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dna重組技術(shù)的基本過(guò)程-資料下載頁(yè)

2025-01-08 01:54本頁(yè)面
  

【正文】 要研究或應(yīng)用的基因,也就是將要克隆或表達(dá)的基因或基因的一個(gè)片段。獲取目的基因是分子克隆中最重要的一步。(一)目的基因制備的目的1. 克隆特定的基因或 cDNA;2. 構(gòu)建克隆或表達(dá)載體;3. 構(gòu)建基因文庫(kù):基因組 DNA文庫(kù)和 cDNA文庫(kù)第四節(jié) 重組 DNA技術(shù)的基本過(guò)程 (二)目的基因常用的制備方法 ( 1)從原核基因組 DNA制備-視基因組物理圖譜已知或未知,克隆方法不同。( 2)從真核基因組 DNA制備-染色體步移法( chromosome walking)。( 3)從已克隆的 DNA片段制備-直接酶切回收2. PCR或 RT/PCR方法制備目的基因( 1) 獲取已知基因( 2) 構(gòu)建 RT/PCR文庫(kù)法獲取未知基因: 即利用 GenBank信息,利用不同種屬同源性設(shè)計(jì)引物,嘗試獲取未知基因片段,這有賴于各種計(jì)算機(jī)軟件的應(yīng)用。: 制備基因片段-用 DNA合成儀,對(duì)目的基因分段合成,連接,可以得到所需的目的基因。三、 DNA片斷的重組連接 目的基因和載體 DNA是重組的基本構(gòu)件, DNA片斷的重組連接是目的基因與載體的連接。 獲得目的基因后必須將其放在一定的載體上才能進(jìn)入宿主細(xì)胞擴(kuò)增或表達(dá)。習(xí)慣上將目的基因與載體連接及其后續(xù)的轉(zhuǎn)化過(guò)程稱為 克隆 , 可能是目的基因+載體形成一個(gè)新的 DNA重組分子(新的genotype),后者必然會(huì)產(chǎn)生一個(gè)新的菌體克?。?phenotype)。 限制酶剪切或機(jī)械剪切目的基因或載體可以產(chǎn)生粘端和平端的DNA分子。催化二者重組連接(粘端或平端)反應(yīng)的酶常用 T4DNA ligase。四、重組 DNA( rDNA)導(dǎo)入受體細(xì)胞(一)導(dǎo)入目的 克隆擴(kuò)增克隆表達(dá)受體細(xì)胞( 1)原核細(xì)胞 既可以復(fù)制擴(kuò)增,也可以基因表達(dá)。( 2)真核細(xì)胞 一般只用作基因表達(dá)系統(tǒng)。(二)受體細(xì)胞的基本條件 易接納 rDNA分子;對(duì)載體復(fù)制擴(kuò)增無(wú)嚴(yán)格限制;不降解;不修飾外源 DNA分子。(三)轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)染 ( transformation/transfection) rDNA導(dǎo)入原核細(xì)胞的過(guò)程稱轉(zhuǎn)化,導(dǎo)入真核稱轉(zhuǎn)染。(四) rDNA導(dǎo)入受體細(xì)胞方法舉例方法方法 原理概要原理概要 備注備注1. 重組質(zhì)粒重組質(zhì)粒DNA導(dǎo)入導(dǎo)入 (1) 低溫低溫 CaCl2(冰?。┨幚恚ū。┨幚?Ecoli,使成,使成 為感受態(tài)細(xì)胞。為感受態(tài)細(xì)胞。 (2)rDNA與受體菌混合-與受體菌混合- 冰?。。?42℃℃ 熱熱休克-休克- 即可使即可使 rDNA進(jìn)入進(jìn)入 Ecoli。 (3) 接種于含抗生素平皿中轉(zhuǎn)化-接種于含抗生素平皿中轉(zhuǎn)化- 篩選篩選(( 1)) pent cells具有攝取具有攝取外源外源 DNA能力的細(xì)胞。能力的細(xì)胞。(( 2)高頻電流電穿孔法()高頻電流電穿孔法(elecroporation)能使外源)能使外源DNA進(jìn)入進(jìn)入 Ecoli。