., 2022 CRISPR結(jié)構與功能 CAS gene:CRISPRassociated gene 功能多數(shù)未知，但往往具有 DNA 或 RNA結(jié)合 domain，解螺旋酶 Domain，內(nèi)切酶或者外切酶domain Leader sequence：大概 550bp左右 Repeated DNA： 2447bp，重復 2249 次 Spacer： 2672bp Waters and Storz ,Cell, 2022 CRISPR介導的 phage抗性 Sorek et al., Nat. Rev. Microbiol., 2022 sRNA sRNAs that Modulate Protein Activity Cisencoded base pairing sRNA Transencoded base pairing sRNA Extend of sRNA sRNAs that Modulate Protein Activity 大腸桿菌中作用的例子 Waters and Storz ,Cell, 2022 Cisencoded base pairing sRNA 具有獨立的啟動子和轉(zhuǎn)錄終止子，沒有 ORF 一般由目標 mRNA的互補鏈編碼，直接位于 ORF的互補鏈或者 operon的中間 與目標 mRNA某區(qū)域完全配對 目前大部分來源于噬菌體，質(zhì)粒，轉(zhuǎn)座子；在質(zhì)粒中，調(diào)節(jié)復制，分離等； 在轉(zhuǎn)座子中調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)座頻率；在噬菌體中，調(diào)節(jié)溶原與溶解 Brantl, Future Microbiol., 2022 Action menchanism of Cisencoded base pairing sRNA 直接結(jié)合到 RBS區(qū)或者 mRNA中間，引
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