【正文】 3． 關(guān)閉 Tab 頁或者關(guān)閉“ VNC 登錄”頁面時均會關(guān)閉的 VNC 會話。 25 所示。 2． VNC 會話顯示 右側(cè) Tab 頁窗口，用于顯示已經(jīng)打開的 VNC 會話窗口。 初始界面打開界面 如 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 23 會話刪除提示窗口 如果用戶選擇“是”，則所選會話會被刪除；否則，取消刪除操作。 ? 刪除會話 用戶可以選中一個或者多個會話，然后點“刪除會話”按鈕。 22 VNC 打開窗口 注意： 1． 每次只能選擇并打開一個 VNC 會話。 如 圖所示 ， 選中某一個 VNC 會話，然后單擊“打開會話”按鈕，這時系統(tǒng)會打開一個新的“ VNC 打開” Tab 頁來呈現(xiàn)當前選中的 VNC 會話的窗口內(nèi)容。 請參考 “作業(yè)管理”中相同部分的說明 。 “VNC 管理 ”提供了查詢、打開和刪除等管理操作的功能。 19 隊列核心數(shù)限額 ? 最近 30 天歷史作業(yè) 本 Dashboard呈現(xiàn)截止至昨天的前 30天每天完成的作業(yè)數(shù)以及這些作業(yè)占用的 CPU 時間的統(tǒng)計曲線。 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 17所示。 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 15 所示。 節(jié)的名詞解釋。 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 ? 展示區(qū)域 位于“工具欄”下方的右側(cè)部分，用各種 flash 控件用于展示不同 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 29 的作業(yè)調(diào)度統(tǒng)計信息。其中，“自動刷新”按鈕供用戶手動更新 Dashboard的數(shù)據(jù)；“刷新設(shè)置”用于設(shè)置頁面自動刷新時的時間間隔；“自動刷新”勾選框用于控制是 否啟用頁面的“自動刷新”功能。如 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 注意：如果在某些大型作業(yè)的運行過程中發(fā)現(xiàn)無法刪除該作業(yè) ,請以root身份登陸到管理節(jié)點 ,進入 /opt/gridview/pbs 目錄，應(yīng)用命令 ./ JOBID 命令 刪除作業(yè)名稱為 JOBID 的作業(yè)。 11 的 VNC 監(jiān)控界面： 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。掛起狀態(tài)的作業(yè)會暫停執(zhí)行，只能通過恢復(fù)操作來喚醒運行。保留狀態(tài)的作業(yè)不會被調(diào)度執(zhí)行。首先在作業(yè)管理頁面中選擇要控制的一個或多個作業(yè)，然后 單擊 工具欄中的作業(yè)控制按鈕，彈出如 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。其它頁面中的表格設(shè)置也是如此。如果輸入多個查詢條件，則會查詢同時滿足這些條件的作業(yè)。 8 所示的選擇輸入框。 按狀態(tài)查詢?yōu)榫_匹配查詢，其中“不限狀態(tài)”是一個特俗的選項，表示不對作業(yè)狀態(tài)做限制。 圖 錯誤 !文檔中沒有指定樣式的文字。 5 自動刷新間隔設(shè)置 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 24 手動刷新 用戶 單擊 “手動刷新”按鈕則會發(fā)出一次 數(shù)據(jù) 刷新請求。 5所示的對話輸入框。顯示作業(yè)基本信息，包括“作業(yè) ID”、“作業(yè)名”、“集群名稱”、“作業(yè)所有者”、“作業(yè)狀態(tài)”和“創(chuàng)建時間”等字段； 自動刷新 作業(yè)管理頁面提供自動刷新的功能，默認每隔 20s，頁面會自動查詢所選擇集群的作業(yè)信息。 “作業(yè)管理”頁面提供了常用的作業(yè)提交、作業(yè)查詢和作業(yè)控制功能。 MPI Program 選擇本次計算任務(wù)的可執(zhí)行程序。 建議采用默認的 SSH 模式。 目前發(fā)展的版本為 的具體實現(xiàn)為 openmpi、 intelmpi、 mvapich、 mpich 等。該選項默認無需設(shè)置。該選項默認無需設(shè)置。萬一節(jié)點故障導(dǎo)致本次任務(wù)失敗，可以從上次保存斷點的地方恢復(fù)繼續(xù)運算，無需再次從頭開始。 Working DIR 本次計算任務(wù)的工作目錄。 Name 本次計算任務(wù)的名稱，用戶自行決定輸入內(nèi)容。根據(jù)系統(tǒng)的調(diào)度策略， WallTime 較短的任務(wù)將有機會優(yōu)先運行；不過須注意，一旦 WallTime 時間到了而程序尚未運行結(jié)束，本次任務(wù)將被強行終止。隊列狀態(tài)的 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 18 參數(shù)名稱 配置說明 “Charge Rate”一欄表示它們在 ClusQuota 系統(tǒng)中的計費比率，優(yōu)先權(quán)高的工作隊列其計費比率也相應(yīng)要高一些。 ClusQuota Disk Usage 如果部署了 ClusQuota 集群資源配額計費系統(tǒng)，將顯示您目前可用 存儲 配額。提交之后各項值會恢復(fù)成初始值。曙光 Gridview 集群管理軟件的使用可以參考 Gridview 用戶手冊。i++) printf(%d,core[i])。 core[count]=$2}。i++) printf(%d,core[i])。 core[count]=$2}。 count=1。 39。 ` NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc l` qstat f1 $PBS_JOBID | grep exec_host | awk 39。{print $1}39。1 | tee a echo end time is `date` | tee a ? mpich2 示例 MPICH2 腳本： PBS N mpich2 PBS l nodes=1:ppn=8 PBS j oe 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 13 PBS l walltime=2:00:00 cd $PBS_O_WORKDIR echo my job id is $PBS_JOBID | tee echo run nodes is following: | tee a cat $PBS_NODEFILE | tee a echo begin time is `date` | tee a id=`echo $PBS_JOBID|awk F. 39。 