2. λphage--rDNA分子導(dǎo)入分子導(dǎo)入Ecoli(1)包裝包裝 使使 λphageDNA重組重組 DNA獲得感染獲得感染E. coli能力能力(2)接種合適的平皿上進(jìn)行培養(yǎng),溶菌生長(zhǎng)接種合適的平皿上進(jìn)行培養(yǎng),溶菌生長(zhǎng)皿上可見(jiàn)清亮的噬菌斑,溶源有一部溶菌皿上可見(jiàn)清亮的噬菌斑,溶源有一部溶菌,溶菌斑是混濁的,溶菌斑是混濁的(1)λ噬菌體感染噬菌體感染 E. coli只注入只注入核酸核酸(2)含含 λ噬菌體頭、尾部蛋白已噬菌體頭、尾部蛋白已商品化,包裝商品化,包裝 rDNA使之獲得使之獲得感染感染 E. coli能力能力(3)溶菌:產(chǎn)生子代溶菌:產(chǎn)生子代 λ噬菌體;噬菌體;溶源:不產(chǎn)生子代。溶源:不產(chǎn)生子代。 E coli(1)酶切酶切 cosmid和部分真核和部分真核 DNA并連接二者并連接二者成成 rDNA(2)包裝噬菌體成噬菌體顆粒感染包裝噬菌體成噬菌體顆粒感染 E. coli(3)用抗生素抗性標(biāo)記篩選用抗生素抗性標(biāo)記篩選 rDNA噬菌體噬菌體 2個(gè)尾巴+質(zhì)粒即個(gè)尾巴+質(zhì)粒即cosmid(粘尾質(zhì)粒)。(粘尾質(zhì)粒)。五、轉(zhuǎn)化菌的篩選(一) λ噬菌感染 E. coli可以溶菌生長(zhǎng),形成很亮的噬菌斑, 溶源生長(zhǎng)多少也有溶菌,形成噬菌斑挑選噬菌斑即可分析鑒定轉(zhuǎn)化子。 (二)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化 E. coli, 可用含抗生素的平板篩選,挑選陽(yáng)性克隆分析鑒定轉(zhuǎn)化子。六、 DNA重組體的篩選 轉(zhuǎn)化子不一定就是重組子。(一) α-互補(bǔ): 藍(lán)白菌落篩選或稱 Xgal篩選(二) 插入失活: 適用于帶有抗生素抗性標(biāo)記基因的克隆載體( 三) 雜交篩選(四)質(zhì)粒小量快速提取加酶切鑒定 乳糖操縱子的天然誘導(dǎo)物是乳糖。乳糖類似物異丙基 βD 硫代半乳糖苷( IPTG)有更強(qiáng)的誘導(dǎo)作用。 IPTG配合使用在基因工程可作藍(lán)白斑篩選。 LacZ基因編碼的乳糖苷酶 Xgal 藍(lán)色吲哚產(chǎn)物(5溴 4氯 3吲哚 αD半乳糖苷 ) 藍(lán)白斑試驗(yàn)( IPTG,Xgal 試驗(yàn) )XgalLac Z藍(lán)色化合物Xgal( LacZ基因 N端序列) 插入片段( LacZ基因失活)LacZ基因 N端序列LacZ酶pUC19APCAI和 pBR325APOAI質(zhì)粒 PNA及其 EcoRI酶切產(chǎn)物的瓊脂糖電泳圖EcoRIpBR325APOAIpUC19APOAI加樣孔 pUC19方法方法 優(yōu)點(diǎn)優(yōu)點(diǎn) 缺點(diǎn)缺點(diǎn) 選擇順序選擇順序 互補(bǔ)互補(bǔ) 簡(jiǎn)潔而行簡(jiǎn)潔而行 試劑貴試劑貴 ,受材料限制受材料限制 有錢首選有錢首選 方便易行方便易行 費(fèi)時(shí)費(fèi)力費(fèi)時(shí)費(fèi)力 無(wú)錢首選無(wú)錢首選 易行易行 受材料局限受材料局限 可選可選 經(jīng)典靈敏經(jīng)典靈敏 放標(biāo)放標(biāo) /非放標(biāo)非放標(biāo) 可選可選四種 DNA重組子篩選方法的比較 七、 DNA重組體的鑒定 外源 DNA片斷是否插入載體構(gòu)成重組 DNA分子,而插入片斷大小 ,是否突變及插入位置 ,順序及方向則關(guān)系到構(gòu)建載體是否擴(kuò)增 ,我們所需要的基因或表達(dá) ,表達(dá)相應(yīng)的產(chǎn)品 .所以需要進(jìn)一步鑒定 DNA重組體。(一)酶切鑒定是必需的(二)若構(gòu)建 DNA重組體是為了克隆某個(gè)基因 ,可進(jìn)行在序列測(cè)定。(三)若構(gòu)建表達(dá)載體 ,可進(jìn)行表達(dá)產(chǎn)物鑒定演講完畢,謝謝觀看!
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