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ngs測(cè)序技術(shù)與分析流程圖-資料下載頁

2025-08-05 00:40本頁面

　　

【正文】 cDNA 選擇適當(dāng)長(zhǎng)度 cDNA進(jìn)行擴(kuò)增純化擴(kuò)增產(chǎn)物，評(píng)估產(chǎn)量上機(jī)進(jìn)行高通量測(cè)序轉(zhuǎn)錄組主要分析內(nèi)容無參考序列轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容有參考序列轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容 1 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)，數(shù)據(jù)成分和質(zhì)量評(píng)估； 2 Contig及 Scaffold長(zhǎng)度分布 3 Unigene的長(zhǎng)度分布和功能注釋， GO分類， Pathway分析，差異表達(dá)分析 4 蛋白功能預(yù)測(cè)與分類，差異表達(dá)基因 GO富集和 Pathway富集分析。 1 基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，比對(duì)參考序列 2 序列在基因組上在分布 3 測(cè)序深度分析、隨機(jī)性評(píng)估和基因差異表達(dá) 分析 4 新基因預(yù)測(cè)，基因可變剪接鑒定和基因融合鑒定等。小 RNA測(cè)序果蠅三種組織中 MiRNA表達(dá)情況 MiRNA表達(dá)模式分析新 miRNA預(yù)測(cè) miRNA編輯情況分析與統(tǒng)計(jì) 分析軟件介紹 ? 質(zhì)量控制軟件 (Quality Control) ? 定位軟件 (Mapping the reads) ? 已知基因（差異）表達(dá)評(píng)估軟件 (Differential Expression) ? 新基因鑒定軟件 (New gene identification) ? 可視化展示軟件 (Virsulization) ? 基因功能注釋軟件 (GO term or KEGG pathway analysis) 數(shù)據(jù)格式示例 Fastq 格式 Color Space 格式 Phred score 質(zhì)量控制利用 galaxy進(jìn)行原始數(shù)據(jù)處理 Galaxy History 39。 VGN FASTQ39。知識(shí)回顧Knowledge Review 謝謝！放映結(jié)束感謝各位的批評(píng)指導(dǎo)！讓我們共同進(jìn)步

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