并行作業(yè) ? openmpi 并行作業(yè)的腳本以 cpi 為例。 以 gpu 節(jié)點為例： Create and define queue gpu create queue gpu set queue gpu queue_type = Execution 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 9 set queue gpu = 8 set queue gpu = 120:00:00 set queue gpu = gpu set queue gpu max_user_run = 2 set queue gpu enabled = True set queue gpu started = True qmgr c “ set queue gpu acl_users += guest” 添加可使用該隊列的用戶 guest 查詢節(jié)點信息 pestat pestat |more 如下輸出 node state load pmem ncpu mem resi usrs tasks jobids/users a110 busy* 12020 12 12020 4605 4/3 12 8904 hcding a111 busy* 12020 12 12020 4842 3/3 12 8904 hcding a112 free 12020 12 12020 1182 1/1 0 a113 busy* 12020 12 12020 4753 2/2 12 8904 hcding a114 free 12020 12 12020 962 2/2 0 a115 busy* 12020 12 12020 1473 4/3 12 9537 john a116 free 12020 12 12020 1156 3/3 0 a117 busy* 12020 12 12020 5090 3/3 12 8904 hcding a118 free 12020 12 12020 2606 2/2 0 a119 busy* 12020 12 12020 1674 4/3 12 9410 wxxu a120 busy* 12020 12 12020 1616 4/4 12 9410 wxxu a121 excl 12020 12 12020 2034 5/4 12 9503 john a122 free 12020 24 12020 2181 1/1 0 a123 busy* 12020 12 12020 1625 3/3 12 9410 wxxu a124 free 12020 12 12020 2389 2/2 0 a125 busy* 12020 12 12020 1652 4/4 12 9410 wxxu a126 free 12020 12 12020 2442 1/1 0 a127 excl * 12020 12 12020 1898 3/3 12 9503 john a128 free 12020 12 12020 1032 1/1 0 a129 excl 12020 12 12020 1712 3/3 12 9503 john a130 free * 12020 12 12020 3264 5/3 3 8216 wxxu 9187 wxxu 9533 wxxu ……………………………………. ……………………………………. 節(jié)點狀態(tài) excl ：所有 CPU 資源已被占用； busy ： CPU 已接近滿負荷運行； 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（ 北京 ） 有 限公司 10 free ：全部或部分 CPU 空閑； offl ：管理員手動指定離線狀態(tài)； 查詢作業(yè)運行狀態(tài) qstat an |more 如下輸出： mgmt: Req39。{print $1}39。雖然官方推薦使用 mpirun_rsh 方式，但曙光 HPC推薦使用 mpiexec/Hydra 方式。 使用 mpich2 運行并行程序 編譯 MPI 程序 MPICH2 編譯 C、 C++、 Fortran77 和 Fortran90 的編譯器分別為 mpicc,mpicxx,mpif70 和mpif90。 make install 設(shè)置環(huán)境變量腳本： vim /public/software/ !/bin/bash export MPI_HOME=/public/software/mpi/openmpi16intel export PATH=${MPI_HOME}/bin:${PATH} export LD_LIBRARY_PATH=${MPI_HOME}/lib:${LD_LIBRARY_PATH} export MANPATH=${MPI_HOME}/share/man:${MANPATH} ? Tips： 1. OpenMPI 安裝會自動檢測編譯節(jié)點本地可用的通信網(wǎng)絡(luò)設(shè)備，如需支持 InfiniBand 網(wǎng)絡(luò)，請確保編譯 MPI 前該節(jié)點已安裝 OFED 驅(qū)動。 Windows 用戶推薦使用 RealVNC 軟件進行 VNC 遠程圖形界面登錄，登錄時輸入集群登錄節(jié)點 IP 地址加 VNC 會話號即可： Linux 用戶可以直接在 命令行 終端中 執(zhí)行 vncviewer 命令進行登錄，如 ： vncviewer [登錄節(jié)點 IP地址 ]:[session number] Gridview Web 登錄 用戶也可以通過 WEB 方式登入曙光 GridView 集群管理系統(tǒng)， 對集群進行管理、監(jiān)控、配置和使用等操作。推薦使用 SSH Secure Shell Client，它集成了 SFTP 文件上傳下載功能。部署有曙光 Gridview 集群管理系統(tǒng)。 對 文檔 的使用后果，作者丌承擔仸何責仸。 商業(yè) 使用是指 在 商業(yè)活動中或 有 商業(yè)目的 活 動中的使用。若本 文檔 的保密級別 為“內(nèi)部 資料 ”，僅 授權(quán)曙光信息產(chǎn)業(yè) （北京 ） 有 限公司 的 在職員工 使 用。 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（北京）有限公司 1 常州大學 曙光 高性 能 計算 集群用戶手冊 曙光 信息產(chǎn)業(yè) 股份 有 限公司 曙光 信息產(chǎn)業(yè)（北京）有限公司 2 法律條款 1. 對本文檔的仸何使用 均 被視為完全理解并接受本文檔列丼的所有法律條款。 若本 文